More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0410 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0410  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 301 aa  592  1e-168  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0347  methionyl-tRNA formyltransferase  61.51 
 
 		 305 aa  351  8e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.342124  normal  0.0280325 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2535  methionyl-tRNA formyltransferase  57.14 
 
 		 302 aa  315  8e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.614949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0249  methionyl-tRNA formyltransferase  56.35 
 
 		 306 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.153512 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0875  methionyl-tRNA formyltransferase  56.48 
 
 		 302 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2577  methionyl-tRNA formyltransferase  54.3 
 
 		 308 aa  311  1e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  hitchhiker  0.000000800769 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2894  methionyl-tRNA formyltransferase  55.45 
 
 		 301 aa  305  9.000000000000001e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  55 
 
 		 302 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4042  methionyl-tRNA formyltransferase  55.92 
 
 		 308 aa  294  1e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  53.82 
 
 		 310 aa  287  1e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0080  methionyl-tRNA formyltransferase  52.13 
 
 		 310 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.450016  normal  0.0632026 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  55.48 
 
 		 297 aa  286  2.9999999999999996e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0626  methionyl-tRNA formyltransferase  51.46 
 
 		 310 aa  285  9e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274146  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0181  methionyl-tRNA formyltransferase  54.95 
 
 		 299 aa  280  2e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.142178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0674  methionyl-tRNA formyltransferase  50.65 
 
 		 312 aa  279  5e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  51.66 
 
 		 301 aa  278  9e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7336  methionyl-tRNA formyltransferase  51.29 
 
 		 311 aa  275  5e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.685492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0075  methionyl-tRNA formyltransferase  51.13 
 
 		 311 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.716754  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1034  methionyl-tRNA formyltransferase  50.17 
 
 		 306 aa  273  2.0000000000000002e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.79271  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1345  methionyl-tRNA formyltransferase  49.67 
 
 		 306 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0975  methionyl-tRNA formyltransferase  50.17 
 
 		 306 aa  273  4.0000000000000004e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.569216  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0055  methionyl-tRNA formyltransferase  49.35 
 
 		 311 aa  272  6e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000555853 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3065  methionyl-tRNA formyltransferase  50.64 
 
 		 314 aa  268  1e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38579  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0393  methionyl-tRNA formyltransferase  47.57 
 
 		 311 aa  267  1e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4568  methionyl-tRNA formyltransferase  50.32 
 
 		 312 aa  266  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0446  methionyl-tRNA formyltransferase  48.71 
 
 		 311 aa  266  2.9999999999999995e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  49.34 
 
 		 307 aa  266  4e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0094  methionyl-tRNA formyltransferase  50.81 
 
 		 320 aa  266  4e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.922112  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0351  methionyl-tRNA formyltransferase  50.47 
 
 		 322 aa  265  8.999999999999999e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.227981 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  50 
 
 		 318 aa  263  3e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3351  methionyl-tRNA formyltransferase  50.81 
 
 		 309 aa  262  4e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0806  methionyl-tRNA formyltransferase  52.98 
 
 		 310 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.283838 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0058  methionyl-tRNA formyltransferase  49.51 
 
 		 311 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.820848  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3304  methionyl-tRNA formyltransferase  50.81 
 
 		 307 aa  260  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0607232  normal  0.664052 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  48.38 
 
 		 310 aa  258  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  47.88 
 
 		 312 aa  256  2e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0541  methionyl-tRNA formyltransferase  48.06 
 
 		 320 aa  255  7e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.743734  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3694  methionyl-tRNA formyltransferase  50.33 
 
 		 310 aa  254  9e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1129  methionyl-tRNA formyltransferase  50 
 
 		 312 aa  253  3e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158103 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1320  methionyl-tRNA formyltransferase  47.21 
 
 		 309 aa  253  3e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4638  methionyl-tRNA formyltransferase  49.84 
 
 		 357 aa  252  7e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.857325  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0072  methionyl-tRNA formyltransferase  48.91 
 
 		 327 aa  251  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3859  methionyl-tRNA formyltransferase  50.81 
 
 		 323 aa  251  1e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3123  methionyl-tRNA formyltransferase  49.21 
 
 		 327 aa  250  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.760657  normal  0.204185 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4748  methionyl-tRNA formyltransferase  46.43 
 
 		 310 aa  249  4e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130868  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0831  methionyl-tRNA formyltransferase  48.43 
 
 		 327 aa  248  7e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4053  methionyl-tRNA formyltransferase  48.44 
 
 		 323 aa  248  8e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3398  methionyl-tRNA formyltransferase  48.12 
 
 		 323 aa  247  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.726388  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3677  methionyl-tRNA formyltransferase  47.34 
 
 		 327 aa  247  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  47.9 
 
 		 308 aa  246  3e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6477  methionyl-tRNA formyltransferase  47.63 
 
 		 327 aa  246  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.79537 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3181  methionyl-tRNA formyltransferase  48.26 
 
 		 327 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3407  methionyl-tRNA formyltransferase  47.66 
 
 		 331 aa  246  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.667416  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3142  methionyl-tRNA formyltransferase  47.19 
 
 		 330 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.757511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3064  methionyl-tRNA formyltransferase  47.95 
 
 		 327 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  45.13 
 
 		 308 aa  245  8e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823971 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3354  methionyl-tRNA formyltransferase  47.02 
 
 		 327 aa  244  9e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2512  methionyl-tRNA formyltransferase  47.19 
 
 		 330 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3126  methionyl-tRNA formyltransferase  47.19 
 
 		 330 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.879337  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4690  methionyl-tRNA formyltransferase  48.77 
 
 		 329 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0284  methionyl-tRNA formyltransferase  50.17 
 
 		 315 aa  243  3e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0176978 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  44.84 
 
 		 312 aa  243  3e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  46.84 
 
 		 311 aa  243  3.9999999999999997e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  46.6 
 
 		 359 aa  242  3.9999999999999997e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0347  methionyl-tRNA formyltransferase  47.95 
 
 		 327 aa  242  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  47.95 
 
 		 327 aa  242  6e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2275  methionyl-tRNA formyltransferase  47.63 
 
 		 337 aa  242  7e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2353  methionyl-tRNA formyltransferase  47.63 
 
 		 337 aa  242  7e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2805  methionyl-tRNA formyltransferase  47.63 
 
 		 337 aa  242  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0143  methionyl-tRNA formyltransferase  47.63 
 
 		 327 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0129  methionyl-tRNA formyltransferase  47.32 
 
 		 328 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  46.18 
 
 		 315 aa  241  1e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  46.18 
 
 		 315 aa  241  1e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  46.18 
 
 		 315 aa  241  1e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  46.18 
 
 		 315 aa  241  1e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  46.18 
 
 		 315 aa  241  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0160  methionyl-tRNA formyltransferase  47.63 
 
 		 327 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.701485  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  46.18 
 
 		 315 aa  241  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1917  methionyl-tRNA formyltransferase  46.45 
 
 		 309 aa  241  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.741308  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  45.85 
 
 		 315 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  45.85 
 
 		 315 aa  239  4e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1635  methionyl-tRNA formyltransferase  46.45 
 
 		 309 aa  239  4e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.138536  normal  0.117912 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  40.2 
 
 		 310 aa  239  4e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  42.86 
 
 		 318 aa  239  4e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  48.84 
 
 		 307 aa  239  5e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3147  methionyl-tRNA formyltransferase  46.18 
 
 		 313 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  0.377579 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  45.66 
 
 		 315 aa  238  5.999999999999999e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  46.13 
 
 		 310 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  47.55 
 
 		 314 aa  237  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1777  methionyl-tRNA formyltransferase  44.34 
 
 		 332 aa  237  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  46.13 
 
 		 310 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  44.85 
 
 		 314 aa  236  3e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  46.13 
 
 		 319 aa  236  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  42.21 
 
 		 311 aa  236  3e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  44.85 
 
 		 314 aa  236  3e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  46.13 
 
 		 310 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  45.81 
 
 		 310 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  42.53 
 
 		 318 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  45.51 
 
 		 315 aa  235  7e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  46.49 
 
 		 315 aa  235  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>