More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2729 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2729  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 334 aa  668    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2491  methionyl-tRNA formyltransferase  38.04 
 
 		 319 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  39.21 
 
 		 312 aa  212  7.999999999999999e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  41.96 
 
 		 315 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  41.96 
 
 		 315 aa  211  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  41.96 
 
 		 315 aa  211  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  41.96 
 
 		 315 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  41.96 
 
 		 315 aa  211  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  41.64 
 
 		 315 aa  210  3e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  41.32 
 
 		 315 aa  209  7e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  39.75 
 
 		 310 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  41.01 
 
 		 315 aa  207  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  38.91 
 
 		 311 aa  206  6e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  39.75 
 
 		 310 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  41.01 
 
 		 315 aa  206  6e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  39.75 
 
 		 310 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  41.19 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  39.31 
 
 		 315 aa  203  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  38.05 
 
 		 314 aa  204  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  41.19 
 
 		 315 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  41.19 
 
 		 315 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  41.19 
 
 		 315 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  41.19 
 
 		 315 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  38.65 
 
 		 308 aa  202  7e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  37.74 
 
 		 314 aa  199  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  38.61 
 
 		 319 aa  199  5e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  37.27 
 
 		 318 aa  199  5e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0943  methionyl-tRNA formyltransferase  36.25 
 
 		 326 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  35.09 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2040  methionyl-tRNA formyltransferase  37.54 
 
 		 369 aa  196  3e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4832  methionyl-tRNA formyltransferase  35.87 
 
 		 306 aa  196  5.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000322713  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  36.7 
 
 		 320 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  38.49 
 
 		 310 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  39.12 
 
 		 314 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  38.99 
 
 		 315 aa  196  7e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  38.99 
 
 		 315 aa  196  7e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  38.99 
 
 		 315 aa  196  7e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  37.42 
 
 		 314 aa  195  8.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  37.5 
 
 		 318 aa  195  9e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0513  methionyl-tRNA formyltransferase  36.45 
 
 		 319 aa  194  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  37.74 
 
 		 313 aa  193  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3689  methionyl-tRNA formyltransferase  35.47 
 
 		 314 aa  193  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0817  methionyl-tRNA formyltransferase  35.62 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3920  methionyl-tRNA formyltransferase  36.62 
 
 		 325 aa  191  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  35.59 
 
 		 359 aa  191  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3225  methionyl-tRNA formyltransferase  38.04 
 
 		 313 aa  191  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0188786 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  37.23 
 
 		 317 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0972  methionyl-tRNA formyltransferase  37.93 
 
 		 314 aa  191  2e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.319816  normal  0.276171 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  35.08 
 
 		 314 aa  190  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  36.28 
 
 		 330 aa  191  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  37.5 
 
 		 318 aa  189  4e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2842  methionyl-tRNA formyltransferase  36.7 
 
 		 337 aa  190  4e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.409607  normal  0.026297 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0410  methionyl-tRNA formyltransferase  39.14 
 
 		 301 aa  189  5e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3607  methionyl-tRNA formyltransferase  35.38 
 
 		 314 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1368  methionyl-tRNA formyltransferase  36.16 
 
 		 309 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0580352 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  35.49 
 
 		 310 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  38.68 
 
 		 315 aa  189  7e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  37.5 
 
 		 318 aa  188  9e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  36.56 
 
 		 329 aa  188  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0590691 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3717  methionyl-tRNA formyltransferase  35.38 
 
 		 314 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00223065  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1278  methionyl-tRNA formyltransferase  35.08 
 
 		 314 aa  188  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.289128 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3625  methionyl-tRNA formyltransferase  35.38 
 
 		 314 aa  188  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000492096  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0018  methionyl-tRNA formyltransferase  38.17 
 
 		 314 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4004  methionyl-tRNA formyltransferase  35.38 
 
 		 314 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  38.63 
 
 		 310 aa  188  1e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3880  methionyl-tRNA formyltransferase  35.38 
 
 		 314 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43125e-17 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  36.48 
 
 		 315 aa  188  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3914  methionyl-tRNA formyltransferase  35.08 
 
 		 314 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00718662  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3965  methionyl-tRNA formyltransferase  34.77 
 
 		 314 aa  188  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09900  methionyl-tRNA formyltransferase  31.74 
 
 		 316 aa  187  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2474  methionyl-tRNA formyltransferase  35.85 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  36.83 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  37.5 
 
 		 318 aa  186  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2313  methionyl-tRNA formyltransferase  35.89 
 
 		 312 aa  187  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490925  hitchhiker  0.0006759 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0597  methionyl-tRNA formyltransferase  37.85 
 
 		 309 aa  186  5e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.411489  normal  0.365023 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  35.45 
 
 		 317 aa  186  6e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00392  methionyl-tRNA formyltransferase  36.16 
 
 		 315 aa  185  7e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  36.11 
 
 		 301 aa  185  8e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  36.67 
 
 		 313 aa  185  8e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  37.97 
 
 		 310 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0347  methionyl-tRNA formyltransferase  37.5 
 
 		 305 aa  185  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.342124  normal  0.0280325 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  36.89 
 
 		 318 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0079  methionyl-tRNA formyltransferase  35.42 
 
 		 316 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  37.2 
 
 		 316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2825  methionyl-tRNA formyltransferase  34.78 
 
 		 309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  35.67 
 
 		 324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  36.56 
 
 		 321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  37.19 
 
 		 315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00190  methionyl-tRNA formyltransferase  38.36 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.767541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  45.61 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4568  methionyl-tRNA formyltransferase  35.26 
 
 		 312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2582  methionyl-tRNA formyltransferase  37.73 
 
 		 328 aa  183  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0097642  normal  0.0138205 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0875  methionyl-tRNA formyltransferase  35.83 
 
 		 302 aa  183  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  36.59 
 
 		 315 aa  184  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  34.7 
 
 		 318 aa  183  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  38.05 
 
 		 315 aa  184  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1231  methionyl-tRNA formyltransferase  33.33 
 
 		 314 aa  183  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000178496  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0782  methionyl-tRNA formyltransferase  32.28 
 
 		 310 aa  183  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.606283  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  36.28 
 
 		 311 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0014  methionyl-tRNA formyltransferase  35.96 
 
 		 329 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>