More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2549 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2549  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 320 aa  633    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31631  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1472  methionyl-tRNA formyltransferase  55.74 
 
 		 314 aa  315  9e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  52.26 
 
 		 315 aa  301  1e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0487  methionyl-tRNA formyltransferase  51.64 
 
 		 314 aa  298  6e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0899  methionyl-tRNA formyltransferase  53.07 
 
 		 317 aa  298  7e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  49.68 
 
 		 318 aa  296  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  50 
 
 		 318 aa  294  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1570  methionyl-tRNA formyltransferase  48.87 
 
 		 317 aa  293  3e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00793908 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  54.67 
 
 		 359 aa  293  3e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  51.77 
 
 		 311 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  50.49 
 
 		 311 aa  288  8e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1053  methionyl-tRNA formyltransferase  50.49 
 
 		 312 aa  288  1e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  45.75 
 
 		 310 aa  285  5.999999999999999e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  50 
 
 		 316 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1570  methionyl-tRNA formyltransferase  44 
 
 		 302 aa  279  3e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.117163  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0513  methionyl-tRNA formyltransferase  49.18 
 
 		 319 aa  280  3e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1787  methionyl-tRNA formyltransferase  49.51 
 
 		 319 aa  278  6e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  47.23 
 
 		 313 aa  278  7e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1860  methionyl-tRNA formyltransferase  47.28 
 
 		 315 aa  277  1e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.346485  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  48.05 
 
 		 317 aa  276  3e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09618  methionyl-tRNA formyltransferase  45.78 
 
 		 315 aa  275  7e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.315311  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4814  methionyl-tRNA formyltransferase  47.33 
 
 		 297 aa  275  9e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1221  methionyl-tRNA formyltransferase  45.57 
 
 		 304 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.820089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  47.56 
 
 		 311 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  45.81 
 
 		 317 aa  269  5e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2023  methionyl-tRNA formyltransferase  46.79 
 
 		 323 aa  267  2e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.030686 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1678  methionyl-tRNA formyltransferase  46.58 
 
 		 318 aa  265  8.999999999999999e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1345  methionyl-tRNA formyltransferase  48.34 
 
 		 306 aa  263  3e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  47.71 
 
 		 301 aa  261  2e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3304  methionyl-tRNA formyltransferase  49.35 
 
 		 307 aa  260  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0607232  normal  0.664052 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0138  methionyl-tRNA formyltransferase  41.58 
 
 		 315 aa  260  2e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.483644  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0058  methionyl-tRNA formyltransferase  49.68 
 
 		 311 aa  259  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.820848  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2577  methionyl-tRNA formyltransferase  48.04 
 
 		 308 aa  260  3e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  hitchhiker  0.000000800769 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6485  methionyl-tRNA formyltransferase  42.41 
 
 		 315 aa  259  4e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.53373  normal  0.520037 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1034  methionyl-tRNA formyltransferase  47.68 
 
 		 306 aa  258  8e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.79271  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0975  methionyl-tRNA formyltransferase  47.68 
 
 		 306 aa  258  9e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.569216  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2313  methionyl-tRNA formyltransferase  45.21 
 
 		 312 aa  258  1e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490925  hitchhiker  0.0006759 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  49.33 
 
 		 297 aa  257  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  47.59 
 
 		 310 aa  256  4e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  40.51 
 
 		 312 aa  255  6e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4748  methionyl-tRNA formyltransferase  47.76 
 
 		 310 aa  255  6e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130868  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0393  methionyl-tRNA formyltransferase  48.08 
 
 		 311 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1921  hypothetical protein  44.26 
 
 		 297 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3065  methionyl-tRNA formyltransferase  45.25 
 
 		 314 aa  253  3e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38579  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  47.33 
 
 		 302 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  45.02 
 
 		 310 aa  252  5.000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0075  methionyl-tRNA formyltransferase  48.08 
 
 		 311 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.716754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2535  methionyl-tRNA formyltransferase  46.89 
 
 		 302 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.614949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  43.09 
 
 		 309 aa  251  1e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0547193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09900  methionyl-tRNA formyltransferase  42.72 
 
 		 316 aa  250  2e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0806  methionyl-tRNA formyltransferase  47.56 
 
 		 310 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.283838 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0055  methionyl-tRNA formyltransferase  47.71 
 
 		 311 aa  250  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000555853 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  44.19 
 
 		 311 aa  251  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1490  methionyl-tRNA formyltransferase  43.55 
 
 		 316 aa  249  3e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0875  methionyl-tRNA formyltransferase  46.56 
 
 		 302 aa  249  6e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3694  methionyl-tRNA formyltransferase  44.87 
 
 		 310 aa  247  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00190  methionyl-tRNA formyltransferase  48.28 
 
 		 314 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.767541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2232  methionyl-tRNA formyltransferase  44.41 
 
 		 313 aa  245  8e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  45.36 
 
 		 314 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3564  methionyl-tRNA formyltransferase  44.44 
 
 		 344 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1231  methionyl-tRNA formyltransferase  40.07 
 
 		 314 aa  242  7e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000178496  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  43.18 
 
 		 308 aa  241  1e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4568  methionyl-tRNA formyltransferase  45.71 
 
 		 312 aa  241  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0674  methionyl-tRNA formyltransferase  43.17 
 
 		 312 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0541  methionyl-tRNA formyltransferase  45.66 
 
 		 320 aa  240  2.9999999999999997e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.743734  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7336  methionyl-tRNA formyltransferase  43.45 
 
 		 311 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.685492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  46.21 
 
 		 314 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0094  methionyl-tRNA formyltransferase  42.59 
 
 		 320 aa  239  4e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.922112  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0080  methionyl-tRNA formyltransferase  43.41 
 
 		 310 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.450016  normal  0.0632026 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0181  methionyl-tRNA formyltransferase  47.67 
 
 		 299 aa  239  5e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.142178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  46.05 
 
 		 319 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0782  methionyl-tRNA formyltransferase  41.81 
 
 		 310 aa  238  6.999999999999999e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.606283  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0018  methionyl-tRNA formyltransferase  46.05 
 
 		 314 aa  238  9e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00160  methionyl-tRNA formyltransferase  47.32 
 
 		 325 aa  238  9e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3407  methionyl-tRNA formyltransferase  43.83 
 
 		 331 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.667416  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3354  methionyl-tRNA formyltransferase  42.55 
 
 		 327 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  41.86 
 
 		 318 aa  237  2e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  45.86 
 
 		 310 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  41.04 
 
 		 308 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823971 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  40.65 
 
 		 314 aa  235  7e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  40.13 
 
 		 314 aa  235  8e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  40.13 
 
 		 314 aa  235  8e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3147  methionyl-tRNA formyltransferase  44.94 
 
 		 313 aa  235  9e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  0.377579 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1275  methionyl-tRNA formyltransferase  42.33 
 
 		 311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0626  methionyl-tRNA formyltransferase  42.86 
 
 		 310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274146  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1300  methionyl-tRNA formyltransferase  42.33 
 
 		 311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247026  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1176  methionyl-tRNA formyltransferase  38.39 
 
 		 309 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0139658  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  43.58 
 
 		 310 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3677  methionyl-tRNA formyltransferase  42.86 
 
 		 327 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  41.35 
 
 		 320 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  41.16 
 
 		 315 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  41.16 
 
 		 315 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  41.16 
 
 		 315 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  41.16 
 
 		 315 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  41.16 
 
 		 315 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  40.84 
 
 		 315 aa  231  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  40.71 
 
 		 315 aa  231  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1467  methionyl-tRNA formyltransferase  46.41 
 
 		 306 aa  231  1e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0397972  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  40.71 
 
 		 315 aa  230  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  40.38 
 
 		 311 aa  231  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>