More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4239 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 310 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4748  methionyl-tRNA formyltransferase  88.39 
 
 		 310 aa  536  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130868  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3147  methionyl-tRNA formyltransferase  72.44 
 
 		 313 aa  436  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  0.377579 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1599  methionyl-tRNA formyltransferase  71.2 
 
 		 309 aa  430  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0493449 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1635  methionyl-tRNA formyltransferase  72.08 
 
 		 309 aa  427  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.138536  normal  0.117912 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1917  methionyl-tRNA formyltransferase  70.78 
 
 		 309 aa  418  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.741308  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3304  methionyl-tRNA formyltransferase  68.83 
 
 		 307 aa  390  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0607232  normal  0.664052 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7336  methionyl-tRNA formyltransferase  61.29 
 
 		 311 aa  371  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.685492  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1034  methionyl-tRNA formyltransferase  60.93 
 
 		 306 aa  368  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.79271  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1129  methionyl-tRNA formyltransferase  64.69 
 
 		 312 aa  368  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158103 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  62.18 
 
 		 310 aa  365  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0975  methionyl-tRNA formyltransferase  60.6 
 
 		 306 aa  366  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.569216  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1345  methionyl-tRNA formyltransferase  60.26 
 
 		 306 aa  365  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3065  methionyl-tRNA formyltransferase  59.11 
 
 		 314 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38579  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0626  methionyl-tRNA formyltransferase  58.58 
 
 		 310 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274146  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0080  methionyl-tRNA formyltransferase  60 
 
 		 310 aa  350  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.450016  normal  0.0632026 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0674  methionyl-tRNA formyltransferase  58.39 
 
 		 312 aa  348  5e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3694  methionyl-tRNA formyltransferase  60.32 
 
 		 310 aa  346  3e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0393  methionyl-tRNA formyltransferase  57.1 
 
 		 311 aa  345  5e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0541  methionyl-tRNA formyltransferase  54.78 
 
 		 320 aa  341  1e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.743734  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0055  methionyl-tRNA formyltransferase  57.81 
 
 		 311 aa  339  2.9999999999999998e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000555853 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0075  methionyl-tRNA formyltransferase  57.1 
 
 		 311 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.716754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0806  methionyl-tRNA formyltransferase  60.33 
 
 		 310 aa  338  7e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.283838 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0058  methionyl-tRNA formyltransferase  56.91 
 
 		 311 aa  338  7e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.820848  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0497  methionyl-tRNA formyltransferase  57.14 
 
 		 317 aa  334  1e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.12463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4568  methionyl-tRNA formyltransferase  56.09 
 
 		 312 aa  325  5e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  55.37 
 
 		 301 aa  320  9.999999999999999e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0446  methionyl-tRNA formyltransferase  55.95 
 
 		 311 aa  320  1.9999999999999998e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2577  methionyl-tRNA formyltransferase  55.05 
 
 		 308 aa  318  6e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  hitchhiker  0.000000800769 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2535  methionyl-tRNA formyltransferase  56.86 
 
 		 302 aa  316  4e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.614949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0875  methionyl-tRNA formyltransferase  56.54 
 
 		 302 aa  314  9e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  57.05 
 
 		 302 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  58.39 
 
 		 297 aa  310  2e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0181  methionyl-tRNA formyltransferase  57.14 
 
 		 299 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.142178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1320  methionyl-tRNA formyltransferase  50.33 
 
 		 309 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2894  methionyl-tRNA formyltransferase  51.62 
 
 		 301 aa  281  1e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0249  methionyl-tRNA formyltransferase  50.48 
 
 		 306 aa  280  2e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.153512 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0347  methionyl-tRNA formyltransferase  49.68 
 
 		 305 aa  276  4e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.342124  normal  0.0280325 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3351  methionyl-tRNA formyltransferase  53.21 
 
 		 309 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4042  methionyl-tRNA formyltransferase  51.45 
 
 		 308 aa  272  6e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1864  methionyl-tRNA formyltransferase  52.12 
 
 		 307 aa  271  1e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  49.5 
 
 		 314 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  47.37 
 
 		 312 aa  270  2e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04056  methionyl-tRNA formyltransferase  50.49 
 
 		 307 aa  269  5e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1928  methionyl-tRNA formyltransferase  52.12 
 
 		 307 aa  268  7e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  45.98 
 
 		 312 aa  268  7e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  49.67 
 
 		 314 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  46.5 
 
 		 315 aa  263  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  49.5 
 
 		 319 aa  263  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0018  methionyl-tRNA formyltransferase  49.17 
 
 		 314 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  50.95 
 
 		 310 aa  261  1e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00190  methionyl-tRNA formyltransferase  49.68 
 
 		 314 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.767541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  48.39 
 
 		 307 aa  259  3e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  47.85 
 
 		 310 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  46.01 
 
 		 315 aa  259  6e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  46.01 
 
 		 315 aa  259  6e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  46.52 
 
 		 315 aa  259  6e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  45.34 
 
 		 314 aa  258  6e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  46.01 
 
 		 315 aa  259  6e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  46.01 
 
 		 315 aa  259  6e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  46.01 
 
 		 315 aa  259  6e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  45.34 
 
 		 314 aa  258  6e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  45.6 
 
 		 315 aa  258  8e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2868  methionyl-tRNA formyltransferase  49.37 
 
 		 325 aa  258  8e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  47.85 
 
 		 310 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  46.01 
 
 		 315 aa  258  1e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  45.69 
 
 		 315 aa  258  1e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0410  methionyl-tRNA formyltransferase  48.38 
 
 		 301 aa  258  1e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  46.06 
 
 		 314 aa  258  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  47.52 
 
 		 310 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  47.48 
 
 		 315 aa  256  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  47.48 
 
 		 315 aa  256  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  47.48 
 
 		 315 aa  256  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  47.48 
 
 		 315 aa  256  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  45.45 
 
 		 313 aa  256  3e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2549  methionyl-tRNA formyltransferase  47.59 
 
 		 320 aa  256  4e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31631  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  47.17 
 
 		 315 aa  255  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  47.19 
 
 		 310 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  44.76 
 
 		 315 aa  253  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  44.76 
 
 		 315 aa  253  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  44.76 
 
 		 315 aa  253  2.0000000000000002e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0310  methionyl-tRNA formyltransferase  49.22 
 
 		 328 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  47.45 
 
 		 308 aa  253  3e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  46.15 
 
 		 315 aa  252  5.000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  47.19 
 
 		 310 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  43.81 
 
 		 313 aa  251  9.000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4415  methionyl-tRNA formyltransferase  50 
 
 		 328 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.628902 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  43.18 
 
 		 318 aa  250  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  42.99 
 
 		 320 aa  251  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  43.31 
 
 		 318 aa  250  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  43.31 
 
 		 318 aa  249  3e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  41.29 
 
 		 311 aa  249  5e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  46.06 
 
 		 324 aa  249  5e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  42.68 
 
 		 318 aa  248  7e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  43.04 
 
 		 316 aa  248  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  48.05 
 
 		 307 aa  247  2e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  43.31 
 
 		 318 aa  247  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  42.86 
 
 		 318 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  44.79 
 
 		 315 aa  245  6e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  42.31 
 
 		 311 aa  245  6e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>