More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1075 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1075  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 310 aa  608  1e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0107606  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3000  methionyl-tRNA formyltransferase  75.91 
 
 		 308 aa  455  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0437614  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0854  methionyl-tRNA formyltransferase  72.9 
 
 		 311 aa  437  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0108509  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1368  methionyl-tRNA formyltransferase  72.4 
 
 		 309 aa  430  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0580352 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2825  methionyl-tRNA formyltransferase  71.52 
 
 		 309 aa  426  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5224  methionyl-tRNA formyltransferase  68.61 
 
 		 310 aa  396  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373009  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3099  methionyl-tRNA formyltransferase  64.33 
 
 		 315 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2442  methionyl-tRNA formyltransferase  65.81 
 
 		 316 aa  388  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0870633  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3119  methionyl-tRNA formyltransferase  64.8 
 
 		 309 aa  376  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1862  methionyl-tRNA formyltransferase  64.59 
 
 		 308 aa  376  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15680  methionyl-tRNA formyltransferase  68.08 
 
 		 307 aa  373  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.153254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1869  methionyl-tRNA formyltransferase  63.93 
 
 		 308 aa  374  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.573172 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1719  methionyl-tRNA formyltransferase  66.77 
 
 		 311 aa  370  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.296625  hitchhiker  0.00236307 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1278  methionyl-tRNA formyltransferase  61.61 
 
 		 324 aa  364  1e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0156282  normal  0.148843 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2575  methionyl-tRNA formyltransferase  60.73 
 
 		 308 aa  357  9.999999999999999e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0532653 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18090  methionyl-tRNA formyltransferase  61.66 
 
 		 315 aa  353  2e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.783991  normal  0.456867 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2984  methionyl-tRNA formyltransferase  61.24 
 
 		 306 aa  350  3e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1722  methionyl-tRNA formyltransferase  62.74 
 
 		 318 aa  347  1e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.000240612  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2567  methionyl-tRNA formyltransferase  61.94 
 
 		 311 aa  347  2e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296174  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3190  methionyl-tRNA formyltransferase  60.31 
 
 		 337 aa  345  4e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000305844  normal  0.338989 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1855  methionyl-tRNA formyltransferase  60.7 
 
 		 319 aa  341  7e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1017  normal  0.411821 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2350  methionyl-tRNA formyltransferase  59.55 
 
 		 313 aa  327  2.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167189  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2424  methionyl-tRNA formyltransferase  62.91 
 
 		 308 aa  322  3e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0902213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2383  methionyl-tRNA formyltransferase  62.91 
 
 		 308 aa  322  3e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0196795  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2430  methionyl-tRNA formyltransferase  62.91 
 
 		 308 aa  322  3e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119113  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11435  methionyl-tRNA formyltransferase  61.24 
 
 		 312 aa  321  9.000000000000001e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.682601  normal  0.406209 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3730  methionyl-tRNA formyltransferase  61.81 
 
 		 310 aa  320  9.999999999999999e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.132882  normal  0.0191381 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4156  methionyl-tRNA formyltransferase  58.12 
 
 		 307 aa  315  6e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.413206  hitchhiker  0.00887894 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1665  methionyl-tRNA formyltransferase  54.72 
 
 		 306 aa  315  7e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000612853 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12770  methionyl-tRNA formyltransferase  53.59 
 
 		 336 aa  314  9.999999999999999e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.348945  normal  0.0208178 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2687  methionyl-tRNA formyltransferase  60.4 
 
 		 310 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2048  methionyl-tRNA formyltransferase  54.52 
 
 		 311 aa  311  6.999999999999999e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0469723 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1671  methionyl-tRNA formyltransferase  56.68 
 
 		 306 aa  305  8.000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.563662  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1313  methionyl-tRNA formyltransferase  56.41 
 
 		 311 aa  297  2e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.141722 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16130  methionyl-tRNA formyltransferase  50.32 
 
 		 317 aa  290  2e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.452628  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0899  methionyl-tRNA formyltransferase  49.21 
 
 		 327 aa  259  6e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1966  methionyl-tRNA formyltransferase  44.27 
 
 		 328 aa  243  3e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.417449  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  44.16 
 
 		 308 aa  232  5e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3920  methionyl-tRNA formyltransferase  43.41 
 
 		 325 aa  229  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  42.37 
 
 		 320 aa  226  4e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  40.13 
 
 		 312 aa  223  3e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  40.45 
 
 		 312 aa  223  4e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  43.75 
 
 		 301 aa  223  4e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  37.01 
 
 		 310 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  43.18 
 
 		 359 aa  219  3e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3225  methionyl-tRNA formyltransferase  42.26 
 
 		 313 aa  219  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0188786 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10800  methionyl-tRNA formyltransferase  45.45 
 
 		 366 aa  217  2e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0126989  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  43 
 
 		 314 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4042  methionyl-tRNA formyltransferase  43.51 
 
 		 308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  41.75 
 
 		 318 aa  212  5.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  38.71 
 
 		 317 aa  211  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  36.33 
 
 		 312 aa  211  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0817  methionyl-tRNA formyltransferase  40.13 
 
 		 316 aa  210  3e-53  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  42.3 
 
 		 310 aa  209  3e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  36.13 
 
 		 311 aa  209  4e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  37.62 
 
 		 311 aa  209  4e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1321  methionyl-tRNA formyltransferase  42.53 
 
 		 314 aa  209  6e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  37.21 
 
 		 314 aa  208  9e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  40.34 
 
 		 315 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  40.34 
 
 		 315 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  40.34 
 
 		 315 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  41.42 
 
 		 311 aa  208  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  37.86 
 
 		 318 aa  208  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  40.34 
 
 		 315 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  40.34 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  37.22 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  36.88 
 
 		 314 aa  206  3e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  36.89 
 
 		 315 aa  206  4e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  39.66 
 
 		 315 aa  206  5e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  39.66 
 
 		 315 aa  206  5e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  39.66 
 
 		 315 aa  206  5e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  39.66 
 
 		 315 aa  206  5e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  39.66 
 
 		 315 aa  206  5e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  39.32 
 
 		 315 aa  205  9e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  38.98 
 
 		 315 aa  205  9e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  37.22 
 
 		 311 aa  204  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  38.98 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1921  hypothetical protein  38.85 
 
 		 297 aa  203  2e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4832  methionyl-tRNA formyltransferase  37.54 
 
 		 306 aa  204  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000322713  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1334  methionyl-tRNA formyltransferase  35.28 
 
 		 313 aa  202  4e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0783821  normal  0.599523 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1928  methionyl-tRNA formyltransferase  43.23 
 
 		 307 aa  202  4e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  38.54 
 
 		 311 aa  202  4e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  39.53 
 
 		 313 aa  202  5e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1221  methionyl-tRNA formyltransferase  37.7 
 
 		 304 aa  202  6e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.820089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  40.89 
 
 		 319 aa  201  9e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2894  methionyl-tRNA formyltransferase  41.75 
 
 		 301 aa  201  9e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  38.98 
 
 		 315 aa  201  9.999999999999999e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4814  methionyl-tRNA formyltransferase  37.37 
 
 		 297 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2183  methionyl-tRNA formyltransferase  39.94 
 
 		 318 aa  200  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  39.13 
 
 		 311 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2313  methionyl-tRNA formyltransferase  36.22 
 
 		 312 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490925  hitchhiker  0.0006759 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1176  methionyl-tRNA formyltransferase  34.3 
 
 		 309 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0139658  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1864  methionyl-tRNA formyltransferase  42.57 
 
 		 307 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  41.91 
 
 		 297 aa  199  3.9999999999999996e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  43.89 
 
 		 307 aa  199  5e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4228  methionyl-tRNA formyltransferase  39.68 
 
 		 312 aa  199  6e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1490  methionyl-tRNA formyltransferase  36.63 
 
 		 316 aa  199  6e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0079  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 316 aa  199  6e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  38.82 
 
 		 315 aa  198  9e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0943  methionyl-tRNA formyltransferase  36.83 
 
 		 326 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>