More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5923 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.08 
 
 
585 aa  637    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81894  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5526  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.42 
 
 
584 aa  637    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.775381  normal  0.572944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1455  ABC transporter permease  59.57 
 
 
585 aa  635    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754425  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.5 
 
 
583 aa  639    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3466  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.98 
 
 
577 aa  757    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.222584 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6181  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  91.16 
 
 
577 aa  1003    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.247341  normal  0.752378 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4538  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.98 
 
 
577 aa  757    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.641004 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0935  putative transmembrane transporter  66.55 
 
 
576 aa  698    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5923  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
600 aa  1173    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.904436  normal  0.911733 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.61 
 
 
585 aa  640    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.139086  normal  0.0182448 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7488  ABC transporter permease  59.18 
 
 
577 aa  644    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.124133 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5725  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  56.44 
 
 
585 aa  635    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0622  ABC transporter, permease protein  68.51 
 
 
577 aa  741    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.974314  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3383  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  57.5 
 
 
583 aa  642    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.797393  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.61 
 
 
585 aa  640    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.42 
 
 
584 aa  637    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.77824  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.58 
 
 
583 aa  647    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0820586  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2443  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.08 
 
 
585 aa  637    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343058  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4140  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.64 
 
 
584 aa  635    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.406581 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.39 
 
 
582 aa  642    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0759  ABC transporter, permease protein  66.55 
 
 
577 aa  700    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.61 
 
 
585 aa  640    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0891298  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.42 
 
 
584 aa  637    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.247948 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0770  ABC transporter, permease protein  66.72 
 
 
577 aa  700    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4605  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.81 
 
 
584 aa  632  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.242403 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0892  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.04 
 
 
584 aa  634  1e-180  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0183914 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0896  ABC transporter, permease protein  56.44 
 
 
585 aa  630  1e-179  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0971  ABC anion transporter, fused inner membrane subunits  56.89 
 
 
583 aa  627  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2156  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.69 
 
 
584 aa  627  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.856816  hitchhiker  0.00000224525 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3027  ABC transporter, permease protein  56.26 
 
 
585 aa  617  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0469117  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0754  ABC transporter, permease protein  56.26 
 
 
585 aa  617  1e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5091  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  56.14 
 
 
584 aa  617  1e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1256  ABC transporter, permease protein  56.26 
 
 
585 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1570  ABC transporter, permease protein  56.26 
 
 
585 aa  617  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0850001  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1103  ABC transporter, permease protein  56.26 
 
 
585 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.790132  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1098  ABC transporter, permease protein  56.26 
 
 
585 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5551  ABC transporter, permease protein  59.23 
 
 
584 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0997  ABC transporter, permease protein  56.08 
 
 
585 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5498  ABC-type anion transport system, duplicated permease component  55.68 
 
 
556 aa  605  9.999999999999999e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0270  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.41 
 
 
582 aa  605  9.999999999999999e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.371036  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7462  ABC transporter permease  56.99 
 
 
585 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.900156 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.85 
 
 
578 aa  594  1e-168  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0431  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.96 
 
 
578 aa  588  1e-166  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1825  putative nitrate transport system permease protein  59.52 
 
 
584 aa  575  1.0000000000000001e-163  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.9 
 
 
584 aa  575  1.0000000000000001e-162  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0112  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.94 
 
 
578 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.44 
 
 
602 aa  570  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.170409 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3371  putative transmembrane ABC transporter protein  52.84 
 
 
586 aa  568  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1967  ABC transporter, permease protein  50.53 
 
 
581 aa  566  1e-160  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.94 
 
 
578 aa  563  1.0000000000000001e-159  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.294522 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0234  ABC transporter permease protein  50 
 
 
581 aa  558  1e-158  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.198469  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0135  hypothetical protein  50.36 
 
 
579 aa  558  1e-157  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0120  hypothetical protein  50.36 
 
 
579 aa  558  1e-157  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3030  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  49.83 
 
 
584 aa  551  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.374129  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0524  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  54.28 
 
 
579 aa  554  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.74 
 
 
594 aa  545  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.91 
 
 
594 aa  546  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.42 
 
 
577 aa  544  1e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2950  ABC transporter, permease protein  55.11 
 
 
538 aa  535  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3546  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.59 
 
 
575 aa  534  1e-150  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3185  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.31 
 
 
581 aa  533  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.583197  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0346  ABC transporter, permease protein  44.48 
 
 
582 aa  457  1e-127  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.38 
 
 
572 aa  433  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.270543  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3324  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.73 
 
 
588 aa  428  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0165  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.18 
 
 
574 aa  381  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.336199  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.58 
 
 
581 aa  378  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.477962  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.23 
 
 
576 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.759355 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.26 
 
 
578 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.035099  normal  0.978203 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3819  ABC transporter, inner membrane subunit  43.17 
 
 
579 aa  365  1e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.35 
 
 
583 aa  365  2e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.807719  hitchhiker  0.00198291 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0769  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.37 
 
 
570 aa  348  1e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0405  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.5 
 
 
573 aa  309  1.0000000000000001e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00121566  decreased coverage  0.00950402 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0109  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.28 
 
 
671 aa  273  7e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3497  hypothetical protein  52.09 
 
 
671 aa  270  7e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.22 
 
 
670 aa  266  8.999999999999999e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.35 
 
 
671 aa  246  6e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.32204 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.71 
 
 
497 aa  200  5e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.52 
 
 
459 aa  185  3e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0283  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.49 
 
 
468 aa  182  2e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.64 
 
 
458 aa  178  2e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.86 
 
 
553 aa  155  2e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.14778  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1376  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.11 
 
 
538 aa  139  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.856839  hitchhiker  0.00160873 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0678  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.62 
 
 
453 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.105704 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.76 
 
 
536 aa  130  9.000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2535  putative taurine ABC transporter, permease protein  28.46 
 
 
282 aa  71.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254862  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2667  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.88 
 
 
399 aa  67.4  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00496589  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.05 
 
 
296 aa  67.4  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00558212  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.05 
 
 
296 aa  67.4  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.987878  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0980  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.56 
 
 
400 aa  65.9  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1064  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.56 
 
 
400 aa  65.5  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0842907  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4821  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
295 aa  63.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3158  glycine betaine transporter membrane protein  29.32 
 
 
355 aa  63.5  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.363018  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.04 
 
 
303 aa  62.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.343272 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3734  glycine betaine transporter membrane protein  28.27 
 
 
374 aa  62.4  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3058  ABC proline/glycine betaine transporter, inner membrane subunit  28.04 
 
 
303 aa  62.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0864  glycine betaine transporter membrane protein  28.8 
 
 
400 aa  62.8  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4909  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
295 aa  62  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206817  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.38 
 
 
383 aa  62  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1496  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.2 
 
 
451 aa  62.4  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0787924  normal  0.370511 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02150  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  28.16 
 
 
244 aa  61.6  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>