More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0249 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0249  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 306 aa  612  9.999999999999999e-175  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.153512 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2894  methionyl-tRNA formyltransferase  70.82 
 
 		 301 aa  404  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4042  methionyl-tRNA formyltransferase  68.83 
 
 		 308 aa  391  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2577  methionyl-tRNA formyltransferase  54.9 
 
 		 308 aa  320  9.999999999999999e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  hitchhiker  0.000000800769 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0410  methionyl-tRNA formyltransferase  56.35 
 
 		 301 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0347  methionyl-tRNA formyltransferase  55.95 
 
 		 305 aa  311  5.999999999999999e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.342124  normal  0.0280325 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0080  methionyl-tRNA formyltransferase  54.72 
 
 		 310 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.450016  normal  0.0632026 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0181  methionyl-tRNA formyltransferase  55.22 
 
 		 299 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.142178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0875  methionyl-tRNA formyltransferase  52.79 
 
 		 302 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  52.94 
 
 		 301 aa  296  2e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  52.06 
 
 		 310 aa  296  3e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0626  methionyl-tRNA formyltransferase  53.21 
 
 		 310 aa  295  4e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274146  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2535  methionyl-tRNA formyltransferase  52.46 
 
 		 302 aa  295  5e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.614949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  52.63 
 
 		 302 aa  294  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0674  methionyl-tRNA formyltransferase  52.09 
 
 		 312 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0058  methionyl-tRNA formyltransferase  50.96 
 
 		 311 aa  286  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.820848  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0075  methionyl-tRNA formyltransferase  50.8 
 
 		 311 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.716754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  55.22 
 
 		 297 aa  285  8e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0055  methionyl-tRNA formyltransferase  51.32 
 
 		 311 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000555853 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0541  methionyl-tRNA formyltransferase  49.68 
 
 		 320 aa  284  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.743734  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1345  methionyl-tRNA formyltransferase  50.16 
 
 		 306 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1034  methionyl-tRNA formyltransferase  50.16 
 
 		 306 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.79271  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0975  methionyl-tRNA formyltransferase  50.16 
 
 		 306 aa  282  5.000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.569216  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3147  methionyl-tRNA formyltransferase  50.8 
 
 		 313 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  0.377579 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  48.84 
 
 		 312 aa  282  6.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4748  methionyl-tRNA formyltransferase  50.16 
 
 		 310 aa  280  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130868  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  50.48 
 
 		 310 aa  280  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0446  methionyl-tRNA formyltransferase  50.32 
 
 		 311 aa  278  9e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  49.84 
 
 		 315 aa  278  1e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  49.68 
 
 		 315 aa  276  5e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  49.68 
 
 		 315 aa  276  5e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  49.68 
 
 		 315 aa  276  5e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  49.68 
 
 		 315 aa  276  5e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  49.68 
 
 		 315 aa  276  5e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  49.68 
 
 		 315 aa  275  8e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4568  methionyl-tRNA formyltransferase  50.8 
 
 		 312 aa  275  8e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  49.36 
 
 		 315 aa  275  8e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  48.54 
 
 		 312 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  50.16 
 
 		 318 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  49.52 
 
 		 315 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3351  methionyl-tRNA formyltransferase  52.1 
 
 		 309 aa  272  6e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3065  methionyl-tRNA formyltransferase  49.05 
 
 		 314 aa  271  7e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38579  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7336  methionyl-tRNA formyltransferase  48.55 
 
 		 311 aa  271  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.685492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  48.73 
 
 		 315 aa  269  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  48.73 
 
 		 315 aa  269  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  48.73 
 
 		 315 aa  269  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  48.73 
 
 		 315 aa  269  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  48.73 
 
 		 315 aa  269  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  49.17 
 
 		 313 aa  267  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1599  methionyl-tRNA formyltransferase  49.04 
 
 		 309 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0493449 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3694  methionyl-tRNA formyltransferase  50.96 
 
 		 310 aa  266  5e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0074  methionyl-tRNA formyltransferase  48.36 
 
 		 321 aa  265  8e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1320  methionyl-tRNA formyltransferase  47.4 
 
 		 309 aa  264  1e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  49.67 
 
 		 315 aa  264  1e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1635  methionyl-tRNA formyltransferase  48.88 
 
 		 309 aa  264  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.138536  normal  0.117912 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0393  methionyl-tRNA formyltransferase  47.6 
 
 		 311 aa  263  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1917  methionyl-tRNA formyltransferase  48.56 
 
 		 309 aa  263  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.741308  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  48.18 
 
 		 313 aa  263  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  46.3 
 
 		 312 aa  262  4.999999999999999e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00392  methionyl-tRNA formyltransferase  48.36 
 
 		 315 aa  262  6e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2868  methionyl-tRNA formyltransferase  51.1 
 
 		 325 aa  261  6.999999999999999e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0072  methionyl-tRNA formyltransferase  50.62 
 
 		 327 aa  261  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  47.85 
 
 		 315 aa  261  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  48.88 
 
 		 314 aa  261  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  49.84 
 
 		 324 aa  261  1e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  49.19 
 
 		 307 aa  260  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3304  methionyl-tRNA formyltransferase  51.44 
 
 		 307 aa  260  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0607232  normal  0.664052 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  47.3 
 
 		 315 aa  260  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  47.13 
 
 		 318 aa  260  2e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  48.51 
 
 		 314 aa  259  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  46.82 
 
 		 318 aa  259  3e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  46.82 
 
 		 318 aa  260  3e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4638  methionyl-tRNA formyltransferase  49.84 
 
 		 357 aa  259  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.857325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  47.85 
 
 		 315 aa  258  7e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0015  methionyl-tRNA formyltransferase  51.78 
 
 		 309 aa  258  9e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.229268 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  47.35 
 
 		 311 aa  258  9e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  46.5 
 
 		 318 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3677  methionyl-tRNA formyltransferase  49.23 
 
 		 327 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1129  methionyl-tRNA formyltransferase  50.97 
 
 		 312 aa  258  1e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158103 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  50.17 
 
 		 310 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  46.5 
 
 		 318 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188499 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  50.33 
 
 		 307 aa  257  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  47.52 
 
 		 315 aa  257  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  47.52 
 
 		 315 aa  257  2e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  47.52 
 
 		 315 aa  257  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3354  methionyl-tRNA formyltransferase  48.16 
 
 		 327 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  47.52 
 
 		 315 aa  256  4e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  46.33 
 
 		 318 aa  256  4e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0806  methionyl-tRNA formyltransferase  51.82 
 
 		 310 aa  255  6e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.283838 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  45.86 
 
 		 321 aa  255  6e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  47.37 
 
 		 318 aa  255  7e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0497  methionyl-tRNA formyltransferase  48.08 
 
 		 317 aa  254  1.0000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.12463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  46.65 
 
 		 318 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2474  methionyl-tRNA formyltransferase  45.86 
 
 		 315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  48.18 
 
 		 310 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  46.33 
 
 		 318 aa  253  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  46.01 
 
 		 318 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0831  methionyl-tRNA formyltransferase  48.28 
 
 		 327 aa  253  4.0000000000000004e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  47.27 
 
 		 320 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.601603  normal  0.144256 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  47.85 
 
 		 310 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>