More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3278 on replicon NC_014213
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014213  Mesil_3278  ABC transporter related protein  100 
 
 
257 aa  495  1e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000407876  normal  0.0335836 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.03 
 
 
263 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.629035  normal  0.968824 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.64 
 
 
263 aa  303  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1200  transmembrane permease ABC transporter protein  63.14 
 
 
263 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.441856  normal  0.826922 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.13 
 
 
276 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.13 
 
 
276 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960786  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.93 
 
 
274 aa  297  9e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2274  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.19 
 
 
279 aa  296  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.82 
 
 
274 aa  295  6e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.146122 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2355  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  66.82 
 
 
274 aa  295  7e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214574  normal  0.0382396 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.77 
 
 
259 aa  292  4e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.947992  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2103  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  63.45 
 
 
263 aa  291  5e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153016  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.66 
 
 
263 aa  291  5e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0243564  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.36 
 
 
277 aa  288  6e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.2 
 
 
264 aa  279  2e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440017  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.49 
 
 
262 aa  274  9e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3212  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.78 
 
 
271 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.896165  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1056  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.06 
 
 
266 aa  271  7e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.498595  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1432  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.5 
 
 
260 aa  271  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324199  normal  0.863766 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.14 
 
 
283 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6067  ABC transporter permease  65.64 
 
 
261 aa  267  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0261  ABC transporter, permease protein  63.27 
 
 
263 aa  267  1e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.597346  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0285  ABC transporter, permease protein  62.83 
 
 
263 aa  266  2.9999999999999995e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2107  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.22 
 
 
265 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3334  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  64.16 
 
 
265 aa  249  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.227064  normal  0.190195 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2256  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.24 
 
 
268 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5061  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.2 
 
 
293 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.877762  normal  0.739003 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5341  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.2 
 
 
293 aa  227  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.7364 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3330  ABC transporter membrane spanning protein  46 
 
 
295 aa  221  7e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.730487  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.99 
 
 
294 aa  203  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0684117  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.32 
 
 
302 aa  203  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.033554  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3961  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.5 
 
 
287 aa  201  8e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.44 
 
 
287 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.753159  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0493  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  47.44 
 
 
287 aa  196  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114665  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.41 
 
 
282 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0038  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.41 
 
 
285 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.090458  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.41 
 
 
285 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2699  ABC transporter, permease protein  44.84 
 
 
282 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2678  ABC transporter, permease protein  44.84 
 
 
285 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0253  ABC transporter, permease protein  44.84 
 
 
282 aa  193  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.735185  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1853  ABC transporter, permease protein  44.84 
 
 
282 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.989072  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0040  ABC transporter, permease protein  44.84 
 
 
282 aa  193  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.522623  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0037  ABC transporter, permease protein  46.84 
 
 
259 aa  193  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0040  ABC transporter, permease protein  44.84 
 
 
282 aa  193  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3274  ABC transporter, permease protein  44.84 
 
 
282 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1531  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.31 
 
 
295 aa  192  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0034  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.84 
 
 
285 aa  192  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.84 
 
 
282 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589022  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.41 
 
 
285 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.75 
 
 
295 aa  191  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.739127  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3216  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  46.41 
 
 
285 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0950  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.41 
 
 
283 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.616045  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4522  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.46 
 
 
329 aa  183  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.65 
 
 
271 aa  181  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2962  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.69 
 
 
280 aa  169  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0794658  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.15 
 
 
269 aa  152  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.23 
 
 
279 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.667278  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.23 
 
 
279 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.568124  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2561  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.23 
 
 
279 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2777  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.86 
 
 
292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5801  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.58 
 
 
290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2784  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
269 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3099  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.87 
 
 
261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.24 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1181  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.48 
 
 
271 aa  135  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.93 
 
 
281 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.62 
 
 
268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133558  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.85 
 
 
273 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.82 
 
 
272 aa  133  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7629  putative ABC transporter permease protein  33.47 
 
 
282 aa  132  6.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal  0.441686 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.51 
 
 
274 aa  129  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.240571  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1306  ABC transporter, permease component  34.58 
 
 
286 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334764  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.2 
 
 
268 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.89 
 
 
280 aa  126  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615395  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.63 
 
 
278 aa  125  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000965537  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4937  ABC transporter, permease protein  34.69 
 
 
268 aa  125  7e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6360  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  32.33 
 
 
267 aa  125  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.821284  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4902  ABC transporter, permease protein  34.18 
 
 
268 aa  125  9e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4677  ABC transporter permease  34.18 
 
 
268 aa  125  9e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4536  ABC transporter, permease  34.18 
 
 
268 aa  125  9e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5038  ABC transporter permease  34.18 
 
 
268 aa  125  9e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1169  putative ABC transporter permease protein  33.05 
 
 
279 aa  125  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4903  ABC transporter, permease protein  34.18 
 
 
268 aa  124  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.37 
 
 
281 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 
267 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1834  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.3 
 
 
268 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.101401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4517  ABC transporter, permease  34.18 
 
 
268 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4923  ABC transporter, permease protein  34.18 
 
 
268 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0335  ABC transporter, permease protein  33.16 
 
 
268 aa  122  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3598  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.8 
 
 
285 aa  122  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06840  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system permease component  31.49 
 
 
266 aa  122  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.91 
 
 
271 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.82 
 
 
274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00112224  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000865  hydroxymethylpyrimidine ABC transporter transmembrane component  31.49 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21600  aliphatic sulfonates ABC transporter, inner membrane component  31.73 
 
 
284 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2574  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.18 
 
 
270 aa  120  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.22 
 
 
257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116723  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3118  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.61 
 
 
284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.51 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.135552 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>