More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2647 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  650    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  98.09 
 
 		 314 aa  638    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  52.88 
 
 		 314 aa  348  6e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  53.7 
 
 		 319 aa  345  6e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  54.34 
 
 		 310 aa  345  8e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  54.02 
 
 		 310 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  52.58 
 
 		 310 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  53.7 
 
 		 310 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00392  methionyl-tRNA formyltransferase  52.58 
 
 		 315 aa  340  2e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2474  methionyl-tRNA formyltransferase  52.26 
 
 		 315 aa  339  4e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  53.75 
 
 		 311 aa  338  5e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  51.61 
 
 		 315 aa  338  5.9999999999999996e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  52.58 
 
 		 314 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  50.97 
 
 		 310 aa  333  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0074  methionyl-tRNA formyltransferase  50.32 
 
 		 321 aa  330  2e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  52.98 
 
 		 318 aa  330  3e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  50.32 
 
 		 324 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  52.65 
 
 		 318 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  51.94 
 
 		 313 aa  328  5.0000000000000004e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  52.32 
 
 		 318 aa  328  8e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0079  methionyl-tRNA formyltransferase  50.32 
 
 		 316 aa  328  8e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  52.32 
 
 		 318 aa  328  9e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  52.65 
 
 		 318 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00190  methionyl-tRNA formyltransferase  52.26 
 
 		 314 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.767541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  52.65 
 
 		 318 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  51.99 
 
 		 318 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  53.14 
 
 		 315 aa  326  3e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  51.79 
 
 		 315 aa  326  3e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  51.79 
 
 		 315 aa  325  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  51.79 
 
 		 315 aa  325  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  51.99 
 
 		 318 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188499 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  51.79 
 
 		 315 aa  325  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  51.79 
 
 		 315 aa  325  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  51.79 
 
 		 315 aa  325  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  50.16 
 
 		 321 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  51.79 
 
 		 315 aa  325  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  51.47 
 
 		 315 aa  325  8.000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  51.84 
 
 		 312 aa  323  2e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  49.2 
 
 		 318 aa  323  2e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0018  methionyl-tRNA formyltransferase  51.29 
 
 		 314 aa  323  3e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  51.66 
 
 		 318 aa  322  3e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  52.81 
 
 		 315 aa  323  3e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  52.51 
 
 		 315 aa  322  5e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  56.31 
 
 		 318 aa  321  8e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  50 
 
 		 315 aa  320  1.9999999999999998e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0020  methionyl-tRNA formyltransferase  52.13 
 
 		 322 aa  319  3.9999999999999996e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  48.56 
 
 		 329 aa  319  5e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0590691 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  50.32 
 
 		 313 aa  317  1e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  49.84 
 
 		 319 aa  318  1e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0037  methionyl-tRNA formyltransferase  48.56 
 
 		 320 aa  317  2e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  49.84 
 
 		 314 aa  317  2e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  49.84 
 
 		 314 aa  317  2e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  51.17 
 
 		 308 aa  316  3e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  50 
 
 		 332 aa  315  4e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.982881  normal  0.112275 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  49.51 
 
 		 314 aa  315  5e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  51.83 
 
 		 315 aa  315  7e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  51.83 
 
 		 315 aa  314  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  51.83 
 
 		 315 aa  314  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  51.83 
 
 		 315 aa  314  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  51.83 
 
 		 315 aa  314  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  49.36 
 
 		 315 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  49.04 
 
 		 315 aa  310  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  49.04 
 
 		 315 aa  310  2e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  49.04 
 
 		 315 aa  310  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  48.87 
 
 		 312 aa  310  2.9999999999999997e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3015  methionyl-tRNA formyltransferase  51.01 
 
 		 323 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  51.12 
 
 		 320 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.601603  normal  0.144256 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00160  methionyl-tRNA formyltransferase  49.35 
 
 		 325 aa  299  3e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0040  methionyl-tRNA formyltransferase  49.53 
 
 		 317 aa  296  3e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2868  methionyl-tRNA formyltransferase  50.79 
 
 		 325 aa  295  7e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  48.86 
 
 		 327 aa  295  8e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  51.32 
 
 		 307 aa  290  2e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1996  methionyl-tRNA formyltransferase  45.25 
 
 		 309 aa  288  8e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2272  methionyl-tRNA formyltransferase  49.16 
 
 		 320 aa  288  1e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00775496 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1714  methionyl-tRNA formyltransferase  45.25 
 
 		 309 aa  286  4e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1864  methionyl-tRNA formyltransferase  48.36 
 
 		 307 aa  284  1.0000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  47.35 
 
 		 312 aa  282  5.000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1928  methionyl-tRNA formyltransferase  48.01 
 
 		 307 aa  281  1e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  47.47 
 
 		 307 aa  281  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0415  methionyl-tRNA formyltransferase  43.73 
 
 		 311 aa  281  1e-74  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.467918  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  47.83 
 
 		 308 aa  280  2e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823971 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2383  methionyl-tRNA formyltransferase  46.69 
 
 		 348 aa  276  2e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.596014  normal  0.0248257 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04056  methionyl-tRNA formyltransferase  48.69 
 
 		 307 aa  276  3e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2084  methionyl-tRNA formyltransferase  48.47 
 
 		 311 aa  275  7e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198796  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0094  methionyl-tRNA formyltransferase  47.84 
 
 		 320 aa  273  3e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.922112  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0015  methionyl-tRNA formyltransferase  48.66 
 
 		 309 aa  268  1e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.229268 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2627  methionyl-tRNA formyltransferase  48.34 
 
 		 314 aa  266  2.9999999999999995e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.640895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  44.44 
 
 		 310 aa  266  5e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  42.63 
 
 		 316 aa  265  8e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3354  methionyl-tRNA formyltransferase  45.83 
 
 		 327 aa  264  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3677  methionyl-tRNA formyltransferase  44.87 
 
 		 327 aa  263  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2139  methionyl-tRNA formyltransferase  46.89 
 
 		 361 aa  262  4e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00931795 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2467  methionyl-tRNA formyltransferase  45.67 
 
 		 363 aa  263  4e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0926432 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  41.53 
 
 		 318 aa  261  8e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  40.19 
 
 		 317 aa  261  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0020  methionyl-tRNA formyltransferase  46.69 
 
 		 313 aa  259  3e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0021  methionyl-tRNA formyltransferase  46.69 
 
 		 313 aa  259  3e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.223082 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  41.18 
 
 		 318 aa  258  9e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0310  methionyl-tRNA formyltransferase  45.63 
 
 		 328 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  41.99 
 
 		 315 aa  258  1e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>