More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1722 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1722  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 318 aa  605  9.999999999999999e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.000240612  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18090  methionyl-tRNA formyltransferase  69.59 
 
 		 315 aa  404  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.783991  normal  0.456867 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1855  methionyl-tRNA formyltransferase  68.05 
 
 		 319 aa  374  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1017  normal  0.411821 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3000  methionyl-tRNA formyltransferase  62.82 
 
 		 308 aa  354  1e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0437614  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1075  methionyl-tRNA formyltransferase  62.74 
 
 		 310 aa  343  2e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0107606  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2825  methionyl-tRNA formyltransferase  60.51 
 
 		 309 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1368  methionyl-tRNA formyltransferase  59.87 
 
 		 309 aa  330  2e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0580352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3099  methionyl-tRNA formyltransferase  59.05 
 
 		 315 aa  329  3e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2442  methionyl-tRNA formyltransferase  58.62 
 
 		 316 aa  329  3e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0870633  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1869  methionyl-tRNA formyltransferase  59.48 
 
 		 308 aa  329  3e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.573172 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1862  methionyl-tRNA formyltransferase  57.52 
 
 		 308 aa  322  7e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4156  methionyl-tRNA formyltransferase  61.66 
 
 		 307 aa  321  8e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.413206  hitchhiker  0.00887894 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0854  methionyl-tRNA formyltransferase  58.1 
 
 		 311 aa  318  6e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0108509  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3190  methionyl-tRNA formyltransferase  57.54 
 
 		 337 aa  317  2e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000305844  normal  0.338989 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15680  methionyl-tRNA formyltransferase  61.31 
 
 		 307 aa  317  2e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.153254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1278  methionyl-tRNA formyltransferase  57.45 
 
 		 324 aa  316  3e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0156282  normal  0.148843 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3119  methionyl-tRNA formyltransferase  58.94 
 
 		 309 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12770  methionyl-tRNA formyltransferase  56.02 
 
 		 336 aa  308  9e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.348945  normal  0.0208178 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2984  methionyl-tRNA formyltransferase  55.41 
 
 		 306 aa  307  2.0000000000000002e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1665  methionyl-tRNA formyltransferase  55.96 
 
 		 306 aa  306  3e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000612853 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5224  methionyl-tRNA formyltransferase  57.14 
 
 		 310 aa  305  9.000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373009  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2048  methionyl-tRNA formyltransferase  55.35 
 
 		 311 aa  299  5e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0469723 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1313  methionyl-tRNA formyltransferase  58.03 
 
 		 311 aa  298  8e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.141722 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1719  methionyl-tRNA formyltransferase  57.37 
 
 		 311 aa  297  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.296625  hitchhiker  0.00236307 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3730  methionyl-tRNA formyltransferase  59.35 
 
 		 310 aa  296  3e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.132882  normal  0.0191381 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16130  methionyl-tRNA formyltransferase  53.27 
 
 		 317 aa  296  3e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.452628  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2567  methionyl-tRNA formyltransferase  56.65 
 
 		 311 aa  295  1e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296174  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1671  methionyl-tRNA formyltransferase  56.95 
 
 		 306 aa  293  3e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.563662  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2575  methionyl-tRNA formyltransferase  52.88 
 
 		 308 aa  291  1e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0532653 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2687  methionyl-tRNA formyltransferase  56.59 
 
 		 310 aa  289  4e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2424  methionyl-tRNA formyltransferase  57.88 
 
 		 308 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0902213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2383  methionyl-tRNA formyltransferase  57.88 
 
 		 308 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0196795  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2430  methionyl-tRNA formyltransferase  57.88 
 
 		 308 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119113  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2350  methionyl-tRNA formyltransferase  55.45 
 
 		 313 aa  277  1e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167189  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0899  methionyl-tRNA formyltransferase  52.37 
 
 		 327 aa  266  2.9999999999999995e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11435  methionyl-tRNA formyltransferase  54.66 
 
 		 312 aa  265  1e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.682601  normal  0.406209 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1966  methionyl-tRNA formyltransferase  48.29 
 
 		 328 aa  263  2e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.417449  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10800  methionyl-tRNA formyltransferase  47.56 
 
 		 366 aa  221  1.9999999999999999e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0126989  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4748  methionyl-tRNA formyltransferase  43.69 
 
 		 310 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130868  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  44.19 
 
 		 310 aa  210  3e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  42.81 
 
 		 310 aa  209  7e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  42.33 
 
 		 315 aa  207  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  42.63 
 
 		 301 aa  206  5e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  42 
 
 		 315 aa  205  7e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  41.67 
 
 		 315 aa  204  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  41.67 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  41.67 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  41.67 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  41.67 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  41.67 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  40.92 
 
 		 312 aa  203  3e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  41.67 
 
 		 315 aa  202  6e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0393  methionyl-tRNA formyltransferase  42.44 
 
 		 311 aa  202  8e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  41 
 
 		 315 aa  201  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  42.33 
 
 		 315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  43.69 
 
 		 310 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0975  methionyl-tRNA formyltransferase  42.9 
 
 		 306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.569216  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  42.33 
 
 		 315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  42.33 
 
 		 315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  42.33 
 
 		 315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  42.33 
 
 		 315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1034  methionyl-tRNA formyltransferase  42.9 
 
 		 306 aa  200  3e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.79271  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0626  methionyl-tRNA formyltransferase  43.4 
 
 		 310 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274146  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  41.4 
 
 		 320 aa  199  5e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4568  methionyl-tRNA formyltransferase  45.68 
 
 		 312 aa  199  5e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1345  methionyl-tRNA formyltransferase  43.23 
 
 		 306 aa  199  7e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7336  methionyl-tRNA formyltransferase  43.26 
 
 		 311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.685492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  39.55 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1320  methionyl-tRNA formyltransferase  40.26 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2535  methionyl-tRNA formyltransferase  42.57 
 
 		 302 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.614949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0674  methionyl-tRNA formyltransferase  44.16 
 
 		 312 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  44.27 
 
 		 297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2894  methionyl-tRNA formyltransferase  44.59 
 
 		 301 aa  194  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  40.71 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  41.5 
 
 		 302 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  40.71 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  40.71 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1490  methionyl-tRNA formyltransferase  36.62 
 
 		 316 aa  193  3e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 315 aa  193  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0875  methionyl-tRNA formyltransferase  41.91 
 
 		 302 aa  192  5e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  38.69 
 
 		 314 aa  191  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4042  methionyl-tRNA formyltransferase  48.72 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0080  methionyl-tRNA formyltransferase  43.83 
 
 		 310 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.450016  normal  0.0632026 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  42.02 
 
 		 318 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  36.62 
 
 		 311 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  38.91 
 
 		 312 aa  189  5.999999999999999e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0410  methionyl-tRNA formyltransferase  43 
 
 		 301 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0181  methionyl-tRNA formyltransferase  41.83 
 
 		 299 aa  188  8e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.142178  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0817  methionyl-tRNA formyltransferase  38.19 
 
 		 316 aa  188  9e-47  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  38.91 
 
 		 315 aa  187  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0058  methionyl-tRNA formyltransferase  41.35 
 
 		 311 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.820848  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  45.61 
 
 		 311 aa  187  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  39.43 
 
 		 311 aa  187  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04056  methionyl-tRNA formyltransferase  43.65 
 
 		 307 aa  187  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0055  methionyl-tRNA formyltransferase  41.23 
 
 		 311 aa  186  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000555853 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09900  methionyl-tRNA formyltransferase  36.71 
 
 		 316 aa  186  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0040  methionyl-tRNA formyltransferase  37.86 
 
 		 317 aa  186  5e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1053  methionyl-tRNA formyltransferase  39.03 
 
 		 312 aa  186  6e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2313  methionyl-tRNA formyltransferase  35.35 
 
 		 312 aa  185  7e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490925  hitchhiker  0.0006759 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  38.21 
 
 		 314 aa  184  1.0000000000000001e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>