More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0138 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0138  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 315 aa  638    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.483644  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09618  methionyl-tRNA formyltransferase  57.01 
 
 		 315 aa  372  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.315311  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1490  methionyl-tRNA formyltransferase  55.66 
 
 		 316 aa  364  1e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1221  methionyl-tRNA formyltransferase  54.58 
 
 		 304 aa  332  5e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.820089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6485  methionyl-tRNA formyltransferase  50.49 
 
 		 315 aa  315  6e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.53373  normal  0.520037 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4814  methionyl-tRNA formyltransferase  49.33 
 
 		 297 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1053  methionyl-tRNA formyltransferase  48.86 
 
 		 312 aa  299  5e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2023  methionyl-tRNA formyltransferase  45.57 
 
 		 323 aa  293  3e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.030686 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1570  methionyl-tRNA formyltransferase  50 
 
 		 302 aa  290  2e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.117163  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2549  methionyl-tRNA formyltransferase  41.58 
 
 		 320 aa  260  2e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31631  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1921  hypothetical protein  44.97 
 
 		 297 aa  246  3e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  40.06 
 
 		 317 aa  240  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  39.34 
 
 		 311 aa  237  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  40.46 
 
 		 310 aa  237  2e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  37.95 
 
 		 359 aa  236  4e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  40.38 
 
 		 311 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1570  methionyl-tRNA formyltransferase  39.56 
 
 		 317 aa  236  5.0000000000000005e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00793908 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2491  methionyl-tRNA formyltransferase  40.39 
 
 		 319 aa  235  7e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0487  methionyl-tRNA formyltransferase  40.63 
 
 		 314 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  39.48 
 
 		 318 aa  233  5e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0037  methionyl-tRNA formyltransferase  40.85 
 
 		 320 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  40.72 
 
 		 316 aa  231  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  39.16 
 
 		 318 aa  230  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  39.81 
 
 		 313 aa  231  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0899  methionyl-tRNA formyltransferase  38.56 
 
 		 317 aa  230  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  38.99 
 
 		 318 aa  229  7e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188499 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  38.68 
 
 		 318 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  37.5 
 
 		 311 aa  228  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  38.68 
 
 		 318 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  38.66 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  38.89 
 
 		 312 aa  227  3e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1996  methionyl-tRNA formyltransferase  41.64 
 
 		 309 aa  226  6e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  38.36 
 
 		 318 aa  225  7e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0513  methionyl-tRNA formyltransferase  38.02 
 
 		 319 aa  225  9e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  37.38 
 
 		 309 aa  224  1e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0547193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  38.99 
 
 		 318 aa  224  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1714  methionyl-tRNA formyltransferase  41.56 
 
 		 309 aa  224  1e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  40.2 
 
 		 329 aa  224  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0590691 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  38.56 
 
 		 321 aa  224  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  39.02 
 
 		 314 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1787  methionyl-tRNA formyltransferase  40.33 
 
 		 319 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  36.47 
 
 		 324 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  38.76 
 
 		 318 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  38.44 
 
 		 318 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  39.62 
 
 		 332 aa  219  3.9999999999999997e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.982881  normal  0.112275 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4228  methionyl-tRNA formyltransferase  40.92 
 
 		 312 aa  219  5e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  38.69 
 
 		 315 aa  219  5e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  39.47 
 
 		 311 aa  219  6e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  38.36 
 
 		 315 aa  218  7.999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  38.36 
 
 		 315 aa  218  7.999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  38.36 
 
 		 315 aa  218  7.999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  38.36 
 
 		 315 aa  218  7.999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  38.36 
 
 		 315 aa  218  7.999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  38.36 
 
 		 315 aa  218  7.999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1678  methionyl-tRNA formyltransferase  40.51 
 
 		 318 aa  218  8.999999999999998e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  37.5 
 
 		 311 aa  218  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  38.49 
 
 		 310 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  37.79 
 
 		 318 aa  217  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  38.03 
 
 		 315 aa  218  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  37.79 
 
 		 318 aa  217  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  38.49 
 
 		 310 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3177  methionyl-tRNA formyltransferase  39.14 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000345004  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  37.7 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  38.44 
 
 		 318 aa  218  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1472  methionyl-tRNA formyltransferase  38.83 
 
 		 314 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  38.44 
 
 		 315 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  38.44 
 
 		 315 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  38.44 
 
 		 315 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  38.03 
 
 		 315 aa  216  4e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  37.46 
 
 		 315 aa  216  5e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  38.49 
 
 		 310 aa  215  8e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  37.79 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  36.96 
 
 		 313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1005  methionyl-tRNA formyltransferase  40.89 
 
 		 317 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00554605  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0018  methionyl-tRNA formyltransferase  38.82 
 
 		 314 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  37.79 
 
 		 315 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  37.79 
 
 		 315 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  37.79 
 
 		 315 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  37.79 
 
 		 315 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  37.38 
 
 		 314 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  37.79 
 
 		 315 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0079  methionyl-tRNA formyltransferase  39.87 
 
 		 316 aa  212  4.9999999999999996e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  37.91 
 
 		 319 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  37.5 
 
 		 310 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2474  methionyl-tRNA formyltransferase  36.27 
 
 		 315 aa  212  5.999999999999999e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  37.83 
 
 		 314 aa  211  1e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  37.83 
 
 		 314 aa  211  1e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  36.42 
 
 		 308 aa  211  2e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  37.01 
 
 		 327 aa  210  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  35.29 
 
 		 310 aa  211  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2232  methionyl-tRNA formyltransferase  37.17 
 
 		 313 aa  210  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  37.25 
 
 		 319 aa  210  3e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  36.6 
 
 		 320 aa  209  5e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.601603  normal  0.144256 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  37.62 
 
 		 317 aa  209  6e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  36.72 
 
 		 315 aa  209  6e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  34.81 
 
 		 320 aa  208  8e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  37.38 
 
 		 310 aa  208  8e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3065  methionyl-tRNA formyltransferase  36.77 
 
 		 314 aa  208  8e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38579  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00392  methionyl-tRNA formyltransferase  36.72 
 
 		 315 aa  208  8e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3694  methionyl-tRNA formyltransferase  37.62 
 
 		 310 aa  208  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>