More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1855 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1855  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 319 aa  607  9.999999999999999e-173  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1017  normal  0.411821 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18090  methionyl-tRNA formyltransferase  68.15 
 
 		 315 aa  390  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.783991  normal  0.456867 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1722  methionyl-tRNA formyltransferase  68.05 
 
 		 318 aa  374  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.000240612  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3119  methionyl-tRNA formyltransferase  65.56 
 
 		 309 aa  362  6e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4156  methionyl-tRNA formyltransferase  65.37 
 
 		 307 aa  358  8e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.413206  hitchhiker  0.00887894 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3000  methionyl-tRNA formyltransferase  62.88 
 
 		 308 aa  355  7.999999999999999e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0437614  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3099  methionyl-tRNA formyltransferase  61.89 
 
 		 315 aa  352  5e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1869  methionyl-tRNA formyltransferase  61.36 
 
 		 308 aa  348  7e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.573172 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1862  methionyl-tRNA formyltransferase  61.36 
 
 		 308 aa  343  2e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2442  methionyl-tRNA formyltransferase  60.13 
 
 		 316 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0870633  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2825  methionyl-tRNA formyltransferase  60 
 
 		 309 aa  342  4e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2567  methionyl-tRNA formyltransferase  63.99 
 
 		 311 aa  340  1e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296174  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1368  methionyl-tRNA formyltransferase  62.5 
 
 		 309 aa  341  1e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0580352 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1278  methionyl-tRNA formyltransferase  60.44 
 
 		 324 aa  339  5e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0156282  normal  0.148843 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2350  methionyl-tRNA formyltransferase  61.98 
 
 		 313 aa  330  1e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167189  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15680  methionyl-tRNA formyltransferase  60.26 
 
 		 307 aa  330  2e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.153254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2575  methionyl-tRNA formyltransferase  59.87 
 
 		 308 aa  330  2e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0532653 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0854  methionyl-tRNA formyltransferase  57.69 
 
 		 311 aa  330  2e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0108509  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1075  methionyl-tRNA formyltransferase  60.7 
 
 		 310 aa  329  4e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0107606  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2048  methionyl-tRNA formyltransferase  58.52 
 
 		 311 aa  328  8e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0469723 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3730  methionyl-tRNA formyltransferase  63.49 
 
 		 310 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.132882  normal  0.0191381 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2687  methionyl-tRNA formyltransferase  61.72 
 
 		 310 aa  325  5e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2984  methionyl-tRNA formyltransferase  58.36 
 
 		 306 aa  319  5e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3190  methionyl-tRNA formyltransferase  56.75 
 
 		 337 aa  316  3e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000305844  normal  0.338989 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5224  methionyl-tRNA formyltransferase  56.68 
 
 		 310 aa  316  3e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373009  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1719  methionyl-tRNA formyltransferase  59.34 
 
 		 311 aa  316  3e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.296625  hitchhiker  0.00236307 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2383  methionyl-tRNA formyltransferase  60.93 
 
 		 308 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0196795  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2424  methionyl-tRNA formyltransferase  60.93 
 
 		 308 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0902213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2430  methionyl-tRNA formyltransferase  60.93 
 
 		 308 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119113  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16130  methionyl-tRNA formyltransferase  56.27 
 
 		 317 aa  311  6.999999999999999e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.452628  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1313  methionyl-tRNA formyltransferase  61.31 
 
 		 311 aa  311  1e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.141722 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12770  methionyl-tRNA formyltransferase  56.62 
 
 		 336 aa  310  2.9999999999999997e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.348945  normal  0.0208178 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1665  methionyl-tRNA formyltransferase  56.17 
 
 		 306 aa  306  3e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000612853 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1671  methionyl-tRNA formyltransferase  56.82 
 
 		 306 aa  288  7e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.563662  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11435  methionyl-tRNA formyltransferase  54.66 
 
 		 312 aa  285  8e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.682601  normal  0.406209 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1966  methionyl-tRNA formyltransferase  45.29 
 
 		 328 aa  248  7e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.417449  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  48.89 
 
 		 310 aa  233  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10800  methionyl-tRNA formyltransferase  49.35 
 
 		 366 aa  233  4.0000000000000004e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0126989  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0899  methionyl-tRNA formyltransferase  46.67 
 
 		 327 aa  230  3e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  42.16 
 
 		 310 aa  228  8e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  44.48 
 
 		 301 aa  228  1e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4748  methionyl-tRNA formyltransferase  46.3 
 
 		 310 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130868  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0875  methionyl-tRNA formyltransferase  45.82 
 
 		 302 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2535  methionyl-tRNA formyltransferase  45.82 
 
 		 302 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.614949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  44.82 
 
 		 302 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  45.48 
 
 		 297 aa  218  8.999999999999998e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  42.57 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3147  methionyl-tRNA formyltransferase  45.77 
 
 		 313 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  0.377579 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  41.39 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  41.39 
 
 		 315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  40.73 
 
 		 315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  41.39 
 
 		 315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  41.39 
 
 		 315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  41.39 
 
 		 315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  39.03 
 
 		 312 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  40.4 
 
 		 315 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  40.4 
 
 		 315 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  40.4 
 
 		 315 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  40.4 
 
 		 315 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  40.4 
 
 		 315 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  40.4 
 
 		 315 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  40.07 
 
 		 315 aa  212  9e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1320  methionyl-tRNA formyltransferase  40.06 
 
 		 309 aa  211  1e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  38.66 
 
 		 314 aa  211  2e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  38.66 
 
 		 314 aa  211  2e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1599  methionyl-tRNA formyltransferase  44.73 
 
 		 309 aa  209  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0493449 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0164  methionyl-tRNA formyltransferase  44.52 
 
 		 313 aa  209  5e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0975  methionyl-tRNA formyltransferase  42.16 
 
 		 306 aa  209  5e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.569216  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0393  methionyl-tRNA formyltransferase  41.61 
 
 		 311 aa  209  5e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  40.07 
 
 		 315 aa  209  6e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0446  methionyl-tRNA formyltransferase  41.27 
 
 		 311 aa  209  6e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  42.04 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1034  methionyl-tRNA formyltransferase  42.16 
 
 		 306 aa  207  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.79271  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3304  methionyl-tRNA formyltransferase  45.48 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0607232  normal  0.664052 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  41.19 
 
 		 314 aa  207  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 312 aa  207  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1635  methionyl-tRNA formyltransferase  45.43 
 
 		 309 aa  207  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.138536  normal  0.117912 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  41.5 
 
 		 318 aa  206  4e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  38.46 
 
 		 315 aa  206  4e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1345  methionyl-tRNA formyltransferase  42.16 
 
 		 306 aa  206  5e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  38.14 
 
 		 311 aa  206  5e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  38.59 
 
 		 315 aa  206  6e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  38.32 
 
 		 320 aa  206  6e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  41.14 
 
 		 307 aa  205  7e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  40.88 
 
 		 310 aa  205  7e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  38.91 
 
 		 324 aa  203  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00190  methionyl-tRNA formyltransferase  41.69 
 
 		 314 aa  203  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.767541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  41.4 
 
 		 310 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  38.14 
 
 		 315 aa  203  4e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  39.94 
 
 		 314 aa  202  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  40.58 
 
 		 310 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  38.08 
 
 		 311 aa  202  7e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  41.4 
 
 		 310 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  36.82 
 
 		 312 aa  202  7e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1917  methionyl-tRNA formyltransferase  44.76 
 
 		 309 aa  202  8e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.741308  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  39.07 
 
 		 313 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  39.35 
 
 		 308 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823971 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7336  methionyl-tRNA formyltransferase  43.04 
 
 		 311 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.685492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  37.09 
 
 		 315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  38.26 
 
 		 315 aa  200  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>