More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4358 on replicon NC_008538
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008538  Arth_4358  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
266 aa  512  1e-144  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0345846  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0457  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  30.09 
 
 
258 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3299  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  32.75 
 
 
286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201269  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.49 
 
 
259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.947992  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.22 
 
 
289 aa  109  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18130  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  34.3 
 
 
283 aa  109  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4357  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.69 
 
 
266 aa  108  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0057766  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1369  ABC transporter membrane protein  32.37 
 
 
272 aa  108  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
275 aa  108  8.000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.24 
 
 
278 aa  108  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0649738  hitchhiker  0.00238236 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.72 
 
 
294 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136656  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5321  taurine ABC transporter, permease protein  30.66 
 
 
285 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.22 
 
 
277 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2561  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.3 
 
 
279 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.54 
 
 
258 aa  106  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.114909  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1684  ABC transporter permease  32.08 
 
 
262 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.91 
 
 
279 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.667278  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19570  ABC transporter permease  31.6 
 
 
262 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.91 
 
 
279 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.568124  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1453  alkanesulfonate transporter permease subunit  30.49 
 
 
263 aa  105  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.46 
 
 
276 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.46 
 
 
276 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960786  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.67 
 
 
298 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.30367  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7629  putative ABC transporter permease protein  30.14 
 
 
282 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal  0.441686 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2355  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  27.63 
 
 
274 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214574  normal  0.0382396 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
279 aa  103  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.208956  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3330  ABC transporter membrane spanning protein  28.81 
 
 
295 aa  103  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.730487  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1692  putative ABC transporter membrane protein  32.34 
 
 
281 aa  102  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2256  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.14 
 
 
268 aa  102  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.24 
 
 
274 aa  102  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5341  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.4 
 
 
293 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.7364 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5801  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.66 
 
 
290 aa  102  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.72 
 
 
265 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0722896  normal  0.022026 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5061  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.67 
 
 
293 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.877762  normal  0.739003 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.25 
 
 
265 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.06 
 
 
287 aa  101  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0773955  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.25 
 
 
265 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.293544  normal  0.0445843 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.39 
 
 
279 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  29.32 
 
 
279 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.25 
 
 
265 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791848  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.48 
 
 
269 aa  100  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.406887  normal  0.454808 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.66 
 
 
268 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230241  normal  0.644528 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.85 
 
 
274 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.146122 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.05 
 
 
279 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0570948  normal  0.0921514 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5412  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.09 
 
 
260 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.210037  hitchhiker  0.00191971 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.53 
 
 
281 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.95 
 
 
271 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0409101  normal  0.884011 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2935  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.65 
 
 
252 aa  99.4  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.35 
 
 
279 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.588836 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.85 
 
 
264 aa  99  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.440066  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2638  ABC sulfonate transporter, inner membrane subunit  30.59 
 
 
279 aa  99  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0950643  hitchhiker  0.0000361652 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0406  putative taurine ABC transporter, permease protein  29.82 
 
 
272 aa  98.6  9e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0467  taurine ABC transporter, permease protein, putative  29.82 
 
 
272 aa  98.6  9e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.26 
 
 
263 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.37 
 
 
255 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.185051 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0981  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  33.51 
 
 
279 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.26 
 
 
263 aa  98.2  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0243564  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.26 
 
 
263 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.629035  normal  0.968824 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1200  transmembrane permease ABC transporter protein  27.85 
 
 
263 aa  97.8  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.441856  normal  0.826922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8275  ABC-type transporter, permease protein  29.59 
 
 
272 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3936  taurine transporter subunit  26.89 
 
 
284 aa  97.8  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3693  taurine transporter subunit  26.89 
 
 
284 aa  97.8  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2630  sulfonate ABC transporter, permease protein, putative  35.03 
 
 
266 aa  97.4  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.312135  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3212  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.1 
 
 
271 aa  97.4  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.896165  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0950  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.96 
 
 
283 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.616045  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0260  taurine transporter subunit  26.89 
 
 
284 aa  97.8  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.53 
 
 
263 aa  96.7  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.02 
 
 
275 aa  96.7  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3278  ABC transporter related protein  28.51 
 
 
257 aa  96.7  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000407876  normal  0.0335836 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0712  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.65 
 
 
302 aa  96.3  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.900284  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0261  ABC transporter, permease protein  27.54 
 
 
263 aa  96.3  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.597346  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.21 
 
 
268 aa  96.3  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80309  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2104  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  29.54 
 
 
283 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0291571  normal  0.0240092 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.35 
 
 
264 aa  95.9  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.05 
 
 
279 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796344  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0355  putative ABC aliphatic sulfonates transporter, permease subunit  29.35 
 
 
264 aa  95.9  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.5 
 
 
264 aa  96.3  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.23 
 
 
252 aa  95.9  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799696  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2012  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.57 
 
 
280 aa  95.5  7e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.338733  normal  0.193625 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3877  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.46 
 
 
282 aa  95.5  8e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.901388  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.31 
 
 
276 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.936191 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2324  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  29 
 
 
293 aa  95.5  8e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.93 
 
 
279 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1673  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.55 
 
 
263 aa  95.1  9e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1385  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.83 
 
 
284 aa  95.1  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0616622  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2787  ABC transporter, permease protein  32.3 
 
 
282 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0328614  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0673  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.07 
 
 
275 aa  94.7  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0666321  normal  0.331074 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.86 
 
 
274 aa  94.7  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0817  ABC transporter related protein  34.9 
 
 
492 aa  94.7  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.309085  normal  0.730271 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0809  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.91 
 
 
277 aa  95.1  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00650739  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.97 
 
 
262 aa  94.7  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.81 
 
 
258 aa  95.1  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.02 
 
 
264 aa  94.7  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.050552  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.12 
 
 
272 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.612608  normal  0.0470724 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44530  Binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.63 
 
 
259 aa  94.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0634098  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1439  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  31.52 
 
 
310 aa  94.4  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.062597  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2103  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.23 
 
 
263 aa  94  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153016  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.59 
 
 
275 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.59 
 
 
283 aa  94  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6067  ABC transporter permease  27.62 
 
 
261 aa  94  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>