More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3998 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3998  ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
253 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451031  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4139  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  79.1 
 
 
245 aa  329  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  78.28 
 
 
245 aa  328  7e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0627503  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  74.12 
 
 
254 aa  296  2e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0356148  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1283  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  42.5 
 
 
252 aa  207  1e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0507526 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1184  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.92 
 
 
264 aa  201  7e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0191984  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0827  ABC aliphatic sulfonate transporter, inner membrane subunit  44.05 
 
 
252 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.819281  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.08 
 
 
263 aa  179  4.999999999999999e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0998  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.29 
 
 
260 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.944594 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.92 
 
 
259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0712  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.98 
 
 
302 aa  150  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.900284  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.57 
 
 
321 aa  143  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41 
 
 
294 aa  141  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37 
 
 
320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00107512 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.86 
 
 
300 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.292938  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.5 
 
 
291 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.21 
 
 
291 aa  137  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.806375  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30900  ABC transporter, permease protein  39.2 
 
 
288 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.53 
 
 
441 aa  135  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0502009  hitchhiker  0.0000630788 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.02 
 
 
345 aa  132  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0917022  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1232  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.6 
 
 
319 aa  126  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1982  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.02 
 
 
266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.187248  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5058  ABC transporter permease protein  34.4 
 
 
289 aa  125  8.000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.987794  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.6 
 
 
289 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.608365 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.55 
 
 
287 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03033  transmembranee ABC transporter protein  34.75 
 
 
298 aa  122  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744864  normal  0.0870544 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0193  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.55 
 
 
287 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.778332  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6691  putative ABC transporter  35.75 
 
 
288 aa  122  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0191  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.55 
 
 
287 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466577  normal  0.686195 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.61 
 
 
298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.281805  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.61 
 
 
298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.55 
 
 
287 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.97734  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5196  ABC transporter, permease protein  36.14 
 
 
288 aa  118  9e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0140  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.14 
 
 
288 aa  118  9e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0339  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.14 
 
 
311 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.461583 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1900  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.34 
 
 
252 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.128113  hitchhiker  0.000000000000910228 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0768  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.93 
 
 
286 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113876 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1584  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.13 
 
 
288 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1412  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.3 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.72654  normal  0.222261 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4373  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.8 
 
 
308 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.4 
 
 
292 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.475828  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.05 
 
 
259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.71 
 
 
277 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1974  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.05 
 
 
261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000226251  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4890  putative ABC transporter (permease protein)  36.71 
 
 
281 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.2612 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.06 
 
 
255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.73 
 
 
292 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.75 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.684311  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10010  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  40.25 
 
 
307 aa  113  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00312857  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2787  ABC transporter, permease protein  35.43 
 
 
282 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0328614  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.71 
 
 
294 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6248  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
295 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.620042  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2837  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.24 
 
 
266 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.115716  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.86 
 
 
292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.309315 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2515  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.18 
 
 
282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.313862  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1174  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.61 
 
 
367 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0829949  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1122  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.44 
 
 
294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4139  sulfonate/nitrate ABC transporter permease  36.95 
 
 
292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.241741  normal  0.999839 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34790  putative permease of ABC transporter  39.01 
 
 
288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.120138  normal  0.0146992 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.19 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.987071 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.92 
 
 
292 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.45 
 
 
252 aa  109  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799696  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0981  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  33.63 
 
 
279 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
295 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.8 
 
 
264 aa  107  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
295 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
295 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.97 
 
 
300 aa  107  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.563541  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.53 
 
 
263 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.93 
 
 
252 aa  106  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3295  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.88 
 
 
279 aa  106  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0821  permease  37.24 
 
 
313 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00555891  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0340  permease  37.24 
 
 
313 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1869  ABC transporter, permease protein  37.24 
 
 
323 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0802  taurine ABC transporter, permease protein  36.6 
 
 
283 aa  105  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207449  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2172  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  35.29 
 
 
292 aa  105  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.287546  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1684  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, permease protein  37.24 
 
 
323 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.483892  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1881  ABC transporter, permease protein  37.24 
 
 
323 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.259597  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2036  permease  37.24 
 
 
323 aa  105  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1679  ABC transporter permease  36.48 
 
 
274 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.451747  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19510  ABC transporter permease  36.89 
 
 
274 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4966  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.61 
 
 
187 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.09 
 
 
286 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.703431 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.71 
 
 
270 aa  103  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.639467  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2679  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.2 
 
 
290 aa  102  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.32 
 
 
288 aa  102  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.439861  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2638  ABC sulfonate transporter, inner membrane subunit  32.3 
 
 
279 aa  102  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0950643  hitchhiker  0.0000361652 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4357  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.3 
 
 
266 aa  102  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0057766  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2894  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.02 
 
 
280 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.42556  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.89 
 
 
275 aa  102  7e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0620  permease component of taurine ABC transporter  34.92 
 
 
253 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00192231  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0156  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  34.18 
 
 
292 aa  102  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557075  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1580  taurine ABC transporter, permease protein  34.92 
 
 
253 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.477521  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0697  taurine ABC transporter, permease protein  34.92 
 
 
283 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2220  taurine ABC transporter, permease protein  34.74 
 
 
283 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215273  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2133  taurine ABC transporter, permease protein  34.92 
 
 
283 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2019  taurine ABC transporter, permease protein  34.92 
 
 
285 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.484134  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.84 
 
 
296 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.05 
 
 
278 aa  100  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1482  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.79 
 
 
253 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>