More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2567 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2567  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 311 aa  601  1.0000000000000001e-171  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296174  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15680  methionyl-tRNA formyltransferase  65.79 
 
 		 307 aa  363  2e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.153254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5224  methionyl-tRNA formyltransferase  63.73 
 
 		 310 aa  360  2e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373009  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2350  methionyl-tRNA formyltransferase  64.42 
 
 		 313 aa  359  3e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167189  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1855  methionyl-tRNA formyltransferase  63.99 
 
 		 319 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1017  normal  0.411821 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1869  methionyl-tRNA formyltransferase  60.26 
 
 		 308 aa  352  5e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.573172 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1075  methionyl-tRNA formyltransferase  61.94 
 
 		 310 aa  348  9e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0107606  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3000  methionyl-tRNA formyltransferase  60.74 
 
 		 308 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0437614  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2575  methionyl-tRNA formyltransferase  58.63 
 
 		 308 aa  341  7e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0532653 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1862  methionyl-tRNA formyltransferase  58.96 
 
 		 308 aa  340  1e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2442  methionyl-tRNA formyltransferase  59.35 
 
 		 316 aa  340  1e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0870633  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1368  methionyl-tRNA formyltransferase  60.6 
 
 		 309 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0580352 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0854  methionyl-tRNA formyltransferase  59.93 
 
 		 311 aa  335  5e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0108509  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3099  methionyl-tRNA formyltransferase  57.79 
 
 		 315 aa  332  5e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2424  methionyl-tRNA formyltransferase  62.75 
 
 		 308 aa  332  6e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0902213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2383  methionyl-tRNA formyltransferase  62.75 
 
 		 308 aa  332  6e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0196795  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2430  methionyl-tRNA formyltransferase  62.75 
 
 		 308 aa  332  6e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119113  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2825  methionyl-tRNA formyltransferase  59.47 
 
 		 309 aa  332  7.000000000000001e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4156  methionyl-tRNA formyltransferase  58.44 
 
 		 307 aa  330  2e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.413206  hitchhiker  0.00887894 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3119  methionyl-tRNA formyltransferase  60.61 
 
 		 309 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3730  methionyl-tRNA formyltransferase  61.84 
 
 		 310 aa  325  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.132882  normal  0.0191381 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2687  methionyl-tRNA formyltransferase  60.13 
 
 		 310 aa  323  3e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1278  methionyl-tRNA formyltransferase  56.88 
 
 		 324 aa  321  8e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0156282  normal  0.148843 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1719  methionyl-tRNA formyltransferase  59.08 
 
 		 311 aa  318  7.999999999999999e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.296625  hitchhiker  0.00236307 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3190  methionyl-tRNA formyltransferase  55.69 
 
 		 337 aa  316  3e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000305844  normal  0.338989 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18090  methionyl-tRNA formyltransferase  60 
 
 		 315 aa  316  4e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.783991  normal  0.456867 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11435  methionyl-tRNA formyltransferase  57.84 
 
 		 312 aa  308  9e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.682601  normal  0.406209 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1722  methionyl-tRNA formyltransferase  56.65 
 
 		 318 aa  306  3e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.000240612  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16130  methionyl-tRNA formyltransferase  52.73 
 
 		 317 aa  303  2.0000000000000002e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.452628  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2048  methionyl-tRNA formyltransferase  54.34 
 
 		 311 aa  294  1e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0469723 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2984  methionyl-tRNA formyltransferase  54.28 
 
 		 306 aa  286  2.9999999999999996e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12770  methionyl-tRNA formyltransferase  51.8 
 
 		 336 aa  286  2.9999999999999996e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.348945  normal  0.0208178 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1671  methionyl-tRNA formyltransferase  55.05 
 
 		 306 aa  281  1e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.563662  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1665  methionyl-tRNA formyltransferase  51.47 
 
 		 306 aa  270  2e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000612853 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1313  methionyl-tRNA formyltransferase  54.22 
 
 		 311 aa  267  2e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.141722 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1966  methionyl-tRNA formyltransferase  42.68 
 
 		 328 aa  226  3e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.417449  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10800  methionyl-tRNA formyltransferase  48.05 
 
 		 366 aa  224  2e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0126989  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0899  methionyl-tRNA formyltransferase  43.71 
 
 		 327 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  39.16 
 
 		 312 aa  215  8e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  42.71 
 
 		 308 aa  211  1e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  40.19 
 
 		 313 aa  209  7e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  41.36 
 
 		 315 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  41.36 
 
 		 315 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  41.36 
 
 		 315 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  41.36 
 
 		 315 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  41.36 
 
 		 315 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  41.48 
 
 		 314 aa  207  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  39.53 
 
 		 313 aa  207  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0446  methionyl-tRNA formyltransferase  40.84 
 
 		 311 aa  206  3e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  39.53 
 
 		 314 aa  206  5e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  41.16 
 
 		 310 aa  204  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  41.69 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  37.87 
 
 		 311 aa  203  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  40.68 
 
 		 315 aa  202  4e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  40.34 
 
 		 315 aa  202  7e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  40.34 
 
 		 315 aa  202  8e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 315 aa  201  9e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4748  methionyl-tRNA formyltransferase  41.88 
 
 		 310 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130868  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  39.32 
 
 		 315 aa  201  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  39.2 
 
 		 315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  39.2 
 
 		 315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  39.2 
 
 		 315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  39.32 
 
 		 324 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  40 
 
 		 315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  39.94 
 
 		 314 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  37.42 
 
 		 312 aa  199  6e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  34.53 
 
 		 311 aa  199  6e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  38.64 
 
 		 321 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  39.53 
 
 		 315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  36.74 
 
 		 318 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  38.64 
 
 		 318 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  39.53 
 
 		 315 aa  197  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  39.1 
 
 		 319 aa  196  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  40.38 
 
 		 310 aa  197  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0975  methionyl-tRNA formyltransferase  39.87 
 
 		 306 aa  195  7e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.569216  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1345  methionyl-tRNA formyltransferase  40.32 
 
 		 306 aa  195  7e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1034  methionyl-tRNA formyltransferase  40.2 
 
 		 306 aa  195  9e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.79271  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  38.31 
 
 		 318 aa  195  9e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188499 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3147  methionyl-tRNA formyltransferase  42.14 
 
 		 313 aa  194  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  0.377579 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  38.31 
 
 		 318 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  38.31 
 
 		 318 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1231  methionyl-tRNA formyltransferase  35.24 
 
 		 314 aa  195  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000178496  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  42.14 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  38.83 
 
 		 317 aa  194  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  41.23 
 
 		 310 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  36.25 
 
 		 311 aa  193  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  37.62 
 
 		 318 aa  194  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  37.29 
 
 		 318 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  35.26 
 
 		 317 aa  193  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  36.77 
 
 		 315 aa  193  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  37.63 
 
 		 318 aa  193  4e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  36.57 
 
 		 315 aa  193  4e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  37.63 
 
 		 318 aa  193  4e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0674  methionyl-tRNA formyltransferase  40.63 
 
 		 312 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0080  methionyl-tRNA formyltransferase  40.26 
 
 		 310 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.450016  normal  0.0632026 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  39.93 
 
 		 318 aa  192  5e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>