More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1604 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1604  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
240 aa  471  1e-132  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.60148  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02150  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  31.12 
 
 
244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2281  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.89 
 
 
248 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535744  unclonable  0.00000000025197 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0099  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.33 
 
 
253 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2658  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.17 
 
 
251 aa  105  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000111568  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.58 
 
 
252 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.8 
 
 
245 aa  99.8  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
247 aa  99.4  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1381  ABC transporter, permease protein  30.15 
 
 
249 aa  95.1  9e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.012073 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6545  ABC transporter permease  30.93 
 
 
269 aa  93.6  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.276106 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.34 
 
 
255 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.185051 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0735  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  28.35 
 
 
273 aa  92.4  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.714635  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.38 
 
 
283 aa  92.4  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0441349  normal  0.902161 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.66 
 
 
256 aa  90.5  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0614  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.18 
 
 
250 aa  86.3  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.61 
 
 
288 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  hitchhiker  0.00645779 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0877  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.98 
 
 
260 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112184  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3295  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.56 
 
 
279 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  30.92 
 
 
279 aa  83.6  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.5 
 
 
268 aa  83.6  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.333865  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.15 
 
 
288 aa  84  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.54 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1031  sulfonate ABC transporter, permease protein  27.27 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2677  putative ABC transporter, permease protein  32.72 
 
 
255 aa  83.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.58951 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0981  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  32.13 
 
 
279 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
254 aa  82.8  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.302994  normal  0.157809 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1580  taurine ABC transporter, permease protein  31.68 
 
 
253 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.477521  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0802  taurine ABC transporter, permease protein  32.18 
 
 
283 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207449  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.93 
 
 
266 aa  82  0.000000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2133  taurine ABC transporter, permease protein  31.68 
 
 
283 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0697  taurine ABC transporter, permease protein  31.68 
 
 
283 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0620  permease component of taurine ABC transporter  31.68 
 
 
253 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00192231  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.38 
 
 
278 aa  82  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0649738  hitchhiker  0.00238236 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2019  taurine ABC transporter, permease protein  31.68 
 
 
285 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.484134  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2220  taurine ABC transporter, permease protein  31.68 
 
 
283 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215273  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0797  ABC transporter, permease protein, putative  32.91 
 
 
250 aa  81.6  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7502  ABC transporter permease  28.51 
 
 
256 aa  81.6  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.50681 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3034  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.08 
 
 
269 aa  80.9  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.31 
 
 
281 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.98 
 
 
283 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0881  putative ABC transporter, permease protein  32.49 
 
 
251 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00328051  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.83 
 
 
259 aa  80.9  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657833 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1704  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  29.41 
 
 
311 aa  80.9  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.47 
 
 
239 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.34 
 
 
292 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.367955 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0391  taurine transporter subunit  35.62 
 
 
275 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0431  taurine transporter subunit  35.62 
 
 
275 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3693  taurine transporter subunit  30.96 
 
 
284 aa  79.7  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0666  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.76 
 
 
271 aa  80.1  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0784  putative ABC transporter, permease protein  32.49 
 
 
250 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.605831  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0260  taurine transporter subunit  30.96 
 
 
284 aa  79.7  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3936  taurine transporter subunit  30.96 
 
 
284 aa  79.7  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19510  ABC transporter permease  33.48 
 
 
274 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4547  putative ABC transporter, permease protein  32.07 
 
 
251 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.113137  normal  0.441246 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.49 
 
 
251 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0804  putative ABC transporter, permease protein  31.65 
 
 
250 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22036e-46 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.85 
 
 
272 aa  78.6  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.334714  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0693  ABC transporter permease  31.65 
 
 
250 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0727  ABC transporter permease  31.65 
 
 
250 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0363276  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.51 
 
 
255 aa  78.6  0.00000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.323499  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.76 
 
 
259 aa  78.6  0.00000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.318112 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00317  taurine transporter subunit  35 
 
 
275 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2304  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.27 
 
 
278 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.37818 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0637  ABC transporter, permease  31.65 
 
 
250 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0637  ABC transporter, permease  31.22 
 
 
250 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2515  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.63 
 
 
282 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.313862  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18130  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  30.13 
 
 
283 aa  78.2  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1679  ABC transporter permease  33.48 
 
 
274 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.451747  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0488  putative binding protein-dependent transport system, membrane component  32.19 
 
 
272 aa  78.2  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.970837  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.25 
 
 
259 aa  77.8  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.805205  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.99 
 
 
252 aa  77.8  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0467336 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.66 
 
 
280 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615395  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3261  taurine transporter subunit  35 
 
 
275 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.62 
 
 
267 aa  78.2  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.549296  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.96 
 
 
255 aa  78.2  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0442  taurine transporter subunit  35 
 
 
275 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00321  hypothetical protein  35 
 
 
275 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0213  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.54 
 
 
252 aa  77  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.86 
 
 
275 aa  77  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.5 
 
 
268 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80309  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.18 
 
 
314 aa  77.4  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1171  taurine ABC transporter permease  31.76 
 
 
272 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.104716  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3606  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25 
 
 
257 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.2 
 
 
269 aa  77  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.406887  normal  0.454808 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.58 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.208956  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.69 
 
 
294 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.106321 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3240  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
275 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2787  ABC transporter, permease protein  29.55 
 
 
282 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0328614  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0280  taurine transporter subunit  35 
 
 
275 aa  76.3  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.81 
 
 
258 aa  75.9  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0347556  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2638  ABC sulfonate transporter, inner membrane subunit  30.64 
 
 
279 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0950643  hitchhiker  0.0000361652 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.63 
 
 
279 aa  75.9  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.30868 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.34 
 
 
276 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12960  taurine ABC transporter permease  37.27 
 
 
272 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299757  normal  0.321121 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.73 
 
 
257 aa  75.5  0.0000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3181  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.88 
 
 
277 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0283642  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.64 
 
 
254 aa  75.5  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.63161  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0840  taurine transporter subunit  30.22 
 
 
275 aa  75.5  0.0000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.44 
 
 
279 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1369  ABC transporter membrane protein  28.03 
 
 
272 aa  74.7  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0458182 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>