More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1490 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1490  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 316 aa  652    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0138  methionyl-tRNA formyltransferase  55.66 
 
 		 315 aa  364  1e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.483644  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4814  methionyl-tRNA formyltransferase  54.52 
 
 		 297 aa  328  5.0000000000000004e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6485  methionyl-tRNA formyltransferase  55.74 
 
 		 315 aa  328  6e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.53373  normal  0.520037 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09618  methionyl-tRNA formyltransferase  52.13 
 
 		 315 aa  323  3e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.315311  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1221  methionyl-tRNA formyltransferase  55.08 
 
 		 304 aa  322  4e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.820089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1570  methionyl-tRNA formyltransferase  51.97 
 
 		 302 aa  306  3e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.117163  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1053  methionyl-tRNA formyltransferase  51.82 
 
 		 312 aa  301  8.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2023  methionyl-tRNA formyltransferase  45.91 
 
 		 323 aa  291  1e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.030686 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1921  hypothetical protein  47.65 
 
 		 297 aa  267  2e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  43.45 
 
 		 318 aa  256  3e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  43.13 
 
 		 318 aa  256  4e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  43.45 
 
 		 313 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  43.27 
 
 		 359 aa  253  4.0000000000000004e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2549  methionyl-tRNA formyltransferase  43.55 
 
 		 320 aa  249  3e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31631  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  43.09 
 
 		 311 aa  246  3e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  42.36 
 
 		 317 aa  245  6e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1714  methionyl-tRNA formyltransferase  42.68 
 
 		 309 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  43.18 
 
 		 312 aa  239  5e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0899  methionyl-tRNA formyltransferase  43.13 
 
 		 317 aa  239  5e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1996  methionyl-tRNA formyltransferase  42.68 
 
 		 309 aa  239  6.999999999999999e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  42.36 
 
 		 311 aa  238  8e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0513  methionyl-tRNA formyltransferase  41.99 
 
 		 319 aa  238  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  41.69 
 
 		 315 aa  235  9e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1570  methionyl-tRNA formyltransferase  41.9 
 
 		 317 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00793908 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  41.53 
 
 		 310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  41.37 
 
 		 315 aa  233  3e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  41.37 
 
 		 315 aa  233  3e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  41.37 
 
 		 315 aa  233  3e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  41.37 
 
 		 315 aa  233  3e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  41.37 
 
 		 315 aa  233  3e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  41.37 
 
 		 315 aa  233  3e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  41.37 
 
 		 315 aa  233  3e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  40.66 
 
 		 311 aa  233  4.0000000000000004e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  41.04 
 
 		 315 aa  232  5e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3000  methionyl-tRNA formyltransferase  41.21 
 
 		 308 aa  230  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0437614  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3177  methionyl-tRNA formyltransferase  41.01 
 
 		 315 aa  230  3e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000345004  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  40.52 
 
 		 315 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  40.85 
 
 		 315 aa  229  4e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  40.52 
 
 		 315 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  40.52 
 
 		 315 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  40.52 
 
 		 315 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  40.78 
 
 		 309 aa  229  5e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0547193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  41.46 
 
 		 317 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1678  methionyl-tRNA formyltransferase  41.96 
 
 		 318 aa  228  1e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  40.75 
 
 		 316 aa  227  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  40.2 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  40.88 
 
 		 332 aa  226  4e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.982881  normal  0.112275 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2232  methionyl-tRNA formyltransferase  41.03 
 
 		 313 aa  226  4e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  40.46 
 
 		 318 aa  226  4e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 318 aa  225  9e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0487  methionyl-tRNA formyltransferase  39.24 
 
 		 314 aa  224  1e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  43.61 
 
 		 311 aa  224  2e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  42.17 
 
 		 311 aa  223  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 318 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1860  methionyl-tRNA formyltransferase  41.32 
 
 		 315 aa  224  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.346485  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  39.29 
 
 		 308 aa  222  8e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  41.45 
 
 		 310 aa  221  9e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1176  methionyl-tRNA formyltransferase  41.42 
 
 		 309 aa  221  9.999999999999999e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0139658  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  41.78 
 
 		 310 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2313  methionyl-tRNA formyltransferase  39.94 
 
 		 312 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490925  hitchhiker  0.0006759 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1787  methionyl-tRNA formyltransferase  39.75 
 
 		 319 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  41.78 
 
 		 310 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  38.61 
 
 		 320 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1472  methionyl-tRNA formyltransferase  40.45 
 
 		 314 aa  220  3e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  39.94 
 
 		 314 aa  220  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  39.02 
 
 		 318 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  39.02 
 
 		 318 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  40.66 
 
 		 308 aa  219  6e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823971 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  38.69 
 
 		 318 aa  218  7e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1278  methionyl-tRNA formyltransferase  41.83 
 
 		 314 aa  219  7e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.289128 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  40.13 
 
 		 313 aa  218  7.999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  39.02 
 
 		 318 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188499 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3965  methionyl-tRNA formyltransferase  41.5 
 
 		 314 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3880  methionyl-tRNA formyltransferase  41.18 
 
 		 314 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43125e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3717  methionyl-tRNA formyltransferase  41.18 
 
 		 314 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00223065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3625  methionyl-tRNA formyltransferase  41.18 
 
 		 314 aa  218  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000492096  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  40.07 
 
 		 315 aa  218  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4004  methionyl-tRNA formyltransferase  41.18 
 
 		 314 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2491  methionyl-tRNA formyltransferase  38.68 
 
 		 319 aa  218  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3914  methionyl-tRNA formyltransferase  41.18 
 
 		 314 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00718662  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  40.85 
 
 		 312 aa  218  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  41.12 
 
 		 310 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0782  methionyl-tRNA formyltransferase  42.3 
 
 		 310 aa  217  2e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.606283  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  38.69 
 
 		 318 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  38.76 
 
 		 315 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0037  methionyl-tRNA formyltransferase  37.97 
 
 		 320 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  38.76 
 
 		 315 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  41.18 
 
 		 318 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  38.76 
 
 		 315 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  37.17 
 
 		 329 aa  216  4e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0590691 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  40.75 
 
 		 315 aa  216  4e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  40.52 
 
 		 314 aa  216  5e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  38.26 
 
 		 318 aa  216  5e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  39.74 
 
 		 315 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3607  methionyl-tRNA formyltransferase  40.85 
 
 		 314 aa  215  9e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  41.04 
 
 		 319 aa  215  9e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0020  methionyl-tRNA formyltransferase  40.26 
 
 		 322 aa  215  9e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 314 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  37.83 
 
 		 314 aa  214  1.9999999999999998e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>