More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7336 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7336  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 311 aa  620  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.685492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0674  methionyl-tRNA formyltransferase  77.02 
 
 		 312 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0626  methionyl-tRNA formyltransferase  77.17 
 
 		 310 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274146  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0080  methionyl-tRNA formyltransferase  75.57 
 
 		 310 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.450016  normal  0.0632026 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3065  methionyl-tRNA formyltransferase  74.2 
 
 		 314 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38579  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3694  methionyl-tRNA formyltransferase  76.45 
 
 		 310 aa  457  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0806  methionyl-tRNA formyltransferase  73.38 
 
 		 310 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.283838 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1345  methionyl-tRNA formyltransferase  61.72 
 
 		 306 aa  395  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1034  methionyl-tRNA formyltransferase  61.92 
 
 		 306 aa  390  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.79271  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4748  methionyl-tRNA formyltransferase  62.58 
 
 		 310 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130868  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0975  methionyl-tRNA formyltransferase  61.59 
 
 		 306 aa  387  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.569216  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3304  methionyl-tRNA formyltransferase  63.64 
 
 		 307 aa  376  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0607232  normal  0.664052 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  61.29 
 
 		 310 aa  371  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3147  methionyl-tRNA formyltransferase  62.1 
 
 		 313 aa  368  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  0.377579 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1599  methionyl-tRNA formyltransferase  60.84 
 
 		 309 aa  366  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0493449 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0393  methionyl-tRNA formyltransferase  59.68 
 
 		 311 aa  365  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0055  methionyl-tRNA formyltransferase  61.51 
 
 		 311 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000555853 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1635  methionyl-tRNA formyltransferase  60.97 
 
 		 309 aa  362  4e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.138536  normal  0.117912 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1917  methionyl-tRNA formyltransferase  60.32 
 
 		 309 aa  362  4e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.741308  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0541  methionyl-tRNA formyltransferase  57.83 
 
 		 320 aa  359  3e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.743734  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  58.31 
 
 		 310 aa  347  1e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0058  methionyl-tRNA formyltransferase  57.1 
 
 		 311 aa  347  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.820848  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0075  methionyl-tRNA formyltransferase  56.77 
 
 		 311 aa  342  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.716754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1129  methionyl-tRNA formyltransferase  60.13 
 
 		 312 aa  340  2e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158103 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1320  methionyl-tRNA formyltransferase  52.77 
 
 		 309 aa  328  5.0000000000000004e-89  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0875  methionyl-tRNA formyltransferase  56.68 
 
 		 302 aa  319  3e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2535  methionyl-tRNA formyltransferase  56.68 
 
 		 302 aa  318  5e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.614949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4568  methionyl-tRNA formyltransferase  54.37 
 
 		 312 aa  313  1.9999999999999998e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0497  methionyl-tRNA formyltransferase  51.95 
 
 		 317 aa  310  2e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.12463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  55.18 
 
 		 302 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2577  methionyl-tRNA formyltransferase  54.75 
 
 		 308 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  hitchhiker  0.000000800769 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0446  methionyl-tRNA formyltransferase  52.1 
 
 		 311 aa  298  7e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  56.19 
 
 		 297 aa  297  1e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  52.46 
 
 		 301 aa  294  1e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0181  methionyl-tRNA formyltransferase  54.85 
 
 		 299 aa  293  4e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.142178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4042  methionyl-tRNA formyltransferase  52.26 
 
 		 308 aa  290  3e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0410  methionyl-tRNA formyltransferase  51.29 
 
 		 301 aa  275  5e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0249  methionyl-tRNA formyltransferase  48.55 
 
 		 306 aa  271  1e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.153512 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0347  methionyl-tRNA formyltransferase  50 
 
 		 305 aa  271  1e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.342124  normal  0.0280325 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2894  methionyl-tRNA formyltransferase  49.19 
 
 		 301 aa  269  4e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3351  methionyl-tRNA formyltransferase  50.8 
 
 		 309 aa  268  7e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  47.12 
 
 		 308 aa  267  2e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823971 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  44.87 
 
 		 313 aa  262  6.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  45.67 
 
 		 312 aa  262  6.999999999999999e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  44.59 
 
 		 314 aa  259  4e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  44.59 
 
 		 314 aa  259  4e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  48.23 
 
 		 307 aa  258  7e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  45.9 
 
 		 314 aa  256  5e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  45.86 
 
 		 314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  45.02 
 
 		 312 aa  252  5.000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  43.13 
 
 		 321 aa  252  6e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  42.31 
 
 		 318 aa  252  6e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  42.31 
 
 		 311 aa  251  8.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3354  methionyl-tRNA formyltransferase  45.82 
 
 		 327 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04056  methionyl-tRNA formyltransferase  46.89 
 
 		 307 aa  251  2e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3677  methionyl-tRNA formyltransferase  45.82 
 
 		 327 aa  250  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2868  methionyl-tRNA formyltransferase  46.39 
 
 		 325 aa  249  3e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  41.9 
 
 		 318 aa  250  3e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1928  methionyl-tRNA formyltransferase  46.41 
 
 		 307 aa  249  4e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  42.28 
 
 		 320 aa  249  5e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  41.9 
 
 		 318 aa  249  5e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  42.31 
 
 		 317 aa  249  6e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  46.23 
 
 		 319 aa  249  6e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  41.88 
 
 		 318 aa  248  7e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0020  methionyl-tRNA formyltransferase  43.81 
 
 		 322 aa  248  7e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1864  methionyl-tRNA formyltransferase  45.75 
 
 		 307 aa  248  8e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  46.38 
 
 		 310 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  43.13 
 
 		 315 aa  248  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  47.06 
 
 		 307 aa  248  1e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  44.41 
 
 		 315 aa  246  3e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0037  methionyl-tRNA formyltransferase  41.8 
 
 		 320 aa  246  3e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00190  methionyl-tRNA formyltransferase  45.72 
 
 		 314 aa  246  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.767541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2232  methionyl-tRNA formyltransferase  42.49 
 
 		 313 aa  246  4e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  42.81 
 
 		 314 aa  246  4e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0018  methionyl-tRNA formyltransferase  45.25 
 
 		 314 aa  245  6e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  46.38 
 
 		 310 aa  245  6e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  44.69 
 
 		 320 aa  245  6e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.601603  normal  0.144256 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3877  methionyl-tRNA formyltransferase  44.2 
 
 		 323 aa  245  6.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  40.63 
 
 		 318 aa  245  8e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  45.72 
 
 		 310 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  41.4 
 
 		 318 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  41.27 
 
 		 318 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  43.81 
 
 		 315 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  41.4 
 
 		 318 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  43.75 
 
 		 310 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  41.4 
 
 		 318 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188499 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  43.49 
 
 		 315 aa  243  3e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  43.49 
 
 		 315 aa  243  3e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  43.49 
 
 		 315 aa  243  3e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  43.49 
 
 		 315 aa  243  3e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  43.49 
 
 		 315 aa  243  3e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  43.49 
 
 		 315 aa  243  3e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0074  methionyl-tRNA formyltransferase  41.31 
 
 		 321 aa  243  3.9999999999999997e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4638  methionyl-tRNA formyltransferase  45.99 
 
 		 357 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.857325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  45.39 
 
 		 310 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  41.8 
 
 		 329 aa  242  5e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0590691 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  43.79 
 
 		 311 aa  242  5e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  41.08 
 
 		 318 aa  242  6e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  42.86 
 
 		 315 aa  242  6e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3859  methionyl-tRNA formyltransferase  44.24 
 
 		 323 aa  241  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>