More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1053 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1053  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 312 aa  637    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4814  methionyl-tRNA formyltransferase  63.88 
 
 		 297 aa  392  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6485  methionyl-tRNA formyltransferase  57.28 
 
 		 315 aa  355  5e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.53373  normal  0.520037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1221  methionyl-tRNA formyltransferase  57.65 
 
 		 304 aa  350  1e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.820089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1570  methionyl-tRNA formyltransferase  55.92 
 
 		 302 aa  343  2e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.117163  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1921  hypothetical protein  53.18 
 
 		 297 aa  318  6e-86  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1490  methionyl-tRNA formyltransferase  51.82 
 
 		 316 aa  301  8.000000000000001e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0138  methionyl-tRNA formyltransferase  48.86 
 
 		 315 aa  299  5e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.483644  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2549  methionyl-tRNA formyltransferase  50.49 
 
 		 320 aa  288  1e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31631  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2023  methionyl-tRNA formyltransferase  47.32 
 
 		 323 aa  280  3e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.030686 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09618  methionyl-tRNA formyltransferase  44.87 
 
 		 315 aa  270  2e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.315311  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  46.41 
 
 		 311 aa  270  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1570  methionyl-tRNA formyltransferase  45.71 
 
 		 317 aa  266  4e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00793908 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0899  methionyl-tRNA formyltransferase  46.03 
 
 		 317 aa  261  8e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  44.44 
 
 		 317 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  44.63 
 
 		 317 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1860  methionyl-tRNA formyltransferase  45.6 
 
 		 315 aa  257  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.346485  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  47.02 
 
 		 311 aa  256  4e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1787  methionyl-tRNA formyltransferase  45.6 
 
 		 319 aa  255  5e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0487  methionyl-tRNA formyltransferase  44.74 
 
 		 314 aa  255  5e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1678  methionyl-tRNA formyltransferase  45.25 
 
 		 318 aa  255  6e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  44.77 
 
 		 359 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  43.61 
 
 		 313 aa  249  3e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0513  methionyl-tRNA formyltransferase  44.19 
 
 		 319 aa  248  6e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  43.32 
 
 		 318 aa  246  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  43 
 
 		 318 aa  244  9e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  43.69 
 
 		 315 aa  244  9.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  39.87 
 
 		 312 aa  243  3e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1472  methionyl-tRNA formyltransferase  44.3 
 
 		 314 aa  242  7e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  44.12 
 
 		 316 aa  241  9e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  39.87 
 
 		 310 aa  241  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2313  methionyl-tRNA formyltransferase  39.87 
 
 		 312 aa  236  4e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490925  hitchhiker  0.0006759 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  44.55 
 
 		 311 aa  235  6e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  42.12 
 
 		 315 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  42.12 
 
 		 315 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  42.12 
 
 		 315 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  42.12 
 
 		 315 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  42.12 
 
 		 315 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1300  methionyl-tRNA formyltransferase  43.42 
 
 		 311 aa  233  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247026  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  42.12 
 
 		 315 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1275  methionyl-tRNA formyltransferase  43.42 
 
 		 311 aa  233  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  41.8 
 
 		 315 aa  233  3e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3177  methionyl-tRNA formyltransferase  39.03 
 
 		 315 aa  231  9e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000345004  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  40.66 
 
 		 311 aa  229  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  41.48 
 
 		 315 aa  230  3e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  41.8 
 
 		 315 aa  230  3e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  40.19 
 
 		 315 aa  228  1e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  38.85 
 
 		 320 aa  227  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2232  methionyl-tRNA formyltransferase  40.65 
 
 		 313 aa  227  2e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4228  methionyl-tRNA formyltransferase  42.3 
 
 		 312 aa  226  4e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  40.91 
 
 		 314 aa  224  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0782  methionyl-tRNA formyltransferase  41.12 
 
 		 310 aa  222  7e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.606283  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09900  methionyl-tRNA formyltransferase  40.13 
 
 		 316 aa  222  8e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1714  methionyl-tRNA formyltransferase  40.72 
 
 		 309 aa  221  9e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1996  methionyl-tRNA formyltransferase  40.72 
 
 		 309 aa  220  3e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  40.13 
 
 		 315 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  40.13 
 
 		 315 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  40.13 
 
 		 315 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  40.13 
 
 		 315 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  39.87 
 
 		 315 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2491  methionyl-tRNA formyltransferase  35.48 
 
 		 319 aa  219  6e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  40.52 
 
 		 318 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  39.5 
 
 		 318 aa  217  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  39.87 
 
 		 312 aa  217  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0541  methionyl-tRNA formyltransferase  42.35 
 
 		 320 aa  216  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.743734  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0055  methionyl-tRNA formyltransferase  40.39 
 
 		 311 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000555853 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1368  methionyl-tRNA formyltransferase  42.35 
 
 		 309 aa  216  5e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0580352 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  38.87 
 
 		 318 aa  216  5e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  40.58 
 
 		 315 aa  216  5e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  40.26 
 
 		 315 aa  216  5e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  38.82 
 
 		 313 aa  215  8e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  39.48 
 
 		 310 aa  215  9e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 313 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  40.07 
 
 		 318 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188499 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1005  methionyl-tRNA formyltransferase  38.56 
 
 		 317 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00554605  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  38.94 
 
 		 318 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  39.68 
 
 		 318 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  37.17 
 
 		 311 aa  213  3.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  38.31 
 
 		 309 aa  212  5.999999999999999e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0547193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  38.14 
 
 		 314 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  38.41 
 
 		 321 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3000  methionyl-tRNA formyltransferase  41.83 
 
 		 308 aa  211  9e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0437614  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  41.64 
 
 		 297 aa  211  9e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  38.63 
 
 		 318 aa  211  1e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  38.24 
 
 		 307 aa  211  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  38.19 
 
 		 319 aa  211  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0975  methionyl-tRNA formyltransferase  38.26 
 
 		 306 aa  211  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.569216  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1928  methionyl-tRNA formyltransferase  42.3 
 
 		 307 aa  211  1e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  39.12 
 
 		 332 aa  211  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.982881  normal  0.112275 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2841  methionyl-tRNA formyltransferase  39.61 
 
 		 334 aa  211  1e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.671161  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0817  methionyl-tRNA formyltransferase  40.2 
 
 		 316 aa  210  2e-53  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3065  methionyl-tRNA formyltransferase  38.78 
 
 		 314 aa  210  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38579  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0058  methionyl-tRNA formyltransferase  41.29 
 
 		 311 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.820848  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1278  methionyl-tRNA formyltransferase  40.75 
 
 		 324 aa  210  2e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0156282  normal  0.148843 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1034  methionyl-tRNA formyltransferase  38.26 
 
 		 306 aa  210  3e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.79271  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  39.74 
 
 		 318 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  39.74 
 
 		 318 aa  209  4e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  40.52 
 
 		 308 aa  209  4e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823971 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  37.58 
 
 		 310 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1345  methionyl-tRNA formyltransferase  37.94 
 
 		 306 aa  209  5e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>