More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2355 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2355  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  100 
 
 
274 aa  543  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214574  normal  0.0382396 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  97.81 
 
 
274 aa  530  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.146122 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  93.8 
 
 
274 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1200  transmembrane permease ABC transporter protein  76.38 
 
 
263 aa  392  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.441856  normal  0.826922 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  75.76 
 
 
263 aa  381  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.629035  normal  0.968824 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  76.14 
 
 
263 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2103  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  83.55 
 
 
263 aa  378  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153016  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2274  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.31 
 
 
279 aa  376  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.8 
 
 
263 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0243564  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.73 
 
 
283 aa  365  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.02 
 
 
277 aa  362  3e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.32 
 
 
259 aa  303  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.947992  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1432  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.07 
 
 
260 aa  291  9e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324199  normal  0.863766 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1056  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.3 
 
 
266 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.498595  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.45 
 
 
262 aa  281  6.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3278  ABC transporter related protein  66.82 
 
 
257 aa  281  9e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000407876  normal  0.0335836 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0285  ABC transporter, permease protein  59.92 
 
 
263 aa  280  2e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0261  ABC transporter, permease protein  59.92 
 
 
263 aa  279  3e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.597346  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2256  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.26 
 
 
268 aa  279  4e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3212  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.83 
 
 
271 aa  276  3e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.896165  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.45 
 
 
276 aa  273  3e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960786  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.45 
 
 
276 aa  273  3e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6067  ABC transporter permease  63.96 
 
 
261 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.5 
 
 
264 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440017  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2107  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.67 
 
 
265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3334  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  53.18 
 
 
265 aa  231  6e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.227064  normal  0.190195 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5061  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.45 
 
 
293 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.877762  normal  0.739003 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5341  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.82 
 
 
293 aa  202  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.7364 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3330  ABC transporter membrane spanning protein  41.09 
 
 
295 aa  202  6e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.730487  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.57 
 
 
295 aa  189  5e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.739127  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1531  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.96 
 
 
295 aa  188  7e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0493  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  45.61 
 
 
287 aa  185  8e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114665  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.61 
 
 
287 aa  185  9e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.753159  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3961  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.69 
 
 
287 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.05 
 
 
302 aa  183  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.033554  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0037  ABC transporter, permease protein  44.4 
 
 
259 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2678  ABC transporter, permease protein  44.3 
 
 
285 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0038  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.86 
 
 
285 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.090458  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.86 
 
 
285 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.86 
 
 
282 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0253  ABC transporter, permease protein  44.3 
 
 
282 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.735185  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2699  ABC transporter, permease protein  44.3 
 
 
282 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0040  ABC transporter, permease protein  44.3 
 
 
282 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.522623  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3274  ABC transporter, permease protein  44.3 
 
 
282 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1853  ABC transporter, permease protein  44.3 
 
 
282 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.989072  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0040  ABC transporter, permease protein  44.3 
 
 
282 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.3 
 
 
282 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589022  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.13 
 
 
294 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0684117  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.3 
 
 
285 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0034  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.86 
 
 
285 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3216  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  44.3 
 
 
285 aa  178  7e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0950  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.04 
 
 
283 aa  175  8e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.616045  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4522  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.65 
 
 
329 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2962  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.33 
 
 
280 aa  146  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0794658  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.42 
 
 
271 aa  144  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
279 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.667278  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
279 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.568124  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2561  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.02 
 
 
279 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.9 
 
 
257 aa  135  5e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.63 
 
 
272 aa  135  8e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1181  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.52 
 
 
271 aa  132  5e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3099  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.88 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1169  putative ABC transporter permease protein  33.33 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.44 
 
 
257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116723  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2777  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.09 
 
 
292 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.49 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.63161  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.02 
 
 
273 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5801  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.02 
 
 
290 aa  125  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.81 
 
 
269 aa  125  9e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.47 
 
 
281 aa  125  9e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0926  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.06 
 
 
249 aa  125  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.04587  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1834  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.28 
 
 
268 aa  123  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.101401  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.27 
 
 
278 aa  122  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000965537  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3923  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.84 
 
 
289 aa  122  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276752  normal  0.204471 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7629  putative ABC transporter permease protein  31.96 
 
 
282 aa  122  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal  0.441686 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2574  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.8 
 
 
270 aa  122  7e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.49 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615395  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.94 
 
 
281 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.84 
 
 
273 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.67 
 
 
255 aa  119  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.09 
 
 
243 aa  118  9e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0981  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  26.27 
 
 
279 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000865  hydroxymethylpyrimidine ABC transporter transmembrane component  33.62 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3598  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.64 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1306  ABC transporter, permease component  34.55 
 
 
286 aa  116  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334764  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.12 
 
 
274 aa  116  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00112224  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2784  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.92 
 
 
269 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.39 
 
 
259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657833 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06840  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system permease component  33.19 
 
 
266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3961  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.73 
 
 
256 aa  115  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2638  ABC sulfonate transporter, inner membrane subunit  25.88 
 
 
279 aa  115  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0950643  hitchhiker  0.0000361652 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1140  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.08 
 
 
255 aa  115  7.999999999999999e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0211  ABC transporter, permease protein  34.9 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1796  sulfonate ABC transporter, permease protein, putative  27.7 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.97 
 
 
267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0202  ABC transporter, permease protein  34.9 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.89 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133558  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.5 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4887  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.96 
 
 
267 aa  112  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.97 
 
 
274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.240571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>