238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1376 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.84 
 
 
536 aa  655    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1376  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
538 aa  1064    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.856839  hitchhiker  0.00160873 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.93 
 
 
553 aa  349  9e-95  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.14778  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0135  hypothetical protein  25.84 
 
 
579 aa  163  9e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0120  hypothetical protein  25.84 
 
 
579 aa  163  9e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0165  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.99 
 
 
574 aa  160  7e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.336199  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.05 
 
 
582 aa  158  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.8 
 
 
581 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.477962  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5725  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  24.57 
 
 
585 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0405  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  25.61 
 
 
573 aa  151  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00121566  decreased coverage  0.00950402 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.34 
 
 
584 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.77824  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.34 
 
 
584 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.247948 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5526  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.34 
 
 
584 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.775381  normal  0.572944 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0754  ABC transporter, permease protein  25.89 
 
 
585 aa  148  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5091  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  25.75 
 
 
584 aa  148  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1256  ABC transporter, permease protein  25.89 
 
 
585 aa  148  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0997  ABC transporter, permease protein  25.89 
 
 
585 aa  148  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3027  ABC transporter, permease protein  25.89 
 
 
585 aa  148  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0469117  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1098  ABC transporter, permease protein  25.89 
 
 
585 aa  148  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1103  ABC transporter, permease protein  25.89 
 
 
585 aa  148  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.790132  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1570  ABC transporter, permease protein  25.89 
 
 
585 aa  148  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0850001  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4140  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.76 
 
 
584 aa  147  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.406581 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0896  ABC transporter, permease protein  24.65 
 
 
585 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.07 
 
 
576 aa  147  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.759355 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1967  ABC transporter, permease protein  25.46 
 
 
581 aa  145  1e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.84 
 
 
585 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.84 
 
 
585 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0891298  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.84 
 
 
585 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.139086  normal  0.0182448 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0234  ABC transporter permease protein  25.46 
 
 
581 aa  145  2e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.198469  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1455  ABC transporter permease  24.76 
 
 
585 aa  144  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754425  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.86 
 
 
583 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0820586  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0892  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.44 
 
 
584 aa  140  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0183914 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4605  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.37 
 
 
584 aa  140  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.242403 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7488  ABC transporter permease  24.34 
 
 
577 aa  140  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.124133 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3185  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.73 
 
 
581 aa  139  8.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.583197  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5551  ABC transporter, permease protein  24.24 
 
 
584 aa  137  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.98 
 
 
594 aa  137  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.2 
 
 
585 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81894  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2443  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.2 
 
 
585 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343058  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.15 
 
 
583 aa  136  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3371  putative transmembrane ABC transporter protein  24.86 
 
 
586 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3030  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  25.52 
 
 
584 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.374129  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0971  ABC anion transporter, fused inner membrane subunits  24.56 
 
 
583 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.78 
 
 
578 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.035099  normal  0.978203 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5498  ABC-type anion transport system, duplicated permease component  24 
 
 
556 aa  135  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.42 
 
 
572 aa  135  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.270543  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3383  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  23.59 
 
 
583 aa  135  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.797393  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0622  ABC transporter, permease protein  25.65 
 
 
577 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.974314  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0431  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.66 
 
 
578 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.44 
 
 
594 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0270  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.75 
 
 
582 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.371036  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0112  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23 
 
 
578 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0759  ABC transporter, permease protein  25.05 
 
 
577 aa  131  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0770  ABC transporter, permease protein  25.05 
 
 
577 aa  131  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0678  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.05 
 
 
453 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.105704 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3324  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.81 
 
 
588 aa  130  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0935  putative transmembrane transporter  24.67 
 
 
576 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0283  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.93 
 
 
468 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2156  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.63 
 
 
584 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.856816  hitchhiker  0.00000224525 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3466  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.98 
 
 
577 aa  127  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.222584 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4538  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.98 
 
 
577 aa  127  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.641004 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.26 
 
 
578 aa  127  7e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2950  ABC transporter, permease protein  23.93 
 
 
538 aa  126  9e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0769  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.46 
 
 
570 aa  126  9e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0524  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  24.95 
 
 
579 aa  125  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0346  ABC transporter, permease protein  24.01 
 
 
582 aa  123  7e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6181  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.89 
 
 
577 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.247341  normal  0.752378 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5923  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25 
 
 
600 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.904436  normal  0.911733 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.38 
 
 
497 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7462  ABC transporter permease  22.75 
 
 
585 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.900156 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3546  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.36 
 
 
575 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.15 
 
 
577 aa  113  8.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.37 
 
 
578 aa  111  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.294522 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1825  putative nitrate transport system permease protein  23.14 
 
 
584 aa  109  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.63 
 
 
459 aa  103  9e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.36 
 
 
602 aa  97.4  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.170409 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.35 
 
 
583 aa  95.9  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.807719  hitchhiker  0.00198291 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.37 
 
 
458 aa  94  6e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.06 
 
 
584 aa  90.1  8e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0109  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.54 
 
 
671 aa  89  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.15 
 
 
670 aa  87.4  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3819  ABC transporter, inner membrane subunit  28.05 
 
 
579 aa  84.7  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3497  hypothetical protein  27.59 
 
 
671 aa  77.4  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
671 aa  76.3  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.32204 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3459  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.77 
 
 
283 aa  58.5  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703735  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.52 
 
 
281 aa  57.8  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4886  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.67 
 
 
281 aa  57.4  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479856  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.39 
 
 
269 aa  54.7  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.406887  normal  0.454808 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
279 aa  54.7  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.30868 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4268  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.9 
 
 
282 aa  53.9  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0113678 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3877  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.22 
 
 
282 aa  53.9  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.901388  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.85 
 
 
252 aa  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27200  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  24.48 
 
 
253 aa  52.8  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0924  ABC transporter permease protein  28.03 
 
 
258 aa  52  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175022  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.15 
 
 
258 aa  52.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0208  nitrate ABC transporter, permease protein, putative  23.17 
 
 
260 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.473726 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0250  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.12 
 
 
280 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.63 
 
 
298 aa  51.6  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.63 
 
 
298 aa  51.6  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.281805  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.69 
 
 
342 aa  50.8  0.00006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>