More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0497 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0497  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 317 aa  627  1e-179  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.12463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1129  methionyl-tRNA formyltransferase  62.46 
 
 		 312 aa  361  9e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158103 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0393  methionyl-tRNA formyltransferase  57.47 
 
 		 311 aa  348  5e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4748  methionyl-tRNA formyltransferase  58.12 
 
 		 310 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130868  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0541  methionyl-tRNA formyltransferase  57.61 
 
 		 320 aa  341  1e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.743734  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3147  methionyl-tRNA formyltransferase  58.01 
 
 		 313 aa  338  8e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  0.377579 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1034  methionyl-tRNA formyltransferase  56.62 
 
 		 306 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.79271  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1345  methionyl-tRNA formyltransferase  55.63 
 
 		 306 aa  336  2.9999999999999997e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0975  methionyl-tRNA formyltransferase  56.62 
 
 		 306 aa  335  5.999999999999999e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.569216  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  57.14 
 
 		 310 aa  334  1e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1599  methionyl-tRNA formyltransferase  57.7 
 
 		 309 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0493449 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3304  methionyl-tRNA formyltransferase  58.77 
 
 		 307 aa  331  1e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0607232  normal  0.664052 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1635  methionyl-tRNA formyltransferase  56.96 
 
 		 309 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.138536  normal  0.117912 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1917  methionyl-tRNA formyltransferase  56.96 
 
 		 309 aa  326  3e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.741308  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0055  methionyl-tRNA formyltransferase  56.07 
 
 		 311 aa  322  5e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000555853 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0075  methionyl-tRNA formyltransferase  55.52 
 
 		 311 aa  317  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.716754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  56.91 
 
 		 310 aa  317  2e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0058  methionyl-tRNA formyltransferase  53.9 
 
 		 311 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.820848  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7336  methionyl-tRNA formyltransferase  51.95 
 
 		 311 aa  310  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.685492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0626  methionyl-tRNA formyltransferase  51.62 
 
 		 310 aa  301  9e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274146  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3065  methionyl-tRNA formyltransferase  52.88 
 
 		 314 aa  300  2e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38579  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3694  methionyl-tRNA formyltransferase  52.27 
 
 		 310 aa  297  2e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1320  methionyl-tRNA formyltransferase  50.33 
 
 		 309 aa  296  3e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0674  methionyl-tRNA formyltransferase  51.95 
 
 		 312 aa  296  4e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0080  methionyl-tRNA formyltransferase  51.64 
 
 		 310 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.450016  normal  0.0632026 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0806  methionyl-tRNA formyltransferase  53.97 
 
 		 310 aa  292  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.283838 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2577  methionyl-tRNA formyltransferase  54.55 
 
 		 308 aa  293  4e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  hitchhiker  0.000000800769 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4568  methionyl-tRNA formyltransferase  51.3 
 
 		 312 aa  282  5.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  53.8 
 
 		 297 aa  279  6e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0181  methionyl-tRNA formyltransferase  52.3 
 
 		 299 aa  272  7e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.142178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  53.47 
 
 		 302 aa  271  9e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0875  methionyl-tRNA formyltransferase  52.44 
 
 		 302 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2535  methionyl-tRNA formyltransferase  52.44 
 
 		 302 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.614949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2894  methionyl-tRNA formyltransferase  49.03 
 
 		 301 aa  265  1e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  50 
 
 		 301 aa  264  1e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3351  methionyl-tRNA formyltransferase  51.29 
 
 		 309 aa  263  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0446  methionyl-tRNA formyltransferase  48.87 
 
 		 311 aa  262  4.999999999999999e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4042  methionyl-tRNA formyltransferase  49.84 
 
 		 308 aa  259  4e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0347  methionyl-tRNA formyltransferase  48.39 
 
 		 305 aa  256  4e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.342124  normal  0.0280325 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0249  methionyl-tRNA formyltransferase  48.08 
 
 		 306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.153512 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  47.87 
 
 		 318 aa  251  1e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2868  methionyl-tRNA formyltransferase  47.76 
 
 		 325 aa  248  1e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  47.62 
 
 		 314 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  45.07 
 
 		 311 aa  241  1e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  48.3 
 
 		 310 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  49.45 
 
 		 310 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  48.51 
 
 		 308 aa  239  4e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  49.45 
 
 		 310 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  43.09 
 
 		 312 aa  238  8e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04056  methionyl-tRNA formyltransferase  47.88 
 
 		 307 aa  238  9e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  43.69 
 
 		 312 aa  238  1e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  46.93 
 
 		 314 aa  237  2e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  44.08 
 
 		 314 aa  237  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  44.41 
 
 		 318 aa  237  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  46.93 
 
 		 314 aa  237  2e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  47.96 
 
 		 314 aa  236  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  43.22 
 
 		 320 aa  236  3e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  41.16 
 
 		 311 aa  236  4e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3123  methionyl-tRNA formyltransferase  45.68 
 
 		 327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.760657  normal  0.204185 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  42.44 
 
 		 315 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  43.77 
 
 		 318 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  43.77 
 
 		 318 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  48.72 
 
 		 310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  47.88 
 
 		 307 aa  233  4.0000000000000004e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0410  methionyl-tRNA formyltransferase  47.44 
 
 		 301 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0018  methionyl-tRNA formyltransferase  47.28 
 
 		 314 aa  232  5e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  48.35 
 
 		 310 aa  232  6e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  44.3 
 
 		 307 aa  231  9e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  42.81 
 
 		 318 aa  230  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  48.35 
 
 		 319 aa  230  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1928  methionyl-tRNA formyltransferase  46.91 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  45.87 
 
 		 315 aa  230  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3181  methionyl-tRNA formyltransferase  45.37 
 
 		 327 aa  229  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1864  methionyl-tRNA formyltransferase  46.58 
 
 		 307 aa  229  4e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0094  methionyl-tRNA formyltransferase  45.66 
 
 		 320 aa  229  5e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.922112  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0310  methionyl-tRNA formyltransferase  45.68 
 
 		 328 aa  229  6e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2272  methionyl-tRNA formyltransferase  46.75 
 
 		 320 aa  229  7e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00775496 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  43.71 
 
 		 321 aa  228  7e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3064  methionyl-tRNA formyltransferase  45.37 
 
 		 327 aa  229  7e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  45.39 
 
 		 310 aa  228  1e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2040  methionyl-tRNA formyltransferase  43.48 
 
 		 369 aa  226  3e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2512  methionyl-tRNA formyltransferase  44.21 
 
 		 330 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3126  methionyl-tRNA formyltransferase  44.21 
 
 		 330 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.879337  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4415  methionyl-tRNA formyltransferase  45.68 
 
 		 328 aa  226  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.628902 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  42.76 
 
 		 313 aa  226  4e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  43.13 
 
 		 324 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6477  methionyl-tRNA formyltransferase  44.31 
 
 		 327 aa  225  6e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.79537 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2627  methionyl-tRNA formyltransferase  47.27 
 
 		 314 aa  225  8e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.640895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3564  methionyl-tRNA formyltransferase  46.48 
 
 		 344 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00190  methionyl-tRNA formyltransferase  47.62 
 
 		 314 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.767541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3142  methionyl-tRNA formyltransferase  44.21 
 
 		 330 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.757511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  40.62 
 
 		 318 aa  223  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0831  methionyl-tRNA formyltransferase  44.62 
 
 		 327 aa  223  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3407  methionyl-tRNA formyltransferase  44.72 
 
 		 331 aa  223  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.667416  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3677  methionyl-tRNA formyltransferase  45.03 
 
 		 327 aa  222  6e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3354  methionyl-tRNA formyltransferase  44.72 
 
 		 327 aa  222  8e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4690  methionyl-tRNA formyltransferase  44.62 
 
 		 329 aa  222  8e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  41.21 
 
 		 318 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0020  methionyl-tRNA formyltransferase  43.38 
 
 		 322 aa  221  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  42.11 
 
 		 315 aa  221  9.999999999999999e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>