More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1278 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1278  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 324 aa  620  1e-177  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0156282  normal  0.148843 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3000  methionyl-tRNA formyltransferase  64.98 
 
 		 308 aa  392  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0437614  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1368  methionyl-tRNA formyltransferase  62.15 
 
 		 309 aa  375  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0580352 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1075  methionyl-tRNA formyltransferase  61.61 
 
 		 310 aa  361  8e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0107606  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15680  methionyl-tRNA formyltransferase  59.5 
 
 		 307 aa  357  1.9999999999999998e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.153254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3119  methionyl-tRNA formyltransferase  62.62 
 
 		 309 aa  355  5e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2825  methionyl-tRNA formyltransferase  59.57 
 
 		 309 aa  351  1e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2442  methionyl-tRNA formyltransferase  58.82 
 
 		 316 aa  347  1e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0870633  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0854  methionyl-tRNA formyltransferase  55.7 
 
 		 311 aa  342  4e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0108509  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5224  methionyl-tRNA formyltransferase  58.64 
 
 		 310 aa  342  5.999999999999999e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373009  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1855  methionyl-tRNA formyltransferase  60.44 
 
 		 319 aa  339  5e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1017  normal  0.411821 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3190  methionyl-tRNA formyltransferase  56.71 
 
 		 337 aa  338  9.999999999999999e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000305844  normal  0.338989 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1869  methionyl-tRNA formyltransferase  57.01 
 
 		 308 aa  336  2.9999999999999997e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.573172 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1862  methionyl-tRNA formyltransferase  57.19 
 
 		 308 aa  332  7.000000000000001e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1719  methionyl-tRNA formyltransferase  58.99 
 
 		 311 aa  331  1e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.296625  hitchhiker  0.00236307 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2048  methionyl-tRNA formyltransferase  55.42 
 
 		 311 aa  325  5e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0469723 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2984  methionyl-tRNA formyltransferase  54.49 
 
 		 306 aa  323  2e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3099  methionyl-tRNA formyltransferase  54.85 
 
 		 315 aa  323  3e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2575  methionyl-tRNA formyltransferase  54.78 
 
 		 308 aa  320  3e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0532653 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11435  methionyl-tRNA formyltransferase  58.51 
 
 		 312 aa  317  1e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.682601  normal  0.406209 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1722  methionyl-tRNA formyltransferase  57.45 
 
 		 318 aa  316  3e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.000240612  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2350  methionyl-tRNA formyltransferase  55.52 
 
 		 313 aa  315  5e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167189  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2687  methionyl-tRNA formyltransferase  57.55 
 
 		 310 aa  315  5e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4156  methionyl-tRNA formyltransferase  55.62 
 
 		 307 aa  314  9.999999999999999e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.413206  hitchhiker  0.00887894 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18090  methionyl-tRNA formyltransferase  55.66 
 
 		 315 aa  314  9.999999999999999e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.783991  normal  0.456867 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3730  methionyl-tRNA formyltransferase  58.68 
 
 		 310 aa  311  1e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.132882  normal  0.0191381 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2383  methionyl-tRNA formyltransferase  58.49 
 
 		 308 aa  308  8e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0196795  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2424  methionyl-tRNA formyltransferase  58.49 
 
 		 308 aa  308  8e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0902213  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2567  methionyl-tRNA formyltransferase  56.88 
 
 		 311 aa  308  8e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296174  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2430  methionyl-tRNA formyltransferase  58.49 
 
 		 308 aa  308  8e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119113  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12770  methionyl-tRNA formyltransferase  52.6 
 
 		 336 aa  305  8.000000000000001e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.348945  normal  0.0208178 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1665  methionyl-tRNA formyltransferase  49.24 
 
 		 306 aa  285  9e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000612853 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16130  methionyl-tRNA formyltransferase  51.23 
 
 		 317 aa  283  2.0000000000000002e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.452628  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1671  methionyl-tRNA formyltransferase  50.31 
 
 		 306 aa  280  3e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.563662  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1313  methionyl-tRNA formyltransferase  48.15 
 
 		 311 aa  263  4e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.141722 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10800  methionyl-tRNA formyltransferase  51.13 
 
 		 366 aa  257  2e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0126989  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1966  methionyl-tRNA formyltransferase  45.62 
 
 		 328 aa  250  2e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.417449  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  46.44 
 
 		 302 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2535  methionyl-tRNA formyltransferase  43.79 
 
 		 302 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.614949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  41.59 
 
 		 301 aa  233  4.0000000000000004e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0875  methionyl-tRNA formyltransferase  43.17 
 
 		 302 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0181  methionyl-tRNA formyltransferase  48.13 
 
 		 299 aa  224  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.142178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  46.84 
 
 		 297 aa  223  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0899  methionyl-tRNA formyltransferase  45.34 
 
 		 327 aa  222  4.9999999999999996e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  39.13 
 
 		 312 aa  223  4.9999999999999996e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  37.69 
 
 		 318 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  38.24 
 
 		 312 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  37.15 
 
 		 311 aa  219  6e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  43.77 
 
 		 310 aa  217  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  37.69 
 
 		 318 aa  217  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  37.46 
 
 		 317 aa  216  5e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  42.14 
 
 		 308 aa  215  9e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2577  methionyl-tRNA formyltransferase  39.94 
 
 		 308 aa  215  9.999999999999999e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  hitchhiker  0.000000800769 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  40.19 
 
 		 310 aa  214  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  38.46 
 
 		 315 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  46.69 
 
 		 318 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6485  methionyl-tRNA formyltransferase  38.44 
 
 		 315 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.53373  normal  0.520037 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  38.46 
 
 		 315 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  38.46 
 
 		 315 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  38.46 
 
 		 315 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  38.46 
 
 		 315 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  45.53 
 
 		 314 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  38.46 
 
 		 315 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  38.15 
 
 		 315 aa  212  7e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0943  methionyl-tRNA formyltransferase  38.32 
 
 		 326 aa  211  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  37.54 
 
 		 314 aa  211  1e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04056  methionyl-tRNA formyltransferase  48.98 
 
 		 307 aa  211  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4748  methionyl-tRNA formyltransferase  42.86 
 
 		 310 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130868  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  38.15 
 
 		 315 aa  211  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4814  methionyl-tRNA formyltransferase  42.97 
 
 		 297 aa  211  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  38.51 
 
 		 315 aa  210  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  38.51 
 
 		 315 aa  210  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1053  methionyl-tRNA formyltransferase  40.75 
 
 		 312 aa  210  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0975  methionyl-tRNA formyltransferase  40.06 
 
 		 306 aa  210  3e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.569216  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  35.51 
 
 		 313 aa  210  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1345  methionyl-tRNA formyltransferase  40.75 
 
 		 306 aa  210  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1034  methionyl-tRNA formyltransferase  40.06 
 
 		 306 aa  209  6e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.79271  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  38.46 
 
 		 315 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  38.15 
 
 		 315 aa  209  7e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  44.32 
 
 		 319 aa  208  9e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  37.23 
 
 		 314 aa  208  9e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  37.54 
 
 		 315 aa  208  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  42.64 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  37.65 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2549  methionyl-tRNA formyltransferase  40.74 
 
 		 320 aa  207  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31631  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4042  methionyl-tRNA formyltransferase  41.23 
 
 		 308 aa  207  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  38.15 
 
 		 315 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  38.15 
 
 		 315 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  38.15 
 
 		 315 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  38.15 
 
 		 315 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  36.59 
 
 		 314 aa  206  4e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  37.22 
 
 		 313 aa  206  4e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  37.66 
 
 		 315 aa  206  5e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  37.66 
 
 		 315 aa  206  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  37.66 
 
 		 315 aa  206  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1928  methionyl-tRNA formyltransferase  48.15 
 
 		 307 aa  206  6e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  37.42 
 
 		 320 aa  205  7e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1921  hypothetical protein  39.55 
 
 		 297 aa  205  7e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3225  methionyl-tRNA formyltransferase  40.12 
 
 		 313 aa  205  8e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0188786 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  33.44 
 
 		 311 aa  205  9e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>