More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2281 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2281  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
248 aa  485  1e-136  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535744  unclonable  0.00000000025197 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2658  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.79 
 
 
251 aa  248  9e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000111568  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.07 
 
 
252 aa  226  3e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
245 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02150  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  46.15 
 
 
244 aa  209  3e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0099  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  50 
 
 
253 aa  205  4e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.95 
 
 
247 aa  194  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1381  ABC transporter, permease protein  33.94 
 
 
249 aa  146  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.012073 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.15 
 
 
273 aa  137  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.17 
 
 
279 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.52 
 
 
273 aa  135  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.52 
 
 
273 aa  135  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.19 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.588836 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5321  taurine ABC transporter, permease protein  33.48 
 
 
285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.38 
 
 
273 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.86 
 
 
273 aa  129  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1848  ABC transporter permease  33.86 
 
 
273 aa  129  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3160  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.75 
 
 
274 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.913146  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.11 
 
 
274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.77 
 
 
279 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0570948  normal  0.0921514 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1171  taurine ABC transporter permease  33.79 
 
 
272 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.104716  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2085  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.64 
 
 
319 aa  123  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0787698 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5801  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.54 
 
 
290 aa  122  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0802  taurine ABC transporter, permease protein  29.2 
 
 
283 aa  122  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207449  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0697  taurine ABC transporter, permease protein  30.14 
 
 
283 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2133  taurine ABC transporter, permease protein  30.14 
 
 
283 aa  122  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1580  taurine ABC transporter, permease protein  30.14 
 
 
253 aa  121  8e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.477521  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2019  taurine ABC transporter, permease protein  30.14 
 
 
285 aa  121  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.484134  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0620  permease component of taurine ABC transporter  30.14 
 
 
253 aa  121  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00192231  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  29.88 
 
 
279 aa  121  9e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2220  taurine ABC transporter, permease protein  31.63 
 
 
283 aa  121  9e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215273  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2676  putative ABC transporter, permease protein  33.04 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.931281  normal  0.413503 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12960  taurine ABC transporter permease  33.79 
 
 
272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299757  normal  0.321121 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0208  nitrate ABC transporter, permease protein, putative  33.33 
 
 
260 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.473726 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.95 
 
 
273 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2152  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.02 
 
 
271 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
279 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796344  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3693  taurine transporter subunit  30.8 
 
 
284 aa  119  6e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0260  taurine transporter subunit  30.8 
 
 
284 aa  119  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1604  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.15 
 
 
240 aa  119  6e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.60148  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3936  taurine transporter subunit  30.8 
 
 
284 aa  119  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1473  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.61 
 
 
306 aa  118  7e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0411979  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.58 
 
 
255 aa  118  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.185051 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.76 
 
 
283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.67 
 
 
266 aa  116  3e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
275 aa  116  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0877464 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.02 
 
 
275 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3058  taurine ABC transporter, permease protein  30.53 
 
 
274 aa  115  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4930  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.33 
 
 
267 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0442  taurine transporter subunit  31.82 
 
 
275 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.18 
 
 
254 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00317  taurine transporter subunit  31.82 
 
 
275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3261  taurine transporter subunit  31.82 
 
 
275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00321  hypothetical protein  31.82 
 
 
275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2012  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.96 
 
 
280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.338733  normal  0.193625 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2935  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.95 
 
 
252 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0391  taurine transporter subunit  31.4 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.49 
 
 
289 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2748  sulfonate/taurine ABC transporter permease  31.34 
 
 
274 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947189  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.99 
 
 
279 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.208956  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3240  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.54 
 
 
275 aa  112  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3505  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.92 
 
 
275 aa  112  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.197989  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.2 
 
 
252 aa  112  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799696  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3060  taurine ABC transporter, permease protein  31.02 
 
 
274 aa  112  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244271  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0431  taurine transporter subunit  30.96 
 
 
275 aa  112  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.27 
 
 
277 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.854714  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3750  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  33.65 
 
 
269 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.9 
 
 
295 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2712  sulfonate ABC transporter permease  34.5 
 
 
282 aa  111  9e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2920  sulfonate ABC transporter permease protein  34.5 
 
 
282 aa  111  9e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1453  alkanesulfonate transporter permease subunit  28.76 
 
 
263 aa  111  9e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.49 
 
 
283 aa  111  9e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.39 
 
 
254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0747147  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6203  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.24 
 
 
284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.780444  normal  0.280504 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32 
 
 
269 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.406887  normal  0.454808 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0466  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.35 
 
 
262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.65 
 
 
269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.09 
 
 
256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2376  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  29.66 
 
 
265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0467  taurine ABC transporter, permease protein, putative  31.16 
 
 
272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.64 
 
 
275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0406  putative taurine ABC transporter, permease protein  31.16 
 
 
272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.27 
 
 
277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0887356  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0840  taurine transporter subunit  31.44 
 
 
275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0280  taurine transporter subunit  30.99 
 
 
275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.21 
 
 
291 aa  109  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.9 
 
 
281 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.48 
 
 
269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.69 
 
 
287 aa  109  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0773955  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2535  putative taurine ABC transporter, permease protein  29.36 
 
 
282 aa  109  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254862  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.44 
 
 
291 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1975  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.44 
 
 
291 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.690359  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.87 
 
 
283 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.48 
 
 
273 aa  108  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.49 
 
 
272 aa  108  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.334714  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1488  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.18 
 
 
280 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.106569  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.19 
 
 
294 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.106321 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0692  ABC taurine transporter, inner membrane subunit  30.36 
 
 
306 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000618741  normal  0.0440204 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1369  ABC transporter membrane protein  31.02 
 
 
272 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0458182 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>