More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_02150 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_02150  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  100 
 
 		 244 aa  474  1e-133  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2658  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.96 
 
 		 251 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000111568  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.4 
 
 		 245 aa  204  7e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.69 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2281  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.15 
 
 		 248 aa  198  7.999999999999999e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535744  unclonable  0.00000000025197 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0099  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.21 
 
 		 253 aa  191  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.6 
 
 		 247 aa  177  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1381  ABC transporter, permease protein  37.89 
 
 		 249 aa  135  4e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.012073 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0466  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.9 
 
 		 262 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5801  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.16 
 
 		 290 aa  122  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.98 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.577279 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3058  taurine ABC transporter, permease protein  33.7 
 
 		 274 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3060  taurine ABC transporter, permease protein  33.7 
 
 		 274 aa  119  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244271  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.32 
 
 		 273 aa  119  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.32 
 
 		 273 aa  119  6e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 		 273 aa  118  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2748  sulfonate/taurine ABC transporter permease  33.7 
 
 		 274 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947189  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1369  ABC transporter membrane protein  30.04 
 
 		 272 aa  117  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1604  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.12 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.60148  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.51 
 
 		 257 aa  115  7.999999999999999e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0233  ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 241 aa  115  8.999999999999998e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 		 276 aa  113  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.374556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.79 
 
 		 273 aa  112  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.95 
 
 		 289 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.98 
 
 		 257 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2152  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.18 
 
 		 271 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.65 
 
 		 259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.832577  normal  0.34867 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0673  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.68 
 
 		 275 aa  108  9.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0666321  normal  0.331074 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 		 298 aa  108  9.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.30367  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0649738  hitchhiker  0.00238236 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2566  ABC transporter, membrane subunit  32.98 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2012  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.5 
 
 		 280 aa  106  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.338733  normal  0.193625 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.15 
 
 		 279 aa  106  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.208956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.25 
 
 		 269 aa  106  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.406887  normal  0.454808 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.46 
 
 		 287 aa  106  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0773955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3065  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.16 
 
 		 280 aa  105  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1188  taurine ABC transporter, permease protein  31.69 
 
 		 250 aa  105  6e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0612406  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1580  taurine ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 253 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.477521  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0620  permease component of taurine ABC transporter  33.33 
 
 		 253 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00192231  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2133  taurine ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 283 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8275  ABC-type transporter, permease protein  32.39 
 
 		 272 aa  105  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0055  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  28.57 
 
 		 256 aa  105  6e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  30.93 
 
 		 279 aa  105  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2019  taurine ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 285 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.484134  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0697  taurine ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 283 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2220  taurine ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 283 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215273  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.11 
 
 		 267 aa  105  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0467  taurine ABC transporter, permease protein, putative  29.3 
 
 		 272 aa  104  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0406  putative taurine ABC transporter, permease protein  29.3 
 
 		 272 aa  104  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.47 
 
 		 275 aa  104  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1171  taurine ABC transporter permease  32.63 
 
 		 272 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.104716  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2719  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.61 
 
 		 284 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18130  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  31.12 
 
 		 283 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6545  ABC transporter permease  32.11 
 
 		 269 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.276106 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1848  ABC transporter permease  30.92 
 
 		 273 aa  102  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.92 
 
 		 273 aa  102  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4214  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.53 
 
 		 281 aa  102  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0802  taurine ABC transporter, permease protein  31.22 
 
 		 283 aa  102  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207449  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5321  taurine ABC transporter, permease protein  30.73 
 
 		 285 aa  102  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0761  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.64 
 
 		 412 aa  102  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.65 
 
 		 259 aa  102  8e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0260  taurine transporter subunit  31.49 
 
 		 284 aa  101  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3693  taurine transporter subunit  31.49 
 
 		 284 aa  101  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3936  taurine transporter subunit  31.49 
 
 		 284 aa  101  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.28 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.51 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185051 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7502  ABC transporter permease  30.16 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.50681 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00317  taurine transporter subunit  33.05 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1200  transmembrane permease ABC transporter protein  31.73 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.441856  normal  0.826922 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00321  hypothetical protein  33.05 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2103  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.41 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153016  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4930  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.53 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.22 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3261  taurine transporter subunit  33.05 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.52 
 
 		 283 aa  100  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.94 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0243564  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.07 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.57 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.582448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1704  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  26.97 
 
 		 311 aa  99.8  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12960  taurine ABC transporter permease  35.95 
 
 		 272 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299757  normal  0.321121 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0877  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.5 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112184  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0924  ABC transporter permease protein  27.93 
 
 		 258 aa  99.8  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2676  putative ABC transporter, permease protein  29.96 
 
 		 258 aa  99.4  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.931281  normal  0.413503 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2355  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  31.25 
 
 		 274 aa  99.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214574  normal  0.0382396 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.21 
 
 		 279 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0570948  normal  0.0921514 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.04 
 
 		 259 aa  99.8  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.947992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.05 
 
 		 296 aa  99.4  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159688 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0809  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.18 
 
 		 277 aa  99.4  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00650739  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0431  taurine transporter subunit  32.63 
 
 		 275 aa  99  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.08 
 
 		 314 aa  98.6  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.11 
 
 		 277 aa  99  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.854714  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1692  putative ABC transporter membrane protein  31.46 
 
 		 281 aa  98.6  8e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3747  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.61 
 
 		 254 aa  98.6  8e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.26 
 
 		 277 aa  98.6  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0887356  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.66 
 
 		 266 aa  98.6  8e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0620  taurine transport system permease protein TauC  27.08 
 
 		 245 aa  98.6  8e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00071484  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2085  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.35 
 
 		 319 aa  98.6  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0787698 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0391  taurine transporter subunit  32.63 
 
 		 275 aa  98.2  9e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3034  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.82 
 
 		 269 aa  98.2  9e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>