More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2780 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 252 aa  499  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2658  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.45 
 
 		 251 aa  301  5.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000111568  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2281  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.19 
 
 		 248 aa  234  7e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535744  unclonable  0.00000000025197 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02150  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  44.81 
 
 		 244 aa  221  6e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.97 
 
 		 247 aa  208  8e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0099  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  46.83 
 
 		 253 aa  201  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.59 
 
 		 245 aa  201  9.999999999999999e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1381  ABC transporter, permease protein  39.73 
 
 		 249 aa  152  7e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.012073 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  34.55 
 
 		 279 aa  134  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2935  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.47 
 
 		 252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5801  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.5 
 
 		 290 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5321  taurine ABC transporter, permease protein  34.56 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1171  taurine ABC transporter permease  34.17 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.104716  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.68 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3936  taurine transporter subunit  32.51 
 
 		 284 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3693  taurine transporter subunit  32.51 
 
 		 284 aa  127  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0260  taurine transporter subunit  32.51 
 
 		 284 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.46 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185051 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.18 
 
 		 279 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0570948  normal  0.0921514 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12960  taurine ABC transporter permease  39.51 
 
 		 272 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299757  normal  0.321121 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2535  putative taurine ABC transporter, permease protein  31.91 
 
 		 282 aa  123  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254862  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.75 
 
 		 279 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.02 
 
 		 273 aa  123  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.33 
 
 		 279 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.588836 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.96 
 
 		 273 aa  121  9e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.96 
 
 		 273 aa  121  9e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00317  taurine transporter subunit  31.91 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00321  hypothetical protein  31.91 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3261  taurine transporter subunit  31.91 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0442  taurine transporter subunit  32.3 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3058  taurine ABC transporter, permease protein  30.36 
 
 		 274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3240  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.3 
 
 		 275 aa  120  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0391  taurine transporter subunit  31.91 
 
 		 275 aa  119  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0431  taurine transporter subunit  31.91 
 
 		 275 aa  119  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.32 
 
 		 279 aa  118  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.8 
 
 		 273 aa  118  7.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2748  sulfonate/taurine ABC transporter permease  30.73 
 
 		 274 aa  118  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947189  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3060  taurine ABC transporter, permease protein  30.24 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244271  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.31 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.577279 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1974  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.24 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000226251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.47 
 
 		 274 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1848  ABC transporter permease  29.28 
 
 		 273 aa  116  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0280  taurine transporter subunit  31.52 
 
 		 275 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.28 
 
 		 273 aa  116  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.39 
 
 		 273 aa  115  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0466  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.62 
 
 		 262 aa  115  6e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0467  taurine ABC transporter, permease protein, putative  31.92 
 
 		 272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0406  putative taurine ABC transporter, permease protein  31.92 
 
 		 272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.85 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.21 
 
 		 256 aa  113  4.0000000000000004e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.34 
 
 		 266 aa  112  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3747  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.79 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0208  nitrate ABC transporter, permease protein, putative  31.48 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.473726 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2019  taurine ABC transporter, permease protein  33.16 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.484134  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2220  taurine ABC transporter, permease protein  33.16 
 
 		 283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215273  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0620  permease component of taurine ABC transporter  33.16 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00192231  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.98 
 
 		 295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0840  taurine transporter subunit  35.9 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0396  taurine transporter subunit  32.68 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1604  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.67 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.60148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2133  taurine ABC transporter, permease protein  33.16 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1580  taurine ABC transporter, permease protein  33.16 
 
 		 253 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.477521  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0697  taurine ABC transporter, permease protein  33.16 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1488  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.99 
 
 		 280 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.106569  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.73 
 
 		 279 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2152  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.93 
 
 		 271 aa  109  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.68 
 
 		 257 aa  109  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2012  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.41 
 
 		 280 aa  108  6e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.338733  normal  0.193625 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2719  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.66 
 
 		 284 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.75 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.19 
 
 		 279 aa  107  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.208956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.14 
 
 		 257 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.31 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.582448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.23 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2630  sulfonate ABC transporter, permease protein, putative  32.6 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.312135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1470  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.56 
 
 		 301 aa  106  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2479  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.51 
 
 		 258 aa  106  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0802  taurine ABC transporter, permease protein  32.12 
 
 		 283 aa  106  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207449  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0159  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.77 
 
 		 253 aa  106  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0164  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.77 
 
 		 253 aa  106  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.49 
 
 		 255 aa  105  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.56 
 
 		 291 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1975  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.56 
 
 		 291 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.690359  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.97 
 
 		 305 aa  105  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.49 
 
 		 285 aa  105  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.987071 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2676  putative ABC transporter, permease protein  33.5 
 
 		 258 aa  105  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.931281  normal  0.413503 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.04 
 
 		 254 aa  105  8e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0747147  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.96 
 
 		 275 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.34 
 
 		 281 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1188  taurine ABC transporter, permease protein  29.2 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0612406  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.95 
 
 		 277 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0887356  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.75 
 
 		 277 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.854714  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16930  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  31.2 
 
 		 322 aa  103  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.327  normal  0.410158 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5126  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.16 
 
 		 280 aa  103  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.45 
 
 		 288 aa  102  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  hitchhiker  0.00645779 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1900  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.96 
 
 		 252 aa  102  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.128113  hitchhiker  0.000000000000910228 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0761  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.26 
 
 		 412 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6360  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  29.41 
 
 		 267 aa  102  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.821284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.97 
 
 		 294 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.106321 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.41 
 
 		 266 aa  102  7e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>