More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2232 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2232  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 313 aa  625  1e-178  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  46.93 
 
 		 310 aa  301  1e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  46.25 
 
 		 317 aa  290  2e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  46.08 
 
 		 311 aa  289  4e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  41.8 
 
 		 312 aa  281  1e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0513  methionyl-tRNA formyltransferase  46.05 
 
 		 319 aa  280  2e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  43.79 
 
 		 313 aa  278  7e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  44.59 
 
 		 316 aa  277  1e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  44.44 
 
 		 318 aa  276  4e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  43.37 
 
 		 311 aa  275  7e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  44.44 
 
 		 318 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  47.68 
 
 		 318 aa  265  1e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2313  methionyl-tRNA formyltransferase  42.58 
 
 		 312 aa  264  1e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490925  hitchhiker  0.0006759 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  44.15 
 
 		 311 aa  263  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  43.93 
 
 		 359 aa  262  6.999999999999999e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  42 
 
 		 318 aa  262  6.999999999999999e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  44.76 
 
 		 315 aa  260  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  45.33 
 
 		 311 aa  260  2e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  44.76 
 
 		 315 aa  260  3e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  41.94 
 
 		 315 aa  259  4e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4228  methionyl-tRNA formyltransferase  47.18 
 
 		 312 aa  259  4e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  45.36 
 
 		 315 aa  259  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  40.45 
 
 		 317 aa  259  6e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  44.16 
 
 		 312 aa  258  7e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  45.36 
 
 		 315 aa  258  8e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  45.36 
 
 		 315 aa  258  8e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  45.36 
 
 		 315 aa  258  8e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  45.36 
 
 		 315 aa  258  8e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  45.36 
 
 		 315 aa  258  8e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  44.13 
 
 		 315 aa  258  8e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  45.03 
 
 		 315 aa  258  9e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  44.26 
 
 		 311 aa  256  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  42.26 
 
 		 312 aa  252  5.000000000000001e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2582  methionyl-tRNA formyltransferase  43.35 
 
 		 328 aa  251  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0097642  normal  0.0138205 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  43.28 
 
 		 315 aa  250  3e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  43.71 
 
 		 319 aa  249  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2084  methionyl-tRNA formyltransferase  46.53 
 
 		 311 aa  249  4e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198796  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09900  methionyl-tRNA formyltransferase  40.51 
 
 		 316 aa  249  4e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2491  methionyl-tRNA formyltransferase  40.51 
 
 		 319 aa  249  4e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  43.49 
 
 		 315 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  43.49 
 
 		 315 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  43.49 
 
 		 315 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  43.49 
 
 		 315 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  43.05 
 
 		 314 aa  248  6e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1953  methionyl-tRNA formyltransferase  43.51 
 
 		 319 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1921  hypothetical protein  41.69 
 
 		 297 aa  247  2e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  43.17 
 
 		 315 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7336  methionyl-tRNA formyltransferase  42.49 
 
 		 311 aa  246  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.685492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1570  methionyl-tRNA formyltransferase  41.06 
 
 		 302 aa  245  4.9999999999999997e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.117163  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2549  methionyl-tRNA formyltransferase  44.41 
 
 		 320 aa  245  8e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31631  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  40.81 
 
 		 320 aa  245  8e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  44.74 
 
 		 310 aa  244  9.999999999999999e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1864  methionyl-tRNA formyltransferase  44.63 
 
 		 307 aa  244  9.999999999999999e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  41.2 
 
 		 314 aa  243  3e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00392  methionyl-tRNA formyltransferase  41.97 
 
 		 315 aa  243  3e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  41.28 
 
 		 314 aa  242  7e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  43.62 
 
 		 310 aa  241  9e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3123  methionyl-tRNA formyltransferase  43.79 
 
 		 327 aa  241  9e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.760657  normal  0.204185 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0036  methionyl-tRNA formyltransferase  42.37 
 
 		 327 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  43.29 
 
 		 310 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1928  methionyl-tRNA formyltransferase  43.96 
 
 		 307 aa  241  1e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1642  methionyl-tRNA formyltransferase  41.61 
 
 		 312 aa  240  2e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  43.29 
 
 		 310 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04056  methionyl-tRNA formyltransferase  44.15 
 
 		 307 aa  240  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  42.31 
 
 		 314 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0943  methionyl-tRNA formyltransferase  40.86 
 
 		 326 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4415  methionyl-tRNA formyltransferase  43.96 
 
 		 328 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.628902 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00190  methionyl-tRNA formyltransferase  44 
 
 		 314 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.767541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4814  methionyl-tRNA formyltransferase  40.6 
 
 		 297 aa  239  4e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  43.29 
 
 		 310 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0310  methionyl-tRNA formyltransferase  43.65 
 
 		 328 aa  239  5e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0094  methionyl-tRNA formyltransferase  44.66 
 
 		 320 aa  238  6.999999999999999e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.922112  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0449  methionyl-tRNA formyltransferase  45.54 
 
 		 342 aa  238  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.353128  normal  0.364478 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  42.91 
 
 		 310 aa  238  8e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1221  methionyl-tRNA formyltransferase  43.05 
 
 		 304 aa  238  1e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.820089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1714  methionyl-tRNA formyltransferase  38.89 
 
 		 309 aa  238  1e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  40.32 
 
 		 318 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3181  methionyl-tRNA formyltransferase  43.17 
 
 		 327 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3064  methionyl-tRNA formyltransferase  43.17 
 
 		 327 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  40.26 
 
 		 332 aa  237  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.982881  normal  0.112275 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1524  methionyl-tRNA formyltransferase  41.37 
 
 		 320 aa  237  2e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3142  methionyl-tRNA formyltransferase  43.38 
 
 		 330 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.757511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  41.14 
 
 		 312 aa  236  3e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  40.8 
 
 		 313 aa  236  4e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2512  methionyl-tRNA formyltransferase  43.38 
 
 		 330 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3126  methionyl-tRNA formyltransferase  43.38 
 
 		 330 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.879337  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3689  methionyl-tRNA formyltransferase  38.39 
 
 		 314 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  40.51 
 
 		 318 aa  235  6e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  40.32 
 
 		 318 aa  235  6e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  40.32 
 
 		 318 aa  235  6e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6477  methionyl-tRNA formyltransferase  42.86 
 
 		 327 aa  235  7e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.79537 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  40.51 
 
 		 318 aa  235  7e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188499 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  39.68 
 
 		 318 aa  235  8e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  40.51 
 
 		 318 aa  235  9e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  39.35 
 
 		 311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3625  methionyl-tRNA formyltransferase  38.39 
 
 		 314 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000492096  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3877  methionyl-tRNA formyltransferase  40.88 
 
 		 323 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4004  methionyl-tRNA formyltransferase  38.39 
 
 		 314 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  43 
 
 		 314 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  40.26 
 
 		 318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>