More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5605 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5605  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
265 aa  505  9.999999999999999e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254441  normal  0.608264 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.98 
 
 
268 aa  142  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230241  normal  0.644528 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3330  ABC transporter membrane spanning protein  29.55 
 
 
295 aa  125  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.730487  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.41 
 
 
279 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.208956  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5061  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.91 
 
 
293 aa  122  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.877762  normal  0.739003 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5341  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.34 
 
 
293 aa  122  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.7364 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4188  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.84 
 
 
253 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.605397 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3099  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.03 
 
 
261 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.65 
 
 
270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18130  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  34.52 
 
 
283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1200  transmembrane permease ABC transporter protein  32.45 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.441856  normal  0.826922 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.19 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0649738  hitchhiker  0.00238236 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2274  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.08 
 
 
279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.53 
 
 
257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.17 
 
 
277 aa  108  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.13 
 
 
251 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.616361 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.51 
 
 
276 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.51 
 
 
276 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960786  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.22 
 
 
263 aa  106  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0243564  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0950  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.1 
 
 
283 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.616045  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.9 
 
 
259 aa  105  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.947992  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2103  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.22 
 
 
263 aa  105  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153016  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4074  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.38 
 
 
281 aa  105  8e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.265456 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.65 
 
 
263 aa  105  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.629035  normal  0.968824 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1283  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  31.02 
 
 
252 aa  105  9e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0507526 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.03 
 
 
294 aa  104  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0684117  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.08 
 
 
298 aa  104  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.30367  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.65 
 
 
263 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.41 
 
 
289 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3278  ABC transporter related protein  35.46 
 
 
257 aa  104  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000407876  normal  0.0335836 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.63 
 
 
281 aa  102  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.8 
 
 
274 aa  102  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7650  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  34.45 
 
 
247 aa  102  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.621765  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.08 
 
 
277 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0809  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.17 
 
 
277 aa  99.4  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00650739  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2355  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  31.7 
 
 
274 aa  99  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214574  normal  0.0382396 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1692  putative ABC transporter membrane protein  31.74 
 
 
281 aa  98.2  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3877  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.55 
 
 
282 aa  98.2  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.901388  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0887  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.08 
 
 
276 aa  98.2  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.429644  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.41 
 
 
272 aa  97.1  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0493  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  31.67 
 
 
287 aa  97.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114665  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1369  ABC transporter membrane protein  30.33 
 
 
272 aa  97.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
287 aa  97.1  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0773955  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.58 
 
 
283 aa  96.3  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199649  normal  0.0607956 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.58 
 
 
283 aa  96.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.193679 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0038  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.91 
 
 
285 aa  96.3  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.090458  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.91 
 
 
285 aa  96.3  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.91 
 
 
282 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1812  ABC transporter, permease protein  32.03 
 
 
257 aa  96.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.554956  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5801  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.84 
 
 
290 aa  96.3  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3961  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.64 
 
 
287 aa  95.9  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.06 
 
 
267 aa  95.9  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.25 
 
 
274 aa  95.9  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.146122 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0037  ABC transporter, permease protein  31.2 
 
 
259 aa  95.5  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.9 
 
 
262 aa  95.5  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2678  ABC transporter, permease protein  30.77 
 
 
285 aa  95.1  9e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
282 aa  95.5  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589022  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0213  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.08 
 
 
252 aa  95.5  9e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0034  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.34 
 
 
285 aa  95.5  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3212  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.11 
 
 
271 aa  95.1  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.896165  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0253  ABC transporter, permease protein  30.77 
 
 
282 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.735185  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2699  ABC transporter, permease protein  30.77 
 
 
282 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0040  ABC transporter, permease protein  30.77 
 
 
282 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.522623  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2012  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.7 
 
 
280 aa  95.1  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.338733  normal  0.193625 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.34 
 
 
285 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
287 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.753159  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3274  ABC transporter, permease protein  30.77 
 
 
282 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1853  ABC transporter, permease protein  30.77 
 
 
282 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.989072  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0040  ABC transporter, permease protein  30.77 
 
 
282 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.09 
 
 
248 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325809  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3216  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  30.34 
 
 
285 aa  94  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.26 
 
 
255 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.185051 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1531  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.34 
 
 
295 aa  94.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3295  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.12 
 
 
279 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8275  ABC-type transporter, permease protein  28.81 
 
 
272 aa  93.6  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.69 
 
 
271 aa  94  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3181  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.96 
 
 
277 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0283642  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.52 
 
 
283 aa  93.2  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0666  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.12 
 
 
271 aa  93.2  4e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4214  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.24 
 
 
281 aa  92.4  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7235  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.73 
 
 
285 aa  92.4  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.266674  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2598  ABC transporter, inner membrane subunit  34.83 
 
 
266 aa  92.8  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.541823  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0355  putative ABC aliphatic sulfonates transporter, permease subunit  30.15 
 
 
264 aa  92.8  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.15 
 
 
264 aa  92.8  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.24 
 
 
263 aa  92.4  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.69 
 
 
258 aa  92.4  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.32 
 
 
302 aa  91.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.033554  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1188  taurine ABC transporter, permease protein  30.21 
 
 
250 aa  91.7  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0612406  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.85 
 
 
275 aa  91.3  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0261  ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
263 aa  91.7  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.597346  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.97 
 
 
281 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0133  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  31.65 
 
 
283 aa  91.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.744619  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4522  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.78 
 
 
329 aa  91.3  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.52 
 
 
280 aa  91.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615395  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1834  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.41 
 
 
268 aa  91.3  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.101401  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1056  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.94 
 
 
266 aa  92  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.498595  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4268  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.38 
 
 
282 aa  91.3  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0113678 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7629  putative ABC transporter permease protein  28.95 
 
 
282 aa  90.9  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal  0.441686 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.14 
 
 
264 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440017  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.95 
 
 
314 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>