More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2582 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2582  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 328 aa  650    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0097642  normal  0.0138205 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  46.18 
 
 		 318 aa  287  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  46.18 
 
 		 318 aa  285  7e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  45.14 
 
 		 311 aa  280  2e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  42.95 
 
 		 312 aa  278  7e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  44.41 
 
 		 316 aa  278  7e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  44.83 
 
 		 311 aa  277  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  43.61 
 
 		 310 aa  271  8.000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  45.14 
 
 		 317 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  43.57 
 
 		 313 aa  266  5e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  46.95 
 
 		 311 aa  264  2e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0513  methionyl-tRNA formyltransferase  44.48 
 
 		 319 aa  262  6e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  41.69 
 
 		 317 aa  261  8.999999999999999e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  45.45 
 
 		 315 aa  259  6e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  44.73 
 
 		 320 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  43.55 
 
 		 311 aa  253  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1996  methionyl-tRNA formyltransferase  40.31 
 
 		 309 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1714  methionyl-tRNA formyltransferase  40.31 
 
 		 309 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2232  methionyl-tRNA formyltransferase  43.35 
 
 		 313 aa  251  1e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2491  methionyl-tRNA formyltransferase  39.81 
 
 		 319 aa  250  2e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1231  methionyl-tRNA formyltransferase  41.23 
 
 		 314 aa  250  2e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000178496  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  43.48 
 
 		 359 aa  249  3e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  44.08 
 
 		 312 aa  248  8e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  41.67 
 
 		 315 aa  246  3e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2474  methionyl-tRNA formyltransferase  41.67 
 
 		 315 aa  246  6e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1040  methionyl-tRNA formyltransferase  41.64 
 
 		 309 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0040  methionyl-tRNA formyltransferase  41.82 
 
 		 317 aa  243  3.9999999999999997e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  45.25 
 
 		 315 aa  242  5e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  45.25 
 
 		 315 aa  242  5e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  45.25 
 
 		 315 aa  242  5e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  45.25 
 
 		 315 aa  242  5e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  45.25 
 
 		 315 aa  242  5e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  44.14 
 
 		 302 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  44.92 
 
 		 315 aa  241  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00392  methionyl-tRNA formyltransferase  40.71 
 
 		 315 aa  240  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  43.35 
 
 		 307 aa  241  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  44.92 
 
 		 315 aa  241  2e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  44.59 
 
 		 315 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  44.59 
 
 		 315 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  44.59 
 
 		 315 aa  240  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  44.59 
 
 		 315 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  44.59 
 
 		 315 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  44.59 
 
 		 315 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  41.48 
 
 		 314 aa  239  2.9999999999999997e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  41.48 
 
 		 314 aa  239  2.9999999999999997e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  43.61 
 
 		 315 aa  239  5e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  43.61 
 
 		 315 aa  239  5e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  43.61 
 
 		 315 aa  239  5e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  42.57 
 
 		 318 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  42.24 
 
 		 318 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0148  methionyl-tRNA formyltransferase  43.31 
 
 		 305 aa  239  6.999999999999999e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.576123 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  45.54 
 
 		 314 aa  238  8e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  42.72 
 
 		 308 aa  238  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  44.92 
 
 		 315 aa  238  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  40.06 
 
 		 314 aa  238  1e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0094  methionyl-tRNA formyltransferase  46.69 
 
 		 320 aa  238  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.922112  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0393  methionyl-tRNA formyltransferase  42.17 
 
 		 312 aa  238  1e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.894516  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  42.95 
 
 		 313 aa  238  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  43.08 
 
 		 310 aa  238  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  42.77 
 
 		 312 aa  238  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  41.58 
 
 		 318 aa  237  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  44.22 
 
 		 321 aa  237  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0972  methionyl-tRNA formyltransferase  39.68 
 
 		 314 aa  237  2e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.319816  normal  0.276171 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0074  methionyl-tRNA formyltransferase  40.67 
 
 		 321 aa  237  2e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  40.75 
 
 		 312 aa  236  6e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1005  methionyl-tRNA formyltransferase  36.39 
 
 		 317 aa  235  6e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00554605  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  42.24 
 
 		 318 aa  236  6e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  42.3 
 
 		 314 aa  235  8e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2313  methionyl-tRNA formyltransferase  40.75 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490925  hitchhiker  0.0006759 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0831  methionyl-tRNA formyltransferase  42.42 
 
 		 327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  43.61 
 
 		 315 aa  235  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  44.22 
 
 		 314 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  39.75 
 
 		 314 aa  234  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  40.84 
 
 		 318 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  41.85 
 
 		 318 aa  233  3e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  41.12 
 
 		 319 aa  233  3e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00190  methionyl-tRNA formyltransferase  45.33 
 
 		 314 aa  233  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.767541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  41.25 
 
 		 318 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0018  methionyl-tRNA formyltransferase  44.88 
 
 		 314 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  42.62 
 
 		 318 aa  232  5e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09900  methionyl-tRNA formyltransferase  39.75 
 
 		 316 aa  232  7.000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0014  methionyl-tRNA formyltransferase  43.59 
 
 		 329 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  45.42 
 
 		 310 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  41.25 
 
 		 318 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188499 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4081  methionyl-tRNA formyltransferase  44.44 
 
 		 330 aa  232  8.000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  43.14 
 
 		 315 aa  231  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04056  methionyl-tRNA formyltransferase  43.65 
 
 		 307 aa  231  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  41.64 
 
 		 308 aa  231  1e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823971 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  40.92 
 
 		 318 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1928  methionyl-tRNA formyltransferase  42.72 
 
 		 307 aa  231  2e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  40.92 
 
 		 318 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  42.81 
 
 		 315 aa  230  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  40.66 
 
 		 313 aa  230  3e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  40.44 
 
 		 311 aa  230  3e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0050  methionyl-tRNA formyltransferase  38.66 
 
 		 319 aa  230  3e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.977686  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  41.03 
 
 		 315 aa  230  3e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  42.24 
 
 		 329 aa  230  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0590691 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1275  methionyl-tRNA formyltransferase  38.39 
 
 		 311 aa  229  4e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0020  methionyl-tRNA formyltransferase  41.94 
 
 		 322 aa  229  4e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  38.68 
 
 		 311 aa  229  4e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>