More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0120 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_0234  ABC transporter permease protein  55.38 
 
 
581 aa  646    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.198469  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0135  hypothetical protein  100 
 
 
579 aa  1159    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0120  hypothetical protein  100 
 
 
579 aa  1159    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1967  ABC transporter, permease protein  55.46 
 
 
581 aa  648    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0112  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.64 
 
 
578 aa  632  1e-180  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1455  ABC transporter permease  52.75 
 
 
585 aa  608  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754425  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0431  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.02 
 
 
578 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7488  ABC transporter permease  51.33 
 
 
577 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.124133 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3371  putative transmembrane ABC transporter protein  53.32 
 
 
586 aa  600  1e-170  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.86 
 
 
585 aa  600  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.139086  normal  0.0182448 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5725  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  51.54 
 
 
585 aa  601  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.86 
 
 
585 aa  600  1e-170  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.86 
 
 
585 aa  600  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0891298  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2156  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.09 
 
 
584 aa  598  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.856816  hitchhiker  0.00000224525 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3030  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  52.31 
 
 
584 aa  597  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.374129  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0892  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.68 
 
 
584 aa  597  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0183914 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.2 
 
 
585 aa  597  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81894  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.29 
 
 
584 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.77824  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2443  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.2 
 
 
585 aa  597  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343058  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.29 
 
 
584 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.247948 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5526  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.29 
 
 
584 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.775381  normal  0.572944 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.48 
 
 
583 aa  594  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.94 
 
 
582 aa  588  1e-167  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0896  ABC transporter, permease protein  49.91 
 
 
585 aa  591  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.32 
 
 
594 aa  585  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5551  ABC transporter, permease protein  53.41 
 
 
584 aa  587  1e-166  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5091  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  51.28 
 
 
584 aa  587  1e-166  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3383  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  51.31 
 
 
583 aa  586  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.797393  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.32 
 
 
594 aa  585  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.43 
 
 
583 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0820586  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0754  ABC transporter, permease protein  49.32 
 
 
585 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1256  ABC transporter, permease protein  49.32 
 
 
585 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1098  ABC transporter, permease protein  49.32 
 
 
585 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4605  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.26 
 
 
584 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.242403 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0524  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  52.75 
 
 
579 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3185  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.77 
 
 
581 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.583197  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4140  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.26 
 
 
584 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.406581 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1570  ABC transporter, permease protein  49.32 
 
 
585 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0850001  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1103  ABC transporter, permease protein  49.32 
 
 
585 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.790132  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3027  ABC transporter, permease protein  49.32 
 
 
585 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0469117  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0997  ABC transporter, permease protein  49.14 
 
 
585 aa  580  1e-164  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0971  ABC anion transporter, fused inner membrane subunits  50.09 
 
 
583 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5498  ABC-type anion transport system, duplicated permease component  49.82 
 
 
556 aa  567  1e-160  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0270  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.43 
 
 
582 aa  564  1.0000000000000001e-159  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.371036  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7462  ABC transporter permease  50.18 
 
 
585 aa  553  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.900156 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.2 
 
 
578 aa  553  1e-156  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4538  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.44 
 
 
577 aa  548  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.641004 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3466  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.44 
 
 
577 aa  548  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.222584 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2950  ABC transporter, permease protein  51.76 
 
 
538 aa  545  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6181  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.9 
 
 
577 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.247341  normal  0.752378 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0622  ABC transporter, permease protein  51.84 
 
 
577 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.974314  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1825  putative nitrate transport system permease protein  51.62 
 
 
584 aa  536  1e-151  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.62 
 
 
584 aa  538  1e-151  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5923  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.54 
 
 
600 aa  535  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.904436  normal  0.911733 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0935  putative transmembrane transporter  51.74 
 
 
576 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0759  ABC transporter, permease protein  52.13 
 
 
577 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0770  ABC transporter, permease protein  52.13 
 
 
577 aa  527  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.73 
 
 
602 aa  521  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.170409 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.03 
 
 
577 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.96 
 
 
578 aa  513  1e-144  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.294522 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3546  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.7 
 
 
575 aa  495  1e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.71 
 
 
572 aa  478  1e-133  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.270543  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3324  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.05 
 
 
588 aa  452  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0346  ABC transporter, permease protein  42.67 
 
 
582 aa  421  1e-116  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0165  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.34 
 
 
574 aa  406  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.336199  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.14 
 
 
581 aa  404  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.477962  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.99 
 
 
583 aa  387  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.807719  hitchhiker  0.00198291 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.9 
 
 
576 aa  383  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.759355 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0769  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.52 
 
 
570 aa  368  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3819  ABC transporter, inner membrane subunit  38.98 
 
 
579 aa  355  1e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.9 
 
 
578 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.035099  normal  0.978203 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0405  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.55 
 
 
573 aa  297  4e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00121566  decreased coverage  0.00950402 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.13 
 
 
670 aa  284  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0109  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.92 
 
 
671 aa  283  9e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3497  hypothetical protein  50.69 
 
 
671 aa  273  6e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.01 
 
 
671 aa  252  1e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.32204 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.84 
 
 
497 aa  182  1e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.82 
 
 
553 aa  175  1.9999999999999998e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.14778  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.82 
 
 
459 aa  169  1e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.4 
 
 
536 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1376  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.84 
 
 
538 aa  163  1e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.856839  hitchhiker  0.00160873 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0283  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.02 
 
 
468 aa  158  2e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0678  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.36 
 
 
453 aa  155  2e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.105704 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.77 
 
 
458 aa  99.4  1e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3654  nitrate transport permease  22.16 
 
 
273 aa  56.6  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0358  ABC-type proline/glycine betaine transport system, permease component  25.13 
 
 
571 aa  56.2  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.963399  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3675  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  22.96 
 
 
280 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.94 
 
 
277 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.854714  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3315  putative nitrate ABC transporter, permease protein  26.28 
 
 
315 aa  55.5  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.286795  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.25 
 
 
277 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0887356  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3729  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  22.96 
 
 
280 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0184404  normal  0.11569 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1982  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  25 
 
 
266 aa  55.1  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.187248  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4934  amino acid ABC transporter, permease protein  22.44 
 
 
346 aa  54.7  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4395  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  23.4 
 
 
277 aa  54.3  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4458  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  23.4 
 
 
277 aa  54.3  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.698055  normal  0.534513 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.86 
 
 
283 aa  53.9  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000687252  normal  0.263014 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3059  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  25 
 
 
321 aa  53.9  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206387  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0674  glycine/betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  25.63 
 
 
279 aa  53.9  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000586111  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4471  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  22.29 
 
 
297 aa  53.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.5689 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2667  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.62 
 
 
399 aa  53.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00496589  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>