More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0809 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0809  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 277 aa  545  1e-154  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00650739  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1369  ABC transporter membrane protein  29.66 
 
 		 272 aa  125  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.28 
 
 		 278 aa  122  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0649738  hitchhiker  0.00238236 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4074  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.26 
 
 		 281 aa  119  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.265456 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8275  ABC-type transporter, permease protein  29.24 
 
 		 272 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.41 
 
 		 276 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.41 
 
 		 276 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0457  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  32.46 
 
 		 258 aa  113  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2561  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.97 
 
 		 279 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.94 
 
 		 298 aa  112  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.30367  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.47 
 
 		 279 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.667278  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.47 
 
 		 279 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.568124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2355  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  31.25 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214574  normal  0.0382396 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.29 
 
 		 289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.8 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1692  putative ABC transporter membrane protein  29.8 
 
 		 281 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2103  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.81 
 
 		 263 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153016  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.02 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0773955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.5 
 
 		 256 aa  106  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02150  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  29.18 
 
 		 244 aa  107  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18130  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  30.04 
 
 		 283 aa  105  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.8 
 
 		 254 aa  105  7e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.302994  normal  0.157809 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5321  taurine ABC transporter, permease protein  28.88 
 
 		 285 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.36 
 
 		 274 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.146122 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4075  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.75 
 
 		 285 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5605  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.17 
 
 		 265 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254441  normal  0.608264 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.8 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0243564  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.98 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3330  ABC transporter membrane spanning protein  31.77 
 
 		 295 aa  102  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.730487  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3606  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 		 257 aa  102  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5061  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.1 
 
 		 293 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.877762  normal  0.739003 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3877  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.87 
 
 		 282 aa  102  9e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.901388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3212  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.29 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.896165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4358  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.86 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0345846  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.08 
 
 		 268 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230241  normal  0.644528 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2598  ABC transporter, inner membrane subunit  33.16 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.541823  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1256  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.83 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.506862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1056  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.81 
 
 		 266 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.498595  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5341  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.77 
 
 		 293 aa  99.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.7364 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3747  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.35 
 
 		 254 aa  100  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5801  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.51 
 
 		 290 aa  99.4  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.28 
 
 		 294 aa  99  7e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0684117  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.39 
 
 		 279 aa  99  8e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.208956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.88 
 
 		 255 aa  99  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.71 
 
 		 279 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.588836 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.12 
 
 		 281 aa  99  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  29.31 
 
 		 279 aa  99  9e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.746145 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00317  taurine transporter subunit  30.6 
 
 		 275 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1200  transmembrane permease ABC transporter protein  27.53 
 
 		 263 aa  97.8  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.441856  normal  0.826922 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00321  hypothetical protein  30.6 
 
 		 275 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1432  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.81 
 
 		 260 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324199  normal  0.863766 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.04 
 
 		 275 aa  98.2  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3261  taurine transporter subunit  30.6 
 
 		 275 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.05 
 
 		 280 aa  97.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615395  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2545  binding-protein-dependent transport system protein  26.52 
 
 		 287 aa  97.8  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240068  normal  0.521676 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2274  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.93 
 
 		 279 aa  97.4  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.83 
 
 		 279 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0570948  normal  0.0921514 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0431  taurine transporter subunit  31.75 
 
 		 275 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0442  taurine transporter subunit  32.28 
 
 		 275 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0391  taurine transporter subunit  30.17 
 
 		 275 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.93 
 
 		 280 aa  97.1  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0593827  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.16 
 
 		 279 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.45 
 
 		 279 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3961  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.88 
 
 		 256 aa  96.7  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7650  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  30.13 
 
 		 247 aa  96.3  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.621765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4060  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  27.68 
 
 		 256 aa  96.3  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.17 
 
 		 263 aa  96.3  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.17 
 
 		 263 aa  95.9  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.629035  normal  0.968824 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1186  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.42 
 
 		 257 aa  95.9  7e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.409709  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.25 
 
 		 257 aa  95.5  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116723  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2432  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.22 
 
 		 255 aa  95.5  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0696299  normal  0.124912 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3058  taurine ABC transporter, permease protein  26.94 
 
 		 274 aa  95.5  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1140  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.73 
 
 		 255 aa  94.7  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0840  taurine transporter subunit  30.67 
 
 		 275 aa  94.7  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5126  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.86 
 
 		 280 aa  94.7  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.21 
 
 		 273 aa  94  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.42 
 
 		 270 aa  94.7  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2078  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.72 
 
 		 248 aa  94  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0208  nitrate ABC transporter, permease protein, putative  29.69 
 
 		 260 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.473726 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.18 
 
 		 262 aa  93.6  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.43 
 
 		 277 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.19 
 
 		 259 aa  94  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657833 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3060  taurine ABC transporter, permease protein  26.89 
 
 		 274 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244271  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0280  taurine transporter subunit  31.22 
 
 		 275 aa  93.2  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2748  sulfonate/taurine ABC transporter permease  26.89 
 
 		 274 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947189  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.35 
 
 		 279 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.83 
 
 		 532 aa  93.2  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3278  ABC transporter related protein  29.1 
 
 		 257 aa  92.8  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000407876  normal  0.0335836 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3693  taurine transporter subunit  28.45 
 
 		 284 aa  92.8  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3936  taurine transporter subunit  28.45 
 
 		 284 aa  92.8  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0260  taurine transporter subunit  28.45 
 
 		 284 aa  92.8  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3240  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.22 
 
 		 275 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2133  taurine ABC transporter, permease protein  31.18 
 
 		 283 aa  92.8  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.38 
 
 		 283 aa  92.8  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199649  normal  0.0607956 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0697  taurine ABC transporter, permease protein  31.18 
 
 		 283 aa  92.8  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3923  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.07 
 
 		 289 aa  92.4  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276752  normal  0.204471 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.27 
 
 		 255 aa  92.8  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.16 
 
 		 255 aa  92.4  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185051 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.65 
 
 		 277 aa  92.4  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2220  taurine ABC transporter, permease protein  31.18 
 
 		 283 aa  92.4  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>