More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0487 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0487  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 314 aa  638    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1787  methionyl-tRNA formyltransferase  67.41 
 
 		 319 aa  421  1e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1472  methionyl-tRNA formyltransferase  61.17 
 
 		 314 aa  390  1e-107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1860  methionyl-tRNA formyltransferase  61.56 
 
 		 315 aa  389  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.346485  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1570  methionyl-tRNA formyltransferase  58.79 
 
 		 317 aa  379  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00793908 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0899  methionyl-tRNA formyltransferase  57.83 
 
 		 317 aa  374  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1678  methionyl-tRNA formyltransferase  58.01 
 
 		 318 aa  358  6e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2549  methionyl-tRNA formyltransferase  51.64 
 
 		 320 aa  298  6e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31631  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1053  methionyl-tRNA formyltransferase  44.74 
 
 		 312 aa  255  5e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4814  methionyl-tRNA formyltransferase  43.38 
 
 		 297 aa  250  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1570  methionyl-tRNA formyltransferase  42.43 
 
 		 302 aa  248  9e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.117163  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6485  methionyl-tRNA formyltransferase  42.58 
 
 		 315 aa  239  4e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.53373  normal  0.520037 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0138  methionyl-tRNA formyltransferase  40.63 
 
 		 315 aa  234  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.483644  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1221  methionyl-tRNA formyltransferase  42.12 
 
 		 304 aa  232  5e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.820089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1921  hypothetical protein  42.28 
 
 		 297 aa  227  2e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1490  methionyl-tRNA formyltransferase  39.24 
 
 		 316 aa  224  1e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2023  methionyl-tRNA formyltransferase  39.3 
 
 		 323 aa  218  1e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.030686 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  39.47 
 
 		 315 aa  218  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  41.04 
 
 		 359 aa  216  5e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0513  methionyl-tRNA formyltransferase  40.51 
 
 		 319 aa  215  7e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  42.59 
 
 		 311 aa  215  8e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09618  methionyl-tRNA formyltransferase  36.83 
 
 		 315 aa  210  2e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.315311  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  37.66 
 
 		 311 aa  210  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2232  methionyl-tRNA formyltransferase  40.45 
 
 		 313 aa  208  8e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  38.03 
 
 		 317 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  38.96 
 
 		 316 aa  205  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  37.79 
 
 		 313 aa  204  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  34.82 
 
 		 312 aa  203  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  35.56 
 
 		 310 aa  203  3e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  37.18 
 
 		 318 aa  202  5e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  37.01 
 
 		 318 aa  202  8e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  39.67 
 
 		 311 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  36.04 
 
 		 317 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0782  methionyl-tRNA formyltransferase  35.18 
 
 		 310 aa  195  1e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.606283  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2491  methionyl-tRNA formyltransferase  36.33 
 
 		 319 aa  191  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4228  methionyl-tRNA formyltransferase  40.26 
 
 		 312 aa  189  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  35.14 
 
 		 311 aa  189  5e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2313  methionyl-tRNA formyltransferase  35.14 
 
 		 312 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490925  hitchhiker  0.0006759 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2084  methionyl-tRNA formyltransferase  38.66 
 
 		 311 aa  186  5e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198796  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3177  methionyl-tRNA formyltransferase  33.97 
 
 		 315 aa  185  9e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000345004  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  34.71 
 
 		 320 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1275  methionyl-tRNA formyltransferase  35.53 
 
 		 311 aa  182  7e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1300  methionyl-tRNA formyltransferase  35.53 
 
 		 311 aa  182  7e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247026  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1345  methionyl-tRNA formyltransferase  34.85 
 
 		 306 aa  182  7e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1034  methionyl-tRNA formyltransferase  34.73 
 
 		 306 aa  182  8.000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.79271  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0975  methionyl-tRNA formyltransferase  34.73 
 
 		 306 aa  182  8.000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.569216  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4748  methionyl-tRNA formyltransferase  37.18 
 
 		 310 aa  180  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130868  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1231  methionyl-tRNA formyltransferase  33.99 
 
 		 314 aa  179  4.999999999999999e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000178496  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0393  methionyl-tRNA formyltransferase  36.76 
 
 		 311 aa  178  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1439  methionyl-tRNA formyltransferase  34.84 
 
 		 314 aa  177  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1467  methionyl-tRNA formyltransferase  38.1 
 
 		 306 aa  176  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0397972  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  36.72 
 
 		 297 aa  176  5e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09900  methionyl-tRNA formyltransferase  36.16 
 
 		 316 aa  176  6e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  34.94 
 
 		 308 aa  175  7e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3225  methionyl-tRNA formyltransferase  37.22 
 
 		 313 aa  176  7e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0188786 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1176  methionyl-tRNA formyltransferase  31.58 
 
 		 309 aa  175  8e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0139658  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3920  methionyl-tRNA formyltransferase  36.89 
 
 		 325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1040  methionyl-tRNA formyltransferase  35.14 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0058  methionyl-tRNA formyltransferase  37.83 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.820848  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0875  methionyl-tRNA formyltransferase  34.75 
 
 		 302 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1005  methionyl-tRNA formyltransferase  33.44 
 
 		 317 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00554605  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1714  methionyl-tRNA formyltransferase  33.97 
 
 		 309 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  34.2 
 
 		 318 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1996  methionyl-tRNA formyltransferase  33.97 
 
 		 309 aa  172  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2841  methionyl-tRNA formyltransferase  38.49 
 
 		 334 aa  172  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.671161  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  33.12 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0547193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  37.01 
 
 		 310 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2110  methionyl-tRNA formyltransferase  33.73 
 
 		 327 aa  169  5e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.6282 
 
 
-
 
NC_002620  TC0817  methionyl-tRNA formyltransferase  35.28 
 
 		 316 aa  169  6e-41  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7336  methionyl-tRNA formyltransferase  36.01 
 
 		 311 aa  169  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.685492  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3851  methionyl-tRNA formyltransferase  33.85 
 
 		 333 aa  169  8e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.183398  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  35.22 
 
 		 318 aa  168  9e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2535  methionyl-tRNA formyltransferase  34.75 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.614949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1953  methionyl-tRNA formyltransferase  35.41 
 
 		 319 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3304  methionyl-tRNA formyltransferase  35.62 
 
 		 307 aa  166  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0607232  normal  0.664052 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3948  methionyl-tRNA formyltransferase  33.73 
 
 		 334 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0075  methionyl-tRNA formyltransferase  35.86 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.716754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0055  methionyl-tRNA formyltransferase  34.74 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000555853 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2383  methionyl-tRNA formyltransferase  34.76 
 
 		 348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.596014  normal  0.0248257 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  32.81 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1321  methionyl-tRNA formyltransferase  35.94 
 
 		 314 aa  163  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1869  methionyl-tRNA formyltransferase  34.5 
 
 		 308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.573172 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1665  methionyl-tRNA formyltransferase  36.93 
 
 		 306 aa  163  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000612853 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1320  methionyl-tRNA formyltransferase  32.8 
 
 		 309 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16130  methionyl-tRNA formyltransferase  34.09 
 
 		 317 aa  162  6e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.452628  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  31.61 
 
 		 314 aa  162  7e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1548  methionyl-tRNA formyltransferase  31.31 
 
 		 332 aa  162  7e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1572  methionyl-tRNA formyltransferase  30.7 
 
 		 332 aa  162  7e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2582  methionyl-tRNA formyltransferase  34.08 
 
 		 328 aa  162  8.000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0097642  normal  0.0138205 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1928  methionyl-tRNA formyltransferase  35.76 
 
 		 307 aa  161  1e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  35.03 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3481  methionyl-tRNA formyltransferase  31.44 
 
 		 334 aa  162  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.902308 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  33.02 
 
 		 312 aa  161  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  34.88 
 
 		 314 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  33.44 
 
 		 302 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1864  methionyl-tRNA formyltransferase  35.76 
 
 		 307 aa  161  2e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  32.68 
 
 		 318 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  32.35 
 
 		 318 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1334  methionyl-tRNA formyltransferase  31.29 
 
 		 313 aa  160  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0783821  normal  0.599523 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0541  methionyl-tRNA formyltransferase  34.64 
 
 		 320 aa  160  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.743734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>