More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1869 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1869  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 308 aa  596  1e-169  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.573172 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1862  methionyl-tRNA formyltransferase  90.26 
 
 		 308 aa  546  1e-154  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2575  methionyl-tRNA formyltransferase  68.21 
 
 		 308 aa  410  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0532653 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3000  methionyl-tRNA formyltransferase  64.82 
 
 		 308 aa  402  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0437614  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15680  methionyl-tRNA formyltransferase  65.36 
 
 		 307 aa  384  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.153254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3099  methionyl-tRNA formyltransferase  60.51 
 
 		 315 aa  372  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1368  methionyl-tRNA formyltransferase  62.38 
 
 		 309 aa  374  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0580352 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2825  methionyl-tRNA formyltransferase  63.46 
 
 		 309 aa  373  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1075  methionyl-tRNA formyltransferase  63.93 
 
 		 310 aa  370  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0107606  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1719  methionyl-tRNA formyltransferase  63.99 
 
 		 311 aa  367  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.296625  hitchhiker  0.00236307 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2442  methionyl-tRNA formyltransferase  62.42 
 
 		 316 aa  367  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0870633  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3190  methionyl-tRNA formyltransferase  59.88 
 
 		 337 aa  359  3e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000305844  normal  0.338989 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0854  methionyl-tRNA formyltransferase  60.93 
 
 		 311 aa  355  5e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0108509  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3119  methionyl-tRNA formyltransferase  62.25 
 
 		 309 aa  352  4e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5224  methionyl-tRNA formyltransferase  60.32 
 
 		 310 aa  351  1e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373009  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18090  methionyl-tRNA formyltransferase  63.19 
 
 		 315 aa  348  6e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.783991  normal  0.456867 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1855  methionyl-tRNA formyltransferase  61.36 
 
 		 319 aa  348  7e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1017  normal  0.411821 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2984  methionyl-tRNA formyltransferase  61.31 
 
 		 306 aa  342  2.9999999999999997e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1278  methionyl-tRNA formyltransferase  57.01 
 
 		 324 aa  336  1.9999999999999998e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0156282  normal  0.148843 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2350  methionyl-tRNA formyltransferase  58.97 
 
 		 313 aa  335  5.999999999999999e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167189  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2567  methionyl-tRNA formyltransferase  60.26 
 
 		 311 aa  334  1e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296174  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1722  methionyl-tRNA formyltransferase  59.48 
 
 		 318 aa  329  3e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.000240612  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2048  methionyl-tRNA formyltransferase  58.47 
 
 		 311 aa  324  1e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0469723 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2687  methionyl-tRNA formyltransferase  58.42 
 
 		 310 aa  322  4e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1665  methionyl-tRNA formyltransferase  57 
 
 		 306 aa  318  7.999999999999999e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000612853 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1671  methionyl-tRNA formyltransferase  58.96 
 
 		 306 aa  318  7.999999999999999e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.563662  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3730  methionyl-tRNA formyltransferase  57.95 
 
 		 310 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.132882  normal  0.0191381 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4156  methionyl-tRNA formyltransferase  55.05 
 
 		 307 aa  308  5.9999999999999995e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.413206  hitchhiker  0.00887894 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12770  methionyl-tRNA formyltransferase  52.87 
 
 		 336 aa  305  7e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.348945  normal  0.0208178 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2424  methionyl-tRNA formyltransferase  56.91 
 
 		 308 aa  302  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0902213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2383  methionyl-tRNA formyltransferase  56.91 
 
 		 308 aa  302  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0196795  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2430  methionyl-tRNA formyltransferase  56.91 
 
 		 308 aa  302  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119113  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11435  methionyl-tRNA formyltransferase  56.07 
 
 		 312 aa  295  8e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.682601  normal  0.406209 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16130  methionyl-tRNA formyltransferase  51.16 
 
 		 317 aa  285  5.999999999999999e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.452628  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1313  methionyl-tRNA formyltransferase  54.49 
 
 		 311 aa  285  7e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.141722 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1966  methionyl-tRNA formyltransferase  48.14 
 
 		 328 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.417449  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0899  methionyl-tRNA formyltransferase  45.51 
 
 		 327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  40.88 
 
 		 314 aa  229  4e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  40.2 
 
 		 314 aa  229  6e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  41.69 
 
 		 312 aa  228  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10800  methionyl-tRNA formyltransferase  47.08 
 
 		 366 aa  219  3.9999999999999997e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0126989  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  44.52 
 
 		 318 aa  216  5e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  39.31 
 
 		 320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  44.23 
 
 		 310 aa  211  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1034  methionyl-tRNA formyltransferase  42.02 
 
 		 306 aa  210  2e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.79271  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0975  methionyl-tRNA formyltransferase  42.02 
 
 		 306 aa  209  4e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.569216  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  42.62 
 
 		 310 aa  209  7e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  40.68 
 
 		 308 aa  207  1e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  43.81 
 
 		 297 aa  206  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4748  methionyl-tRNA formyltransferase  42.63 
 
 		 310 aa  206  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130868  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  40.06 
 
 		 310 aa  206  4e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04056  methionyl-tRNA formyltransferase  43.71 
 
 		 307 aa  205  7e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  36.69 
 
 		 312 aa  205  9e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3147  methionyl-tRNA formyltransferase  44.27 
 
 		 313 aa  205  9e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  0.377579 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  38.98 
 
 		 314 aa  204  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  40.2 
 
 		 307 aa  204  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  39.32 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  39.41 
 
 		 301 aa  203  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1345  methionyl-tRNA formyltransferase  41.04 
 
 		 306 aa  204  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1231  methionyl-tRNA formyltransferase  34.63 
 
 		 314 aa  204  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000178496  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  36.72 
 
 		 315 aa  202  4e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1386  methionyl-tRNA formyltransferase  39.41 
 
 		 315 aa  202  4e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.442669  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3304  methionyl-tRNA formyltransferase  43.41 
 
 		 307 aa  202  5e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0607232  normal  0.664052 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  39.32 
 
 		 315 aa  202  5e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  36.39 
 
 		 311 aa  202  5e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  39.32 
 
 		 315 aa  202  6e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  39.32 
 
 		 315 aa  202  6e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  39.32 
 
 		 315 aa  202  6e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  39.32 
 
 		 315 aa  202  6e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  39.32 
 
 		 315 aa  202  6e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0393  methionyl-tRNA formyltransferase  41.03 
 
 		 311 aa  202  6e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1524  methionyl-tRNA formyltransferase  39.94 
 
 		 320 aa  202  6e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  39.32 
 
 		 315 aa  202  6e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  36.95 
 
 		 312 aa  202  7e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  39.32 
 
 		 315 aa  202  8e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  37.97 
 
 		 315 aa  201  9e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  37.97 
 
 		 315 aa  201  9e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  38.98 
 
 		 315 aa  201  9e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  40.2 
 
 		 311 aa  201  9e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  37.97 
 
 		 315 aa  201  9e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  38.98 
 
 		 315 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  37.94 
 
 		 313 aa  200  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  36.77 
 
 		 314 aa  199  3.9999999999999996e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  34.74 
 
 		 311 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  36.77 
 
 		 314 aa  199  3.9999999999999996e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0079  methionyl-tRNA formyltransferase  37.63 
 
 		 316 aa  199  5e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4042  methionyl-tRNA formyltransferase  41.67 
 
 		 308 aa  199  7e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1176  methionyl-tRNA formyltransferase  38.11 
 
 		 309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0139658  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1320  methionyl-tRNA formyltransferase  38.31 
 
 		 309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  37.05 
 
 		 317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  37.74 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0547193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  34.19 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  39.54 
 
 		 302 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0943  methionyl-tRNA formyltransferase  35.16 
 
 		 326 aa  196  3e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1928  methionyl-tRNA formyltransferase  42.24 
 
 		 307 aa  196  5.000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0094  methionyl-tRNA formyltransferase  40.78 
 
 		 320 aa  196  5.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.922112  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2474  methionyl-tRNA formyltransferase  36.27 
 
 		 315 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2894  methionyl-tRNA formyltransferase  42.07 
 
 		 301 aa  196  5.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1221  methionyl-tRNA formyltransferase  35.08 
 
 		 304 aa  196  5.000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.820089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  39.39 
 
 		 315 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>