More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2442 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2442  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 316 aa  621  1e-177  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0870633  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1368  methionyl-tRNA formyltransferase  68.39 
 
 		 309 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0580352 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3000  methionyl-tRNA formyltransferase  67.99 
 
 		 308 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0437614  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2825  methionyl-tRNA formyltransferase  64.63 
 
 		 309 aa  389  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1075  methionyl-tRNA formyltransferase  65.16 
 
 		 310 aa  385  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0107606  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1862  methionyl-tRNA formyltransferase  64.05 
 
 		 308 aa  370  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5224  methionyl-tRNA formyltransferase  62.26 
 
 		 310 aa  365  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373009  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15680  methionyl-tRNA formyltransferase  62.21 
 
 		 307 aa  367  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.153254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1869  methionyl-tRNA formyltransferase  62.42 
 
 		 308 aa  367  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.573172 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3119  methionyl-tRNA formyltransferase  63.07 
 
 		 309 aa  362  3e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0854  methionyl-tRNA formyltransferase  60.32 
 
 		 311 aa  361  7.0000000000000005e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0108509  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3190  methionyl-tRNA formyltransferase  57.85 
 
 		 337 aa  354  1e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000305844  normal  0.338989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3099  methionyl-tRNA formyltransferase  59.03 
 
 		 315 aa  348  7e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1278  methionyl-tRNA formyltransferase  58.82 
 
 		 324 aa  347  1e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0156282  normal  0.148843 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2575  methionyl-tRNA formyltransferase  61.33 
 
 		 308 aa  347  1e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0532653 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1719  methionyl-tRNA formyltransferase  62.17 
 
 		 311 aa  345  7e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.296625  hitchhiker  0.00236307 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18090  methionyl-tRNA formyltransferase  60.45 
 
 		 315 aa  344  1e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.783991  normal  0.456867 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2687  methionyl-tRNA formyltransferase  63.61 
 
 		 310 aa  344  1e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225803  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1855  methionyl-tRNA formyltransferase  60.13 
 
 		 319 aa  343  2e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1017  normal  0.411821 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4156  methionyl-tRNA formyltransferase  59.68 
 
 		 307 aa  339  2.9999999999999998e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.413206  hitchhiker  0.00887894 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3730  methionyl-tRNA formyltransferase  62.95 
 
 		 310 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.132882  normal  0.0191381 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2984  methionyl-tRNA formyltransferase  59.15 
 
 		 306 aa  335  5.999999999999999e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2567  methionyl-tRNA formyltransferase  59.35 
 
 		 311 aa  330  2e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296174  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1722  methionyl-tRNA formyltransferase  58.62 
 
 		 318 aa  329  3e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.000240612  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2350  methionyl-tRNA formyltransferase  58.01 
 
 		 313 aa  327  2.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167189  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2048  methionyl-tRNA formyltransferase  57.28 
 
 		 311 aa  323  2e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0469723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2424  methionyl-tRNA formyltransferase  60.06 
 
 		 308 aa  319  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0902213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2383  methionyl-tRNA formyltransferase  60.06 
 
 		 308 aa  319  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0196795  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2430  methionyl-tRNA formyltransferase  60.06 
 
 		 308 aa  319  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119113  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11435  methionyl-tRNA formyltransferase  57.88 
 
 		 312 aa  312  4.999999999999999e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.682601  normal  0.406209 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1665  methionyl-tRNA formyltransferase  53.49 
 
 		 306 aa  292  6e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000612853 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1313  methionyl-tRNA formyltransferase  56.35 
 
 		 311 aa  287  1e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.141722 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16130  methionyl-tRNA formyltransferase  50.5 
 
 		 317 aa  286  4e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.452628  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1671  methionyl-tRNA formyltransferase  52.92 
 
 		 306 aa  286  4e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.563662  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12770  methionyl-tRNA formyltransferase  49.7 
 
 		 336 aa  285  7e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.348945  normal  0.0208178 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1966  methionyl-tRNA formyltransferase  48.14 
 
 		 328 aa  278  9e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.417449  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0899  methionyl-tRNA formyltransferase  47.47 
 
 		 327 aa  256  4e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  43.79 
 
 		 301 aa  229  5e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  41.67 
 
 		 312 aa  223  2e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  41.61 
 
 		 312 aa  223  3e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  39.55 
 
 		 311 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  43.41 
 
 		 308 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  45.4 
 
 		 310 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  42.68 
 
 		 319 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10800  methionyl-tRNA formyltransferase  45.28 
 
 		 366 aa  219  5e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0126989  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  40.58 
 
 		 317 aa  218  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  42.48 
 
 		 302 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0875  methionyl-tRNA formyltransferase  41.88 
 
 		 302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2535  methionyl-tRNA formyltransferase  41.75 
 
 		 302 aa  216  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.614949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0393  methionyl-tRNA formyltransferase  43.67 
 
 		 311 aa  216  5e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1345  methionyl-tRNA formyltransferase  43.69 
 
 		 306 aa  215  7e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3147  methionyl-tRNA formyltransferase  44.44 
 
 		 313 aa  215  9e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  0.377579 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0975  methionyl-tRNA formyltransferase  42.21 
 
 		 306 aa  215  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.569216  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  39.87 
 
 		 318 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1034  methionyl-tRNA formyltransferase  42.21 
 
 		 306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.79271  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2894  methionyl-tRNA formyltransferase  44.27 
 
 		 301 aa  213  2.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  40.44 
 
 		 311 aa  213  3.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  38.94 
 
 		 315 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  38.94 
 
 		 315 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  38.94 
 
 		 315 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  38.94 
 
 		 315 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  38.94 
 
 		 315 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  43.56 
 
 		 297 aa  212  7.999999999999999e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  38.94 
 
 		 315 aa  212  9e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4042  methionyl-tRNA formyltransferase  42.36 
 
 		 308 aa  211  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  38.94 
 
 		 315 aa  211  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  39.23 
 
 		 318 aa  210  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4832  methionyl-tRNA formyltransferase  39.47 
 
 		 306 aa  211  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000322713  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4748  methionyl-tRNA formyltransferase  43.45 
 
 		 310 aa  211  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130868  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  38.61 
 
 		 315 aa  211  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  38.78 
 
 		 314 aa  210  3e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  42.3 
 
 		 314 aa  209  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  42.12 
 
 		 318 aa  209  6e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  38.61 
 
 		 315 aa  208  8e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  41.58 
 
 		 310 aa  208  8e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  38.74 
 
 		 315 aa  208  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2868  methionyl-tRNA formyltransferase  43.99 
 
 		 325 aa  208  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  43.28 
 
 		 310 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  45.25 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  40.95 
 
 		 314 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  38.74 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  38.74 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  38.74 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  38.74 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  40.89 
 
 		 310 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1321  methionyl-tRNA formyltransferase  42.63 
 
 		 314 aa  206  4e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  39.25 
 
 		 320 aa  206  5e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  38.91 
 
 		 315 aa  206  5e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4814  methionyl-tRNA formyltransferase  39.13 
 
 		 297 aa  206  6e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  38.94 
 
 		 313 aa  206  6e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  41.58 
 
 		 310 aa  205  7e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  41.58 
 
 		 310 aa  205  8e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0446  methionyl-tRNA formyltransferase  41.1 
 
 		 311 aa  204  1e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  37.82 
 
 		 314 aa  203  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1928  methionyl-tRNA formyltransferase  43.42 
 
 		 307 aa  204  2e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1599  methionyl-tRNA formyltransferase  44.41 
 
 		 309 aa  203  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0493449 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1635  methionyl-tRNA formyltransferase  43.22 
 
 		 309 aa  204  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.138536  normal  0.117912 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  39.87 
 
 		 308 aa  203  3e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823971 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  39.02 
 
 		 311 aa  203  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7336  methionyl-tRNA formyltransferase  41.01 
 
 		 311 aa  202  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.685492  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>