More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4568 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4568  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 312 aa  616  1e-175  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0446  methionyl-tRNA formyltransferase  58.15 
 
 		 311 aa  355  3.9999999999999996e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2577  methionyl-tRNA formyltransferase  59.81 
 
 		 308 aa  351  8.999999999999999e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  hitchhiker  0.000000800769 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  59.55 
 
 		 310 aa  350  2e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1599  methionyl-tRNA formyltransferase  56.55 
 
 		 309 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0493449 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  56.09 
 
 		 310 aa  325  5e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4748  methionyl-tRNA formyltransferase  54.49 
 
 		 310 aa  324  1e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130868  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0055  methionyl-tRNA formyltransferase  55.77 
 
 		 311 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000555853 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0975  methionyl-tRNA formyltransferase  55.45 
 
 		 306 aa  319  3e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.569216  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1635  methionyl-tRNA formyltransferase  56.73 
 
 		 309 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.138536  normal  0.117912 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1034  methionyl-tRNA formyltransferase  55.45 
 
 		 306 aa  318  7e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.79271  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0080  methionyl-tRNA formyltransferase  54.34 
 
 		 310 aa  318  7e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.450016  normal  0.0632026 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0393  methionyl-tRNA formyltransferase  55.77 
 
 		 311 aa  318  7e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0626  methionyl-tRNA formyltransferase  53.72 
 
 		 310 aa  315  5e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274146  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1917  methionyl-tRNA formyltransferase  56.41 
 
 		 309 aa  315  7e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.741308  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0674  methionyl-tRNA formyltransferase  53.72 
 
 		 312 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0075  methionyl-tRNA formyltransferase  54.95 
 
 		 311 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.716754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7336  methionyl-tRNA formyltransferase  54.37 
 
 		 311 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.685492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1345  methionyl-tRNA formyltransferase  54.13 
 
 		 306 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0541  methionyl-tRNA formyltransferase  53.48 
 
 		 320 aa  310  2.9999999999999997e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.743734  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3065  methionyl-tRNA formyltransferase  53.72 
 
 		 314 aa  309  4e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38579  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  54.34 
 
 		 301 aa  309  5e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2535  methionyl-tRNA formyltransferase  55.02 
 
 		 302 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.614949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0181  methionyl-tRNA formyltransferase  57.65 
 
 		 299 aa  306  3e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.142178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3694  methionyl-tRNA formyltransferase  55.74 
 
 		 310 aa  306  3e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0875  methionyl-tRNA formyltransferase  54.37 
 
 		 302 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  54.05 
 
 		 302 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3304  methionyl-tRNA formyltransferase  55.77 
 
 		 307 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0607232  normal  0.664052 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3147  methionyl-tRNA formyltransferase  54.26 
 
 		 313 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  0.377579 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0058  methionyl-tRNA formyltransferase  54.31 
 
 		 311 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.820848  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  55.74 
 
 		 297 aa  294  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0347  methionyl-tRNA formyltransferase  50.96 
 
 		 305 aa  291  1e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.342124  normal  0.0280325 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4042  methionyl-tRNA formyltransferase  51.28 
 
 		 308 aa  288  8e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0806  methionyl-tRNA formyltransferase  53.77 
 
 		 310 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.283838 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1129  methionyl-tRNA formyltransferase  52.92 
 
 		 312 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158103 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2894  methionyl-tRNA formyltransferase  50.8 
 
 		 301 aa  283  3.0000000000000004e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0497  methionyl-tRNA formyltransferase  51.3 
 
 		 317 aa  282  5.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.12463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1320  methionyl-tRNA formyltransferase  49.68 
 
 		 309 aa  282  5.000000000000001e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0249  methionyl-tRNA formyltransferase  50.8 
 
 		 306 aa  275  8e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.153512 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3351  methionyl-tRNA formyltransferase  51.91 
 
 		 309 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0410  methionyl-tRNA formyltransferase  50.32 
 
 		 301 aa  266  2e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  45.63 
 
 		 307 aa  242  7e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2549  methionyl-tRNA formyltransferase  45.71 
 
 		 320 aa  241  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31631  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  44.85 
 
 		 315 aa  241  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  44.08 
 
 		 315 aa  239  4e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  44.08 
 
 		 315 aa  239  4e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  44.08 
 
 		 315 aa  239  4e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  44.08 
 
 		 315 aa  239  4e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  44.08 
 
 		 315 aa  239  4e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  44.08 
 
 		 315 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  43.75 
 
 		 315 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  43.75 
 
 		 315 aa  238  1e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0094  methionyl-tRNA formyltransferase  46.98 
 
 		 320 aa  238  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.922112  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  42.09 
 
 		 312 aa  237  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  41.31 
 
 		 311 aa  235  6e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  45.73 
 
 		 314 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3877  methionyl-tRNA formyltransferase  44.89 
 
 		 323 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2868  methionyl-tRNA formyltransferase  46.08 
 
 		 325 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  45.73 
 
 		 310 aa  233  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0020  methionyl-tRNA formyltransferase  42.67 
 
 		 322 aa  233  4.0000000000000004e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  47.83 
 
 		 310 aa  231  9e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  47.46 
 
 		 310 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  44.81 
 
 		 308 aa  231  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  47.46 
 
 		 310 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  47.46 
 
 		 310 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00190  methionyl-tRNA formyltransferase  46.28 
 
 		 314 aa  229  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.767541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4053  methionyl-tRNA formyltransferase  44.72 
 
 		 323 aa  229  6e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0284  methionyl-tRNA formyltransferase  47.54 
 
 		 315 aa  228  9e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0176978 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  42.95 
 
 		 315 aa  228  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  42.95 
 
 		 315 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  42.95 
 
 		 315 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  42.95 
 
 		 315 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  42.95 
 
 		 315 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  46.41 
 
 		 307 aa  228  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  46.01 
 
 		 319 aa  227  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3398  methionyl-tRNA formyltransferase  44.41 
 
 		 323 aa  227  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.726388  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0018  methionyl-tRNA formyltransferase  45.05 
 
 		 314 aa  226  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0072  methionyl-tRNA formyltransferase  45.12 
 
 		 327 aa  226  4e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  42.5 
 
 		 314 aa  226  4e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3677  methionyl-tRNA formyltransferase  43.29 
 
 		 327 aa  226  4e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  42.72 
 
 		 311 aa  225  6e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  41.32 
 
 		 320 aa  225  7e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2078  methionyl-tRNA formyltransferase  42.77 
 
 		 332 aa  225  9e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3354  methionyl-tRNA formyltransferase  43.29 
 
 		 327 aa  224  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2040  methionyl-tRNA formyltransferase  41.85 
 
 		 369 aa  224  1e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04056  methionyl-tRNA formyltransferase  45.57 
 
 		 307 aa  224  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0310  methionyl-tRNA formyltransferase  43.93 
 
 		 328 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09900  methionyl-tRNA formyltransferase  39.32 
 
 		 316 aa  224  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  41.45 
 
 		 314 aa  224  2e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  41.45 
 
 		 314 aa  224  2e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  40.66 
 
 		 315 aa  223  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3123  methionyl-tRNA formyltransferase  43.52 
 
 		 327 aa  223  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.760657  normal  0.204185 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4690  methionyl-tRNA formyltransferase  46.6 
 
 		 329 aa  223  4e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1278  methionyl-tRNA formyltransferase  38.91 
 
 		 314 aa  222  6e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.289128 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3965  methionyl-tRNA formyltransferase  38.91 
 
 		 314 aa  222  6e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  44.03 
 
 		 314 aa  222  6e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  40.84 
 
 		 308 aa  221  9e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823971 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  44.84 
 
 		 310 aa  221  9.999999999999999e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  46.58 
 
 		 314 aa  221  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3407  methionyl-tRNA formyltransferase  44.41 
 
 		 331 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.667416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>