More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2598 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_2598  ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
266 aa  494  1e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.541823  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1256  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  98.87 
 
 
266 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.506862  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1925  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  84.96 
 
 
266 aa  360  1e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320411  normal  0.383291 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2078  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.01 
 
 
248 aa  232  4.0000000000000004e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.14 
 
 
268 aa  121  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230241  normal  0.644528 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.05 
 
 
280 aa  118  9e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615395  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1171  taurine ABC transporter permease  35.45 
 
 
272 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.104716  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1453  alkanesulfonate transporter permease subunit  33.33 
 
 
263 aa  115  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4074  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.42 
 
 
281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.265456 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4188  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.31 
 
 
253 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.605397 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2432  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.22 
 
 
255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0696299  normal  0.124912 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1673  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.97 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.6 
 
 
278 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0649738  hitchhiker  0.00238236 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0809  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.29 
 
 
277 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00650739  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4214  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.17 
 
 
281 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2703  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.84 
 
 
263 aa  109  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.88688  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.48 
 
 
273 aa  108  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0722  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.58 
 
 
272 aa  108  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0102858  normal  0.0961586 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1380  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  34.76 
 
 
277 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.153307 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12960  taurine ABC transporter permease  35.45 
 
 
272 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299757  normal  0.321121 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2132  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  29.62 
 
 
262 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.63 
 
 
256 aa  108  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.87 
 
 
289 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3299  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  35.27 
 
 
286 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201269  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5126  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.08 
 
 
280 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.76 
 
 
289 aa  107  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0355  putative ABC aliphatic sulfonates transporter, permease subunit  35.02 
 
 
264 aa  106  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1982  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.79 
 
 
266 aa  106  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.187248  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
264 aa  106  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.05 
 
 
297 aa  106  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.283538  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
264 aa  105  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.440066  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.91 
 
 
260 aa  105  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000143494  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2437  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.9 
 
 
278 aa  105  7e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
272 aa  105  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.612608  normal  0.0470724 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.62 
 
 
250 aa  105  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.312611  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.27 
 
 
277 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.47 
 
 
265 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
263 aa  104  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8275  ABC-type transporter, permease protein  32.66 
 
 
272 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5412  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.62 
 
 
260 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.210037  hitchhiker  0.00191971 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.04 
 
 
265 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.293544  normal  0.0445843 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1210  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.04 
 
 
315 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.69 
 
 
291 aa  103  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2479  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.9 
 
 
258 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5605  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.47 
 
 
265 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254441  normal  0.608264 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0467  taurine ABC transporter, permease protein, putative  34.56 
 
 
272 aa  103  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.76 
 
 
280 aa  103  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3883  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.61 
 
 
262 aa  103  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0406  putative taurine ABC transporter, permease protein  34.56 
 
 
272 aa  103  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.04 
 
 
265 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0722896  normal  0.022026 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.93 
 
 
239 aa  102  5e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.04 
 
 
265 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791848  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.22 
 
 
262 aa  102  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5315  aliphatic sulfonates ABC transporter, permease protein  34.47 
 
 
265 aa  102  9e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.71 
 
 
263 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.81 
 
 
279 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0250  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.18 
 
 
280 aa  101  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.28 
 
 
283 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199649  normal  0.0607956 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.4 
 
 
267 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.51 
 
 
279 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4875  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.04 
 
 
265 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746085  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4139  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.25 
 
 
275 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000314222  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.91 
 
 
268 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80309  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.27 
 
 
294 aa  101  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136656  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.78 
 
 
298 aa  100  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.30367  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1031  sulfonate ABC transporter, permease protein  29.18 
 
 
261 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
265 aa  99.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5468  ABC transporter membrane spanning protein (aliphatic sulphonate)  34.04 
 
 
284 aa  99.8  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165676  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19570  ABC transporter permease  33.64 
 
 
262 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.22 
 
 
254 aa  99.8  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.63161  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00938  alkanesulfonate transporter subunit  34.2 
 
 
263 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.028081  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.2 
 
 
263 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.753275  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1043  alkanesulfonate transporter permease subunit  34.2 
 
 
263 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1036  alkanesulfonate transporter permease subunit  34.2 
 
 
263 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0685931  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2583  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.56 
 
 
289 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
270 aa  99.4  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.56 
 
 
289 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.753313  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0550  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  31.19 
 
 
231 aa  99.4  5e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.952669  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.94 
 
 
269 aa  99.8  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.363458 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2662  alkanesulfonate transporter permease subunit  34.2 
 
 
263 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.629834  normal  0.0100847 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.56 
 
 
289 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.128032  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00945  hypothetical protein  34.2 
 
 
263 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.72 
 
 
273 aa  99  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.64 
 
 
264 aa  99.4  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5406  ABC transporter membrane spanning protein  30.89 
 
 
251 aa  99  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.408693  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1096  alkanesulfonate transporter permease subunit  34.2 
 
 
263 aa  99  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00432775  normal  0.422148 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.05 
 
 
280 aa  99  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
283 aa  99  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.193679 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0981  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  31.36 
 
 
279 aa  99  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7629  putative ABC transporter permease protein  33.04 
 
 
282 aa  99  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal  0.441686 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2492  ABC aliphatic sulfonates transporter, innermembrane subunit  32.05 
 
 
280 aa  99  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.773133 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.64 
 
 
264 aa  98.6  8e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.050552  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2185  alkanesulfonate transporter permease subunit  34.2 
 
 
264 aa  99  8e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.11182  normal  0.890131 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1188  taurine ABC transporter, permease protein  31.48 
 
 
250 aa  98.6  9e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0612406  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.58 
 
 
279 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0570948  normal  0.0921514 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7502  ABC transporter permease  32.72 
 
 
256 aa  98.6  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.50681 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1684  ABC transporter permease  33.64 
 
 
262 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0620  taurine transport system permease protein TauC  29.26 
 
 
245 aa  98.6  9e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00071484  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
302 aa  98.2  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0528102 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.22 
 
 
251 aa  98.6  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.616361 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>