More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2443 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009080  BMA10247_1570  ABC transporter, permease protein  88.03 
 
 		 585 aa  1039    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0850001  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4538  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.07 
 
 		 577 aa  667    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.641004 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 585 aa  1167    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81894  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5551  ABC transporter, permease protein  60.92 
 
 		 584 aa  649    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0754  ABC transporter, permease protein  88.03 
 
 		 585 aa  1039    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.24 
 
 		 582 aa  726    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5091  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  58.65 
 
 		 584 aa  654    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3027  ABC transporter, permease protein  88.03 
 
 		 585 aa  1039    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0469117  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5498  ABC-type anion transport system, duplicated permease component  61.32 
 
 		 556 aa  680    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2156  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  84.27 
 
 		 584 aa  972    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.856816  hitchhiker  0.00000224525 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1256  ABC transporter, permease protein  88.03 
 
 		 585 aa  1039    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7488  ABC transporter permease  61.84 
 
 		 577 aa  714    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.124133 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0270  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.72 
 
 		 582 aa  655    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.371036  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5725  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  95.56 
 
 		 585 aa  1125    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0971  ABC anion transporter, fused inner membrane subunits  86.2 
 
 		 583 aa  1017    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  84.14 
 
 		 583 aa  998    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0820586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.25 
 
 		 578 aa  637    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.294522 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4605  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  85.81 
 
 		 584 aa  1016    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.242403 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0622  ABC transporter, permease protein  60.11 
 
 		 577 aa  645    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.974314  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0896  ABC transporter, permease protein  88.38 
 
 		 585 aa  1056    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1103  ABC transporter, permease protein  88.03 
 
 		 585 aa  1039    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.790132  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  97.44 
 
 		 585 aa  1140    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.139086  normal  0.0182448 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1098  ABC transporter, permease protein  88.03 
 
 		 585 aa  1039    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5526  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  86.5 
 
 		 584 aa  1030    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.775381  normal  0.572944 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3383  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  85.17 
 
 		 583 aa  989    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.797393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3466  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.07 
 
 		 577 aa  667    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.222584 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0892  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  91.28 
 
 		 584 aa  1076    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0183914 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  97.44 
 
 		 585 aa  1140    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  86.5 
 
 		 584 aa  1030    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.77824  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7462  ABC transporter permease  60.04 
 
 		 585 aa  645    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.900156 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.4 
 
 		 578 aa  668    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2443  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 585 aa  1167    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343058  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4140  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  85.81 
 
 		 584 aa  1020    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.406581 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  97.44 
 
 		 585 aa  1140    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0891298  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  86.5 
 
 		 584 aa  1030    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.247948 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.93 
 
 		 602 aa  635    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.170409 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1455  ABC transporter permease  61.48 
 
 		 585 aa  697    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  85.17 
 
 		 583 aa  993    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0997  ABC transporter, permease protein  87.86 
 
 		 585 aa  1035    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1825  putative nitrate transport system permease protein  59.08 
 
 		 584 aa  629  1e-179  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.08 
 
 		 584 aa  628  1e-179  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0759  ABC transporter, permease protein  59.78 
 
 		 577 aa  625  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0431  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.65 
 
 		 578 aa  622  1e-177  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0935  putative transmembrane transporter  59.6 
 
 		 576 aa  623  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0770  ABC transporter, permease protein  59.6 
 
 		 577 aa  623  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0524  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  56.36 
 
 		 579 aa  620  1e-176  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6181  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.56 
 
 		 577 aa  615  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.247341  normal  0.752378 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5923  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.08 
 
 		 600 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.904436  normal  0.911733 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0112  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.91 
 
 		 578 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3371  putative transmembrane ABC transporter protein  54.31 
 
 		 586 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3030  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  54.32 
 
 		 584 aa  600  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.374129  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0135  hypothetical protein  51.2 
 
 		 579 aa  597  1e-169  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0120  hypothetical protein  51.2 
 
 		 579 aa  597  1e-169  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2950  ABC transporter, permease protein  56.31 
 
 		 538 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1967  ABC transporter, permease protein  52.38 
 
 		 581 aa  579  1e-164  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.31 
 
 		 594 aa  579  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0234  ABC transporter permease protein  52.38 
 
 		 581 aa  578  1.0000000000000001e-163  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.198469  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3185  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.53 
 
 		 581 aa  576  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.583197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.13 
 
 		 594 aa  578  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.3 
 
 		 577 aa  565  1.0000000000000001e-159  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3546  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.9 
 
 		 575 aa  540  9.999999999999999e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0346  ABC transporter, permease protein  46.47 
 
 		 582 aa  477  1e-133  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3324  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.7 
 
 		 588 aa  474  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.43 
 
 		 572 aa  463  1e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.270543  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0165  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.58 
 
 		 574 aa  407  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.336199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.27 
 
 		 581 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.477962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.24 
 
 		 583 aa  390  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.807719  hitchhiker  0.00198291 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.64 
 
 		 576 aa  381  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.759355 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.04 
 
 		 578 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.035099  normal  0.978203 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3819  ABC transporter, inner membrane subunit  42.86 
 
 		 579 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0769  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.28 
 
 		 570 aa  354  2.9999999999999997e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0405  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.08 
 
 		 573 aa  310  5e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00121566  decreased coverage  0.00950402 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3497  hypothetical protein  52.16 
 
 		 671 aa  286  9e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.65 
 
 		 670 aa  270  5e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0109  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.13 
 
 		 671 aa  266  1e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.47 
 
 		 671 aa  254  3e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.32204 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0283  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.1 
 
 		 468 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.18 
 
 		 553 aa  154  5.9999999999999996e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.14778  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.71 
 
 		 536 aa  152  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.44 
 
 		 497 aa  151  4e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1376  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.2 
 
 		 538 aa  137  8e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.856839  hitchhiker  0.00160873 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0678  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.95 
 
 		 453 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.105704 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.52 
 
 		 459 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.73 
 
 		 458 aa  106  1e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1026  nitrate transport permease  27.89 
 
 		 279 aa  66.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3675  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  26.86 
 
 		 280 aa  65.1  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3729  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  26.86 
 
 		 280 aa  65.1  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0184404  normal  0.11569 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4458  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  25.4 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.698055  normal  0.534513 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4395  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  25.4 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02150  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  27.62 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1489  nitrate transport permease  29.03 
 
 		 278 aa  62  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29 
 
 		 269 aa  61.6  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4924  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  27.66 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.815767 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2012  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.3 
 
 		 280 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.338733  normal  0.193625 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1704  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  26.49 
 
 		 311 aa  59.7  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0823  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.06 
 
 		 280 aa  60.1  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.54971  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3526  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  25.79 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.471487 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0358  ABC-type proline/glycine betaine transport system, permease component  25 
 
 		 571 aa  58.2  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.963399  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8275  ABC-type transporter, permease protein  28.57 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1982  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  27.86 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.187248  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>