More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1529 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 312 aa  641    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  64.1 
 
 		 311 aa  424  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  52.73 
 
 		 311 aa  347  2e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  52.56 
 
 		 317 aa  344  1e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  53.21 
 
 		 318 aa  344  1e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  51.92 
 
 		 313 aa  342  4e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  51.13 
 
 		 315 aa  342  5.999999999999999e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  52.88 
 
 		 318 aa  342  7e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0513  methionyl-tRNA formyltransferase  50.32 
 
 		 319 aa  330  3e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  51.78 
 
 		 310 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  50.49 
 
 		 316 aa  326  3e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1714  methionyl-tRNA formyltransferase  52.41 
 
 		 309 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  49.52 
 
 		 317 aa  320  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2313  methionyl-tRNA formyltransferase  47.27 
 
 		 312 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490925  hitchhiker  0.0006759 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2491  methionyl-tRNA formyltransferase  46.98 
 
 		 319 aa  319  3e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1996  methionyl-tRNA formyltransferase  51.77 
 
 		 309 aa  318  1e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  47.66 
 
 		 320 aa  316  4e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  45.98 
 
 		 359 aa  303  2.0000000000000002e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  44.59 
 
 		 311 aa  292  6e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  43.09 
 
 		 311 aa  281  7.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2232  methionyl-tRNA formyltransferase  41.8 
 
 		 313 aa  281  1e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1005  methionyl-tRNA formyltransferase  44.3 
 
 		 317 aa  280  2e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00554605  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2582  methionyl-tRNA formyltransferase  42.95 
 
 		 328 aa  278  7e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0097642  normal  0.0138205 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09900  methionyl-tRNA formyltransferase  43.71 
 
 		 316 aa  278  1e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3177  methionyl-tRNA formyltransferase  45.4 
 
 		 315 aa  277  2e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000345004  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  42.9 
 
 		 311 aa  271  7e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6485  methionyl-tRNA formyltransferase  43.45 
 
 		 315 aa  270  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.53373  normal  0.520037 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4228  methionyl-tRNA formyltransferase  45.54 
 
 		 312 aa  268  8e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  44.41 
 
 		 332 aa  266  4e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.982881  normal  0.112275 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  41.8 
 
 		 318 aa  265  7e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  45.22 
 
 		 318 aa  264  1e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  43.91 
 
 		 318 aa  263  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  44.23 
 
 		 318 aa  262  6e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1176  methionyl-tRNA formyltransferase  42.12 
 
 		 309 aa  261  8e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0139658  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  44.19 
 
 		 318 aa  261  8.999999999999999e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  43.59 
 
 		 318 aa  261  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  43.59 
 
 		 318 aa  261  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0782  methionyl-tRNA formyltransferase  44.19 
 
 		 310 aa  260  2e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.606283  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3689  methionyl-tRNA formyltransferase  43.77 
 
 		 314 aa  259  4e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  42.81 
 
 		 318 aa  258  7e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  42.81 
 
 		 318 aa  257  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  44.41 
 
 		 314 aa  258  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  45 
 
 		 330 aa  256  2e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  42.49 
 
 		 318 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188499 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  42.49 
 
 		 318 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1275  methionyl-tRNA formyltransferase  42.52 
 
 		 311 aa  256  4e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1300  methionyl-tRNA formyltransferase  42.52 
 
 		 311 aa  256  4e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247026  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2549  methionyl-tRNA formyltransferase  40.51 
 
 		 320 aa  255  5e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31631  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4814  methionyl-tRNA formyltransferase  42.86 
 
 		 297 aa  255  8e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  41.35 
 
 		 324 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1953  methionyl-tRNA formyltransferase  44.41 
 
 		 319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3717  methionyl-tRNA formyltransferase  43.45 
 
 		 314 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00223065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3625  methionyl-tRNA formyltransferase  43.45 
 
 		 314 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000492096  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4004  methionyl-tRNA formyltransferase  43.45 
 
 		 314 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3880  methionyl-tRNA formyltransferase  43.45 
 
 		 314 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43125e-17 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  41.67 
 
 		 312 aa  253  3e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3914  methionyl-tRNA formyltransferase  43.13 
 
 		 314 aa  253  3e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00718662  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  41.85 
 
 		 318 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09618  methionyl-tRNA formyltransferase  40.58 
 
 		 315 aa  252  4.0000000000000004e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.315311  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  42.12 
 
 		 308 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3965  methionyl-tRNA formyltransferase  43.13 
 
 		 314 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  39.93 
 
 		 314 aa  252  6e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1278  methionyl-tRNA formyltransferase  43.13 
 
 		 314 aa  252  6e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.289128 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  40.26 
 
 		 314 aa  252  7e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  42.14 
 
 		 315 aa  252  7e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  39.23 
 
 		 312 aa  251  7e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1040  methionyl-tRNA formyltransferase  43.73 
 
 		 309 aa  251  9.000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  42.24 
 
 		 315 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  42.24 
 
 		 315 aa  251  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  40.26 
 
 		 313 aa  251  1e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1221  methionyl-tRNA formyltransferase  40.39 
 
 		 304 aa  251  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.820089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  42.24 
 
 		 315 aa  251  1e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1439  methionyl-tRNA formyltransferase  43.91 
 
 		 314 aa  251  1e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  41.86 
 
 		 319 aa  251  1e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  42.24 
 
 		 315 aa  251  1e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1231  methionyl-tRNA formyltransferase  39.74 
 
 		 314 aa  251  1e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000178496  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  42.24 
 
 		 315 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  41.99 
 
 		 311 aa  250  2e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3607  methionyl-tRNA formyltransferase  43.13 
 
 		 314 aa  251  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  41.91 
 
 		 315 aa  250  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0148  methionyl-tRNA formyltransferase  42.35 
 
 		 305 aa  251  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.576123 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  41.91 
 
 		 315 aa  250  3e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  41.58 
 
 		 315 aa  249  4e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1570  methionyl-tRNA formyltransferase  42.43 
 
 		 302 aa  249  4e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.117163  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  40.65 
 
 		 314 aa  249  6e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  40.65 
 
 		 314 aa  249  6e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  41.91 
 
 		 315 aa  248  9e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  40.13 
 
 		 314 aa  247  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2474  methionyl-tRNA formyltransferase  40.26 
 
 		 315 aa  247  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  40.26 
 
 		 315 aa  247  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0050  methionyl-tRNA formyltransferase  41.5 
 
 		 319 aa  246  4e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.977686  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  41.47 
 
 		 321 aa  245  6e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0036  methionyl-tRNA formyltransferase  39.5 
 
 		 327 aa  245  8e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  40.38 
 
 		 315 aa  244  9e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  42.63 
 
 		 308 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823971 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  40.26 
 
 		 314 aa  244  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  40.59 
 
 		 315 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2139  methionyl-tRNA formyltransferase  38.32 
 
 		 361 aa  243  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00931795 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00392  methionyl-tRNA formyltransferase  40.38 
 
 		 315 aa  243  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  40.59 
 
 		 315 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>