More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3147 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3147  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 313 aa  609  1e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  0.377579 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1635  methionyl-tRNA formyltransferase  81.79 
 
 		 309 aa  496  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.138536  normal  0.117912 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1917  methionyl-tRNA formyltransferase  80.83 
 
 		 309 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.741308  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1599  methionyl-tRNA formyltransferase  79.49 
 
 		 309 aa  486  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0493449 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  72.44 
 
 		 310 aa  436  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4748  methionyl-tRNA formyltransferase  70.19 
 
 		 310 aa  427  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130868  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7336  methionyl-tRNA formyltransferase  62.1 
 
 		 311 aa  368  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.685492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3304  methionyl-tRNA formyltransferase  66.13 
 
 		 307 aa  364  1e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0607232  normal  0.664052 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0626  methionyl-tRNA formyltransferase  60.06 
 
 		 310 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274146  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0674  methionyl-tRNA formyltransferase  61.22 
 
 		 312 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3065  methionyl-tRNA formyltransferase  59.49 
 
 		 314 aa  349  4e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38579  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1345  methionyl-tRNA formyltransferase  58.12 
 
 		 306 aa  348  6e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0080  methionyl-tRNA formyltransferase  60 
 
 		 310 aa  348  9e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.450016  normal  0.0632026 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1034  methionyl-tRNA formyltransferase  57.33 
 
 		 306 aa  342  4e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.79271  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1129  methionyl-tRNA formyltransferase  62.01 
 
 		 312 aa  341  1e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158103 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0975  methionyl-tRNA formyltransferase  57 
 
 		 306 aa  340  2e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.569216  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0541  methionyl-tRNA formyltransferase  57.1 
 
 		 320 aa  339  4e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.743734  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0497  methionyl-tRNA formyltransferase  58.01 
 
 		 317 aa  338  7e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.12463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0058  methionyl-tRNA formyltransferase  56.87 
 
 		 311 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.820848  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0806  methionyl-tRNA formyltransferase  61.36 
 
 		 310 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.283838 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  56.59 
 
 		 310 aa  335  3.9999999999999995e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3694  methionyl-tRNA formyltransferase  60.9 
 
 		 310 aa  333  2e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0055  methionyl-tRNA formyltransferase  56.37 
 
 		 311 aa  332  4e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000555853 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0393  methionyl-tRNA formyltransferase  55.59 
 
 		 311 aa  331  8e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0075  methionyl-tRNA formyltransferase  56.23 
 
 		 311 aa  331  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.716754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2577  methionyl-tRNA formyltransferase  56.41 
 
 		 308 aa  318  7.999999999999999e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  hitchhiker  0.000000800769 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0446  methionyl-tRNA formyltransferase  55.59 
 
 		 311 aa  318  9e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4568  methionyl-tRNA formyltransferase  54.26 
 
 		 312 aa  302  5.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  55.56 
 
 		 297 aa  298  7e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  54.52 
 
 		 302 aa  293  3e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0181  methionyl-tRNA formyltransferase  55.23 
 
 		 299 aa  292  5e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.142178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1320  methionyl-tRNA formyltransferase  49.68 
 
 		 309 aa  291  1e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2535  methionyl-tRNA formyltransferase  54.02 
 
 		 302 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.614949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0875  methionyl-tRNA formyltransferase  53.05 
 
 		 302 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  51.28 
 
 		 301 aa  289  4e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0249  methionyl-tRNA formyltransferase  50.8 
 
 		 306 aa  282  6.000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.153512 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4042  methionyl-tRNA formyltransferase  50.64 
 
 		 308 aa  276  3e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2894  methionyl-tRNA formyltransferase  49.84 
 
 		 301 aa  275  6e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3351  methionyl-tRNA formyltransferase  52.63 
 
 		 309 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  51.88 
 
 		 314 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0347  methionyl-tRNA formyltransferase  47.3 
 
 		 305 aa  265  1e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.342124  normal  0.0280325 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00190  methionyl-tRNA formyltransferase  52.22 
 
 		 314 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.767541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  49.53 
 
 		 319 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  49.84 
 
 		 310 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  49.21 
 
 		 314 aa  261  8e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  49.21 
 
 		 310 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  49.21 
 
 		 310 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  49.83 
 
 		 310 aa  258  8e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  48.9 
 
 		 310 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  46.35 
 
 		 312 aa  258  1e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0018  methionyl-tRNA formyltransferase  51.19 
 
 		 314 aa  256  4e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04056  methionyl-tRNA formyltransferase  48.54 
 
 		 307 aa  256  5e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  47.94 
 
 		 307 aa  255  7e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  44.65 
 
 		 311 aa  254  1.0000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1864  methionyl-tRNA formyltransferase  49.35 
 
 		 307 aa  253  4.0000000000000004e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  44.3 
 
 		 315 aa  252  6e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  44.3 
 
 		 315 aa  252  6e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  44.3 
 
 		 315 aa  252  6e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  44.3 
 
 		 315 aa  252  6e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  44.3 
 
 		 315 aa  252  6e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  43.99 
 
 		 315 aa  251  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  44.3 
 
 		 315 aa  251  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  44.3 
 
 		 315 aa  250  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1928  methionyl-tRNA formyltransferase  49.03 
 
 		 307 aa  250  2e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  43.99 
 
 		 315 aa  249  4e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2868  methionyl-tRNA formyltransferase  46.88 
 
 		 325 aa  248  8e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  44.41 
 
 		 320 aa  245  6e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  42.59 
 
 		 318 aa  245  6e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  46.69 
 
 		 318 aa  245  8e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3354  methionyl-tRNA formyltransferase  46.63 
 
 		 327 aa  245  9e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  42.41 
 
 		 317 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0351  methionyl-tRNA formyltransferase  45.37 
 
 		 322 aa  244  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.227981 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  42.59 
 
 		 318 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  47.9 
 
 		 307 aa  243  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  40.82 
 
 		 311 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  44.3 
 
 		 315 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  44.3 
 
 		 315 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  44.3 
 
 		 315 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  44.3 
 
 		 315 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  41.32 
 
 		 318 aa  242  5e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  43.99 
 
 		 315 aa  242  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  42.27 
 
 		 318 aa  242  7e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3677  methionyl-tRNA formyltransferase  45.12 
 
 		 327 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  43.99 
 
 		 315 aa  241  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  42.86 
 
 		 312 aa  240  2e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  41.46 
 
 		 313 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00160  methionyl-tRNA formyltransferase  51.19 
 
 		 325 aa  239  4e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0831  methionyl-tRNA formyltransferase  46.75 
 
 		 327 aa  239  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0410  methionyl-tRNA formyltransferase  46.18 
 
 		 301 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3398  methionyl-tRNA formyltransferase  46.77 
 
 		 323 aa  238  6.999999999999999e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.726388  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  41.77 
 
 		 318 aa  238  6.999999999999999e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  42.41 
 
 		 314 aa  238  8e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4053  methionyl-tRNA formyltransferase  46.77 
 
 		 323 aa  238  9e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  40.51 
 
 		 318 aa  237  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2078  methionyl-tRNA formyltransferase  47.1 
 
 		 332 aa  236  3e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  43.04 
 
 		 308 aa  236  3e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823971 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  44.26 
 
 		 315 aa  236  3e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3564  methionyl-tRNA formyltransferase  45.23 
 
 		 344 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  40.51 
 
 		 318 aa  235  6e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  41.77 
 
 		 314 aa  235  6e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>