More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3304 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3304  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 307 aa  610  1e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0607232  normal  0.664052 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  68.83 
 
 		 310 aa  408  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4748  methionyl-tRNA formyltransferase  67.21 
 
 		 310 aa  402  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130868  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1034  methionyl-tRNA formyltransferase  65.23 
 
 		 306 aa  395  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.79271  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0975  methionyl-tRNA formyltransferase  65.23 
 
 		 306 aa  395  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.569216  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1345  methionyl-tRNA formyltransferase  65.23 
 
 		 306 aa  396  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7336  methionyl-tRNA formyltransferase  63.64 
 
 		 311 aa  392  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.685492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0393  methionyl-tRNA formyltransferase  62.46 
 
 		 311 aa  386  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3147  methionyl-tRNA formyltransferase  66.13 
 
 		 313 aa  383  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  0.377579 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0674  methionyl-tRNA formyltransferase  61.49 
 
 		 312 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0080  methionyl-tRNA formyltransferase  62.95 
 
 		 310 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.450016  normal  0.0632026 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3065  methionyl-tRNA formyltransferase  61.54 
 
 		 314 aa  372  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38579  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0541  methionyl-tRNA formyltransferase  61.81 
 
 		 320 aa  371  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.743734  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1129  methionyl-tRNA formyltransferase  64.69 
 
 		 312 aa  369  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158103 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0626  methionyl-tRNA formyltransferase  61.04 
 
 		 310 aa  368  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274146  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0075  methionyl-tRNA formyltransferase  61.49 
 
 		 311 aa  364  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.716754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0058  methionyl-tRNA formyltransferase  60.52 
 
 		 311 aa  362  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.820848  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1917  methionyl-tRNA formyltransferase  62.46 
 
 		 309 aa  359  4e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.741308  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3694  methionyl-tRNA formyltransferase  62.66 
 
 		 310 aa  358  8e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1599  methionyl-tRNA formyltransferase  62.42 
 
 		 309 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0493449 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1635  methionyl-tRNA formyltransferase  62.46 
 
 		 309 aa  356  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.138536  normal  0.117912 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  61.56 
 
 		 310 aa  354  1e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0806  methionyl-tRNA formyltransferase  63.16 
 
 		 310 aa  346  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.283838 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0055  methionyl-tRNA formyltransferase  58.94 
 
 		 311 aa  345  6e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000555853 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0497  methionyl-tRNA formyltransferase  58.77 
 
 		 317 aa  342  2.9999999999999997e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.12463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2577  methionyl-tRNA formyltransferase  58.82 
 
 		 308 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  hitchhiker  0.000000800769 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0875  methionyl-tRNA formyltransferase  58.36 
 
 		 302 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2535  methionyl-tRNA formyltransferase  58.36 
 
 		 302 aa  318  7e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.614949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  58.31 
 
 		 302 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0446  methionyl-tRNA formyltransferase  56.59 
 
 		 311 aa  318  1e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1320  methionyl-tRNA formyltransferase  52.48 
 
 		 309 aa  317  2e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4568  methionyl-tRNA formyltransferase  55.77 
 
 		 312 aa  314  9.999999999999999e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  58.47 
 
 		 297 aa  314  9.999999999999999e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0181  methionyl-tRNA formyltransferase  57.81 
 
 		 299 aa  310  1e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.142178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2894  methionyl-tRNA formyltransferase  55.37 
 
 		 301 aa  303  3.0000000000000004e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  54.25 
 
 		 301 aa  300  3e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4042  methionyl-tRNA formyltransferase  53.27 
 
 		 308 aa  288  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3351  methionyl-tRNA formyltransferase  52.9 
 
 		 309 aa  279  3e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0249  methionyl-tRNA formyltransferase  51.44 
 
 		 306 aa  279  5e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.153512 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0410  methionyl-tRNA formyltransferase  51.14 
 
 		 301 aa  273  3e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0347  methionyl-tRNA formyltransferase  48.87 
 
 		 305 aa  266  4e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.342124  normal  0.0280325 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2549  methionyl-tRNA formyltransferase  49.35 
 
 		 320 aa  266  4e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31631  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04056  methionyl-tRNA formyltransferase  50.83 
 
 		 307 aa  264  1e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  48.67 
 
 		 314 aa  262  6e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  49.19 
 
 		 307 aa  258  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  43.37 
 
 		 311 aa  257  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  45.75 
 
 		 318 aa  257  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  49.5 
 
 		 314 aa  257  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  48.83 
 
 		 310 aa  256  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  45.75 
 
 		 318 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1928  methionyl-tRNA formyltransferase  48.51 
 
 		 307 aa  253  2.0000000000000002e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1864  methionyl-tRNA formyltransferase  48.18 
 
 		 307 aa  253  2.0000000000000002e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  45.54 
 
 		 311 aa  252  5.000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  46.45 
 
 		 308 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  45.13 
 
 		 312 aa  251  1e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  48.16 
 
 		 319 aa  250  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  45.19 
 
 		 314 aa  251  2e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  45.19 
 
 		 314 aa  251  2e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2868  methionyl-tRNA formyltransferase  48.58 
 
 		 325 aa  250  3e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  45.79 
 
 		 312 aa  249  5e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  44.81 
 
 		 316 aa  249  6e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  42.31 
 
 		 318 aa  248  6e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  48.16 
 
 		 310 aa  248  7e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00190  methionyl-tRNA formyltransferase  49.16 
 
 		 314 aa  248  9e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.767541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  42.31 
 
 		 318 aa  246  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  41.35 
 
 		 318 aa  246  3e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  45.69 
 
 		 314 aa  246  4e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0018  methionyl-tRNA formyltransferase  47.83 
 
 		 314 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  47.49 
 
 		 310 aa  245  8e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  41.67 
 
 		 318 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  47.16 
 
 		 310 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0094  methionyl-tRNA formyltransferase  48.22 
 
 		 320 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.922112  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  47.16 
 
 		 310 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4053  methionyl-tRNA formyltransferase  47.81 
 
 		 323 aa  242  5e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  42.81 
 
 		 321 aa  242  6e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3398  methionyl-tRNA formyltransferase  47.81 
 
 		 323 aa  242  7e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.726388  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  43.63 
 
 		 320 aa  241  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  49.34 
 
 		 307 aa  241  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  42.39 
 
 		 313 aa  241  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0015  methionyl-tRNA formyltransferase  48.72 
 
 		 309 aa  240  2e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.229268 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  45.37 
 
 		 315 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  45.37 
 
 		 315 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  45.37 
 
 		 315 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0831  methionyl-tRNA formyltransferase  46.39 
 
 		 327 aa  239  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  45.37 
 
 		 315 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0393  methionyl-tRNA formyltransferase  42.72 
 
 		 312 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.894516  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  45.37 
 
 		 315 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  43.87 
 
 		 315 aa  239  5e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0037  methionyl-tRNA formyltransferase  40.71 
 
 		 320 aa  239  5e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  45.05 
 
 		 315 aa  239  5e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  45.05 
 
 		 315 aa  239  5.999999999999999e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0020  methionyl-tRNA formyltransferase  44.22 
 
 		 322 aa  239  5.999999999999999e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2627  methionyl-tRNA formyltransferase  48.41 
 
 		 314 aa  239  5.999999999999999e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.640895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  46.91 
 
 		 310 aa  238  6.999999999999999e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  45.37 
 
 		 315 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  43.69 
 
 		 308 aa  238  8e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823971 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  46.01 
 
 		 315 aa  238  9e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  41.8 
 
 		 318 aa  238  9e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  41.8 
 
 		 318 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0351  methionyl-tRNA formyltransferase  47.48 
 
 		 322 aa  238  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.227981 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>