More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4832 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4832  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 306 aa  611  9.999999999999999e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000322713  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3920  methionyl-tRNA formyltransferase  56.62 
 
 		 325 aa  335  3.9999999999999995e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3225  methionyl-tRNA formyltransferase  57.28 
 
 		 313 aa  335  7e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0188786 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0597  methionyl-tRNA formyltransferase  57 
 
 		 309 aa  324  1e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.411489  normal  0.365023 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1386  methionyl-tRNA formyltransferase  41.45 
 
 		 315 aa  236  3e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.442669  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1642  methionyl-tRNA formyltransferase  42.3 
 
 		 312 aa  233  3e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  41.89 
 
 		 315 aa  230  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1524  methionyl-tRNA formyltransferase  41.64 
 
 		 320 aa  229  3e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  41.58 
 
 		 308 aa  229  4e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  39.67 
 
 		 315 aa  229  4e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  41.55 
 
 		 315 aa  229  5e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  40.2 
 
 		 314 aa  229  6e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  40.13 
 
 		 311 aa  222  6e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  44.41 
 
 		 318 aa  221  8e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  39.46 
 
 		 312 aa  220  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  40.2 
 
 		 315 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  39.86 
 
 		 315 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  39.86 
 
 		 315 aa  218  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0782  methionyl-tRNA formyltransferase  37.95 
 
 		 310 aa  218  1e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.606283  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  39.86 
 
 		 315 aa  218  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  39.86 
 
 		 315 aa  218  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  39.86 
 
 		 315 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  39.86 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  39.86 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  39.53 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0943  methionyl-tRNA formyltransferase  40.55 
 
 		 326 aa  216  4e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  40.2 
 
 		 313 aa  215  8e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  39.8 
 
 		 313 aa  215  8e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  41.12 
 
 		 311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  38.85 
 
 		 315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  38.08 
 
 		 318 aa  211  9e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2272  methionyl-tRNA formyltransferase  42.62 
 
 		 320 aa  211  1e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00775496 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2442  methionyl-tRNA formyltransferase  39.47 
 
 		 316 aa  211  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0870633  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  39.53 
 
 		 314 aa  209  5e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  39.86 
 
 		 310 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  40.54 
 
 		 310 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  38.51 
 
 		 315 aa  209  5e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  38.51 
 
 		 315 aa  209  5e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  38.51 
 
 		 315 aa  209  5e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  38.85 
 
 		 315 aa  208  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  38.85 
 
 		 315 aa  208  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  38.85 
 
 		 315 aa  208  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  38.85 
 
 		 315 aa  208  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  38.85 
 
 		 315 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0015  methionyl-tRNA formyltransferase  45 
 
 		 309 aa  207  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.229268 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  37.75 
 
 		 318 aa  208  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  36.19 
 
 		 320 aa  208  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3000  methionyl-tRNA formyltransferase  38.8 
 
 		 308 aa  206  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0437614  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 310 aa  206  3e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  39.86 
 
 		 310 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  39.86 
 
 		 310 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  40.2 
 
 		 314 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0074  methionyl-tRNA formyltransferase  39.39 
 
 		 321 aa  204  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  38.13 
 
 		 316 aa  204  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  39.19 
 
 		 310 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1300  methionyl-tRNA formyltransferase  35.97 
 
 		 311 aa  204  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247026  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1275  methionyl-tRNA formyltransferase  35.97 
 
 		 311 aa  204  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  39.19 
 
 		 312 aa  203  3e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  38.85 
 
 		 329 aa  202  4e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0590691 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  39.53 
 
 		 319 aa  202  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2084  methionyl-tRNA formyltransferase  40.67 
 
 		 311 aa  202  6e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198796  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  38.98 
 
 		 309 aa  202  8e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0547193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1278  methionyl-tRNA formyltransferase  38.29 
 
 		 324 aa  202  8e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0156282  normal  0.148843 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1075  methionyl-tRNA formyltransferase  37.54 
 
 		 310 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0107606  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3015  methionyl-tRNA formyltransferase  41.08 
 
 		 323 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  34.44 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0020  methionyl-tRNA formyltransferase  39.74 
 
 		 313 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1321  methionyl-tRNA formyltransferase  38.94 
 
 		 314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0021  methionyl-tRNA formyltransferase  39.74 
 
 		 313 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.223082 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  34.98 
 
 		 314 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1231  methionyl-tRNA formyltransferase  36.33 
 
 		 314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000178496  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  38.93 
 
 		 312 aa  199  3e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4156  methionyl-tRNA formyltransferase  38.61 
 
 		 307 aa  200  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.413206  hitchhiker  0.00887894 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2491  methionyl-tRNA formyltransferase  36.57 
 
 		 319 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  36.82 
 
 		 321 aa  199  6e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  37.84 
 
 		 318 aa  198  7e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  37.22 
 
 		 318 aa  198  9e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  37.5 
 
 		 318 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0018  methionyl-tRNA formyltransferase  40.2 
 
 		 314 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  37.84 
 
 		 318 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00190  methionyl-tRNA formyltransferase  39.19 
 
 		 314 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.767541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  37.84 
 
 		 318 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  36.07 
 
 		 311 aa  196  5.000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  37.75 
 
 		 314 aa  196  6e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  34.65 
 
 		 312 aa  196  6e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  36.42 
 
 		 313 aa  195  7e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3689  methionyl-tRNA formyltransferase  33 
 
 		 314 aa  195  9e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2474  methionyl-tRNA formyltransferase  38.18 
 
 		 315 aa  195  9e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  38.51 
 
 		 324 aa  194  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0079  methionyl-tRNA formyltransferase  36.27 
 
 		 316 aa  194  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0347  methionyl-tRNA formyltransferase  38.69 
 
 		 301 aa  194  2e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000190251  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  40.2 
 
 		 308 aa  193  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823971 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2729  methionyl-tRNA formyltransferase  35.87 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  37.29 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0037  methionyl-tRNA formyltransferase  36.36 
 
 		 320 aa  194  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  40.2 
 
 		 307 aa  193  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1665  methionyl-tRNA formyltransferase  37.91 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000612853 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  34.65 
 
 		 317 aa  193  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  37.16 
 
 		 318 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  38.18 
 
 		 318 aa  193  3e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>