More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0393 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0393  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 
311 aa  621  1e-177  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1034  methionyl-tRNA formyltransferase  69.41 
 
 
306 aa  434  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.79271  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0975  methionyl-tRNA formyltransferase  69.41 
 
 
306 aa  434  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.569216  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1345  methionyl-tRNA formyltransferase  67.76 
 
 
306 aa  428  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0055  methionyl-tRNA formyltransferase  69.08 
 
 
311 aa  425  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000555853 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0075  methionyl-tRNA formyltransferase  66.56 
 
 
311 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.716754  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0058  methionyl-tRNA formyltransferase  65.59 
 
 
311 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.820848  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0541  methionyl-tRNA formyltransferase  63.99 
 
 
320 aa  409  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.743734  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3304  methionyl-tRNA formyltransferase  62.46 
 
 
307 aa  376  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0607232  normal  0.664052 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7336  methionyl-tRNA formyltransferase  59.68 
 
 
311 aa  365  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.685492  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1320  methionyl-tRNA formyltransferase  59.34 
 
 
309 aa  366  1e-100  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0674  methionyl-tRNA formyltransferase  57.23 
 
 
312 aa  360  1e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0080  methionyl-tRNA formyltransferase  57.65 
 
 
310 aa  355  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.450016  normal  0.0632026 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0626  methionyl-tRNA formyltransferase  57.74 
 
 
310 aa  355  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274146  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4748  methionyl-tRNA formyltransferase  56.77 
 
 
310 aa  349  4e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130868  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3065  methionyl-tRNA formyltransferase  57.32 
 
 
314 aa  348  5e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38579  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0497  methionyl-tRNA formyltransferase  57.47 
 
 
317 aa  348  5e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.12463  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  58.96 
 
 
310 aa  346  2e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  57.1 
 
 
310 aa  345  5e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1129  methionyl-tRNA formyltransferase  58.09 
 
 
312 aa  343  2e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158103 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0806  methionyl-tRNA formyltransferase  58.55 
 
 
310 aa  335  7e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.283838 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1635  methionyl-tRNA formyltransferase  58.58 
 
 
309 aa  334  1e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.138536  normal  0.117912 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3147  methionyl-tRNA formyltransferase  55.59 
 
 
313 aa  331  8e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  0.377579 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3694  methionyl-tRNA formyltransferase  59.21 
 
 
310 aa  331  1e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1917  methionyl-tRNA formyltransferase  56.63 
 
 
309 aa  326  3e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.741308  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2577  methionyl-tRNA formyltransferase  56.49 
 
 
308 aa  325  5e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  hitchhiker  0.000000800769 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1599  methionyl-tRNA formyltransferase  56.63 
 
 
309 aa  324  1e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0493449 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  57.28 
 
 
297 aa  319  3e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4568  methionyl-tRNA formyltransferase  55.77 
 
 
312 aa  318  7e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0181  methionyl-tRNA formyltransferase  58.61 
 
 
299 aa  318  1e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.142178  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0875  methionyl-tRNA formyltransferase  54.72 
 
 
302 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2535  methionyl-tRNA formyltransferase  54.72 
 
 
302 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.614949  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  55.02 
 
 
302 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0446  methionyl-tRNA formyltransferase  52.56 
 
 
311 aa  301  8.000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  52.6 
 
 
301 aa  296  2e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0347  methionyl-tRNA formyltransferase  48.55 
 
 
305 aa  278  1e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.342124  normal  0.0280325 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2894  methionyl-tRNA formyltransferase  49.84 
 
 
301 aa  277  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3351  methionyl-tRNA formyltransferase  51.91 
 
 
309 aa  276  3e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4042  methionyl-tRNA formyltransferase  48.71 
 
 
308 aa  271  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0410  methionyl-tRNA formyltransferase  47.57 
 
 
301 aa  267  1e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  45.28 
 
 
320 aa  263  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0249  methionyl-tRNA formyltransferase  47.6 
 
 
306 aa  263  2e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.153512 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  44.37 
 
 
314 aa  261  1e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  44.37 
 
 
314 aa  261  1e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  46.01 
 
 
314 aa  258  9e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2549  methionyl-tRNA formyltransferase  48.08 
 
 
320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31631  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2078  methionyl-tRNA formyltransferase  46.69 
 
 
332 aa  253  3e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  46.65 
 
 
310 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  45.9 
 
 
314 aa  251  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00190  methionyl-tRNA formyltransferase  48.36 
 
 
314 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.767541  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  46.01 
 
 
319 aa  249  5e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  43.55 
 
 
312 aa  248  6e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  46.01 
 
 
310 aa  248  9e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  45.72 
 
 
310 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0018  methionyl-tRNA formyltransferase  45.69 
 
 
314 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04056  methionyl-tRNA formyltransferase  47.02 
 
 
307 aa  246  4e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  45.69 
 
 
310 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  45.37 
 
 
310 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0310  methionyl-tRNA formyltransferase  45.51 
 
 
328 aa  240  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0094  methionyl-tRNA formyltransferase  45.34 
 
 
320 aa  240  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.922112  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  44.04 
 
 
315 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  44.04 
 
 
315 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  44.04 
 
 
315 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  41.46 
 
 
318 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  44.44 
 
 
311 aa  239  2.9999999999999997e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  44.04 
 
 
315 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  44.04 
 
 
315 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  47.33 
 
 
307 aa  239  4e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3877  methionyl-tRNA formyltransferase  44.38 
 
 
323 aa  239  4e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  43.71 
 
 
315 aa  239  4e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3123  methionyl-tRNA formyltransferase  45.17 
 
 
327 aa  239  5e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.760657  normal  0.204185 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1777  methionyl-tRNA formyltransferase  42.27 
 
 
332 aa  239  5e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  43.38 
 
 
315 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0020  methionyl-tRNA formyltransferase  43.42 
 
 
322 aa  238  6.999999999999999e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4415  methionyl-tRNA formyltransferase  45.35 
 
 
328 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.628902 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2868  methionyl-tRNA formyltransferase  44.79 
 
 
325 aa  238  6.999999999999999e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  43.71 
 
 
315 aa  238  6.999999999999999e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  45.28 
 
 
310 aa  238  8e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  43.41 
 
 
307 aa  238  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  41.46 
 
 
318 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  41.46 
 
 
318 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1928  methionyl-tRNA formyltransferase  47.19 
 
 
307 aa  237  1e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  41.46 
 
 
318 aa  238  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  41.69 
 
 
312 aa  237  2e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  43.71 
 
 
315 aa  237  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1864  methionyl-tRNA formyltransferase  46.86 
 
 
307 aa  236  3e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  44.73 
 
 
315 aa  236  4e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3181  methionyl-tRNA formyltransferase  44.24 
 
 
327 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6477  methionyl-tRNA formyltransferase  44.55 
 
 
327 aa  235  6e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.79537 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3142  methionyl-tRNA formyltransferase  44.41 
 
 
330 aa  235  6e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.757511  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3064  methionyl-tRNA formyltransferase  43.93 
 
 
327 aa  235  8e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  45.16 
 
 
308 aa  235  9e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2512  methionyl-tRNA formyltransferase  44.41 
 
 
330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  44.55 
 
 
359 aa  234  1.0000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3126  methionyl-tRNA formyltransferase  44.41 
 
 
330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.879337  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4053  methionyl-tRNA formyltransferase  44.14 
 
 
323 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3398  methionyl-tRNA formyltransferase  44.14 
 
 
323 aa  233  3e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.726388  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0160  methionyl-tRNA formyltransferase  44.58 
 
 
327 aa  232  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.701485  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0143  methionyl-tRNA formyltransferase  44.27 
 
 
327 aa  232  5e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  41.8 
 
 
308 aa  232  5e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000823971 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>