More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0058 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0058  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 
311 aa  624  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.820848  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0075  methionyl-tRNA formyltransferase  93.57 
 
 
311 aa  587  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.716754  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0055  methionyl-tRNA formyltransferase  75.16 
 
 
311 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000555853 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0541  methionyl-tRNA formyltransferase  74.19 
 
 
320 aa  467  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.743734  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0393  methionyl-tRNA formyltransferase  65.59 
 
 
311 aa  413  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1034  methionyl-tRNA formyltransferase  65.55 
 
 
306 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.79271  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0975  methionyl-tRNA formyltransferase  65.55 
 
 
306 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.569216  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1345  methionyl-tRNA formyltransferase  65.55 
 
 
306 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1320  methionyl-tRNA formyltransferase  56.03 
 
 
309 aa  358  7e-98  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0674  methionyl-tRNA formyltransferase  57.23 
 
 
312 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3304  methionyl-tRNA formyltransferase  60.52 
 
 
307 aa  350  2e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0607232  normal  0.664052 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0626  methionyl-tRNA formyltransferase  56.45 
 
 
310 aa  349  3e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274146  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7336  methionyl-tRNA formyltransferase  57.1 
 
 
311 aa  347  1e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.685492  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0080  methionyl-tRNA formyltransferase  57 
 
 
310 aa  344  8.999999999999999e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.450016  normal  0.0632026 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3065  methionyl-tRNA formyltransferase  56.37 
 
 
314 aa  338  5.9999999999999996e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38579  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  56.91 
 
 
310 aa  338  7e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3147  methionyl-tRNA formyltransferase  56.87 
 
 
313 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  0.377579 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1129  methionyl-tRNA formyltransferase  57.1 
 
 
312 aa  334  9e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158103 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0806  methionyl-tRNA formyltransferase  59.54 
 
 
310 aa  332  4e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.283838 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2577  methionyl-tRNA formyltransferase  58.12 
 
 
308 aa  332  7.000000000000001e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  hitchhiker  0.000000800769 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4748  methionyl-tRNA formyltransferase  55.63 
 
 
310 aa  330  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130868  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  55.37 
 
 
310 aa  327  1.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3694  methionyl-tRNA formyltransferase  56.27 
 
 
310 aa  324  9e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1635  methionyl-tRNA formyltransferase  56.96 
 
 
309 aa  323  3e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.138536  normal  0.117912 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1599  methionyl-tRNA formyltransferase  55.81 
 
 
309 aa  317  1e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0493449 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0181  methionyl-tRNA formyltransferase  57.24 
 
 
299 aa  316  3e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.142178  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1917  methionyl-tRNA formyltransferase  55.99 
 
 
309 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.741308  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0497  methionyl-tRNA formyltransferase  53.9 
 
 
317 aa  313  2.9999999999999996e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.12463  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  56.29 
 
 
297 aa  307  1.0000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0446  methionyl-tRNA formyltransferase  52.41 
 
 
311 aa  307  2.0000000000000002e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  54.55 
 
 
301 aa  302  5.000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4568  methionyl-tRNA formyltransferase  54.31 
 
 
312 aa  301  1e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  54.1 
 
 
302 aa  295  6e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2535  methionyl-tRNA formyltransferase  52.77 
 
 
302 aa  295  6e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.614949  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0875  methionyl-tRNA formyltransferase  52.44 
 
 
302 aa  294  1e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0249  methionyl-tRNA formyltransferase  50.96 
 
 
306 aa  286  2e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.153512 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4042  methionyl-tRNA formyltransferase  50 
 
 
308 aa  286  4e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3351  methionyl-tRNA formyltransferase  53.5 
 
 
309 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2894  methionyl-tRNA formyltransferase  50.97 
 
 
301 aa  282  5.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  48.23 
 
 
307 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2868  methionyl-tRNA formyltransferase  49.53 
 
 
325 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0410  methionyl-tRNA formyltransferase  49.51 
 
 
301 aa  263  4e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  49.01 
 
 
314 aa  260  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2549  methionyl-tRNA formyltransferase  49.68 
 
 
320 aa  259  3e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31631  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0347  methionyl-tRNA formyltransferase  45.95 
 
 
305 aa  259  4e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.342124  normal  0.0280325 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  45.36 
 
 
314 aa  256  2e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  45.36 
 
 
314 aa  256  2e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  48.33 
 
 
314 aa  256  3e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0020  methionyl-tRNA formyltransferase  47.06 
 
 
322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00190  methionyl-tRNA formyltransferase  50 
 
 
314 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.767541  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3398  methionyl-tRNA formyltransferase  48.46 
 
 
323 aa  252  5.000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.726388  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4053  methionyl-tRNA formyltransferase  48.46 
 
 
323 aa  252  6e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  46.96 
 
 
310 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  47.94 
 
 
310 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  47.94 
 
 
310 aa  249  6e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3123  methionyl-tRNA formyltransferase  47.53 
 
 
327 aa  248  6e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.760657  normal  0.204185 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0018  methionyl-tRNA formyltransferase  49.17 
 
 
314 aa  248  7e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6477  methionyl-tRNA formyltransferase  47.22 
 
 
327 aa  248  7e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.79537 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  48.18 
 
 
310 aa  248  7e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  42.31 
 
 
312 aa  248  8e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  47.62 
 
 
310 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04056  methionyl-tRNA formyltransferase  47.7 
 
 
307 aa  247  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0094  methionyl-tRNA formyltransferase  46.47 
 
 
320 aa  246  3e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.922112  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1864  methionyl-tRNA formyltransferase  47.04 
 
 
307 aa  246  4.9999999999999997e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  47.18 
 
 
319 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1928  methionyl-tRNA formyltransferase  47.21 
 
 
307 aa  244  9.999999999999999e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  45 
 
 
311 aa  243  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3181  methionyl-tRNA formyltransferase  47.22 
 
 
327 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  44.48 
 
 
312 aa  242  5e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  43.99 
 
 
320 aa  242  5e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3064  methionyl-tRNA formyltransferase  46.91 
 
 
327 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3142  methionyl-tRNA formyltransferase  46.75 
 
 
330 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.757511  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  46.71 
 
 
307 aa  241  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  46.13 
 
 
308 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2512  methionyl-tRNA formyltransferase  46.75 
 
 
330 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3126  methionyl-tRNA formyltransferase  46.75 
 
 
330 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.879337  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00160  methionyl-tRNA formyltransferase  48.49 
 
 
325 aa  239  4e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  44.9 
 
 
315 aa  238  8e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  43.87 
 
 
318 aa  238  9e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0310  methionyl-tRNA formyltransferase  46.27 
 
 
328 aa  237  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4415  methionyl-tRNA formyltransferase  46.73 
 
 
328 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.628902 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4690  methionyl-tRNA formyltransferase  47.87 
 
 
329 aa  236  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  43.55 
 
 
318 aa  235  6e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  44.37 
 
 
308 aa  235  7e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000823971 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0072  methionyl-tRNA formyltransferase  45.96 
 
 
327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  42.53 
 
 
315 aa  233  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0143  methionyl-tRNA formyltransferase  45.37 
 
 
327 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0351  methionyl-tRNA formyltransferase  46.44 
 
 
322 aa  233  4.0000000000000004e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.227981 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2275  methionyl-tRNA formyltransferase  45.37 
 
 
337 aa  232  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2805  methionyl-tRNA formyltransferase  45.37 
 
 
337 aa  232  5e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0347  methionyl-tRNA formyltransferase  45.37 
 
 
327 aa  233  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2353  methionyl-tRNA formyltransferase  45.37 
 
 
337 aa  232  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  45.37 
 
 
327 aa  232  6e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0129  methionyl-tRNA formyltransferase  45.65 
 
 
328 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0160  methionyl-tRNA formyltransferase  45.37 
 
 
327 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.701485  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3407  methionyl-tRNA formyltransferase  45.2 
 
 
331 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.667416  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  44.81 
 
 
318 aa  230  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  45.19 
 
 
310 aa  230  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  43.04 
 
 
316 aa  231  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0036  methionyl-tRNA formyltransferase  45.45 
 
 
327 aa  230  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>