More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3119 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3119  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 309 aa  587  1e-166  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3000  methionyl-tRNA formyltransferase  63.39 
 
 		 308 aa  373  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0437614  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1075  methionyl-tRNA formyltransferase  64.8 
 
 		 310 aa  370  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0107606  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2575  methionyl-tRNA formyltransferase  63.73 
 
 		 308 aa  362  3e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0532653 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2442  methionyl-tRNA formyltransferase  63.07 
 
 		 316 aa  362  3e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0870633  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1855  methionyl-tRNA formyltransferase  65.56 
 
 		 319 aa  362  6e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1017  normal  0.411821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2825  methionyl-tRNA formyltransferase  62.62 
 
 		 309 aa  360  2e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1862  methionyl-tRNA formyltransferase  63.25 
 
 		 308 aa  355  3.9999999999999996e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1278  methionyl-tRNA formyltransferase  62.62 
 
 		 324 aa  355  5e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0156282  normal  0.148843 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1869  methionyl-tRNA formyltransferase  62.25 
 
 		 308 aa  352  4e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.573172 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0854  methionyl-tRNA formyltransferase  59.48 
 
 		 311 aa  351  7e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0108509  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2984  methionyl-tRNA formyltransferase  61.31 
 
 		 306 aa  351  8e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1368  methionyl-tRNA formyltransferase  61.76 
 
 		 309 aa  350  2e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0580352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3099  methionyl-tRNA formyltransferase  60.13 
 
 		 315 aa  348  9e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5224  methionyl-tRNA formyltransferase  61.76 
 
 		 310 aa  343  2e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373009  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15680  methionyl-tRNA formyltransferase  61.76 
 
 		 307 aa  340  2e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.153254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18090  methionyl-tRNA formyltransferase  61.24 
 
 		 315 aa  332  4e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.783991  normal  0.456867 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1719  methionyl-tRNA formyltransferase  57.98 
 
 		 311 aa  317  2e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.296625  hitchhiker  0.00236307 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4156  methionyl-tRNA formyltransferase  59.14 
 
 		 307 aa  315  5e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.413206  hitchhiker  0.00887894 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1722  methionyl-tRNA formyltransferase  58.94 
 
 		 318 aa  313  1.9999999999999998e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.000240612  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2350  methionyl-tRNA formyltransferase  59.22 
 
 		 313 aa  311  9e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167189  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3190  methionyl-tRNA formyltransferase  55.45 
 
 		 337 aa  310  1e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000305844  normal  0.338989 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3730  methionyl-tRNA formyltransferase  60.87 
 
 		 310 aa  309  4e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.132882  normal  0.0191381 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2687  methionyl-tRNA formyltransferase  59.87 
 
 		 310 aa  309  4e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225803  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2567  methionyl-tRNA formyltransferase  60.61 
 
 		 311 aa  307  1.0000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296174  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2048  methionyl-tRNA formyltransferase  55.92 
 
 		 311 aa  303  2.0000000000000002e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0469723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2424  methionyl-tRNA formyltransferase  59.4 
 
 		 308 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0902213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1313  methionyl-tRNA formyltransferase  55.84 
 
 		 311 aa  293  2e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.141722 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2383  methionyl-tRNA formyltransferase  59.4 
 
 		 308 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0196795  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2430  methionyl-tRNA formyltransferase  59.4 
 
 		 308 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119113  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11435  methionyl-tRNA formyltransferase  57.81 
 
 		 312 aa  291  1e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.682601  normal  0.406209 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16130  methionyl-tRNA formyltransferase  51.97 
 
 		 317 aa  289  3e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.452628  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12770  methionyl-tRNA formyltransferase  52.63 
 
 		 336 aa  285  5.999999999999999e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.348945  normal  0.0208178 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1665  methionyl-tRNA formyltransferase  51.48 
 
 		 306 aa  280  2e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000612853 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1671  methionyl-tRNA formyltransferase  53.11 
 
 		 306 aa  276  4e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.563662  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  41.64 
 
 		 312 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1966  methionyl-tRNA formyltransferase  43.44 
 
 		 328 aa  233  3e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.417449  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0899  methionyl-tRNA formyltransferase  45.86 
 
 		 327 aa  231  1e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  43.61 
 
 		 301 aa  231  1e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  43.97 
 
 		 318 aa  230  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10800  methionyl-tRNA formyltransferase  46.89 
 
 		 366 aa  222  8e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0126989  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  40.46 
 
 		 315 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1345  methionyl-tRNA formyltransferase  43.71 
 
 		 306 aa  219  6e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  44.52 
 
 		 308 aa  219  7e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  39.74 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  39.74 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  39.74 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  39.74 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  39.74 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0975  methionyl-tRNA formyltransferase  43.09 
 
 		 306 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.569216  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  39.67 
 
 		 311 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  43.73 
 
 		 302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  39.41 
 
 		 315 aa  216  4e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  40.45 
 
 		 312 aa  216  4e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1034  methionyl-tRNA formyltransferase  43.23 
 
 		 306 aa  216  5e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.79271  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  39.09 
 
 		 315 aa  215  7e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 307 aa  215  9e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  38.64 
 
 		 313 aa  215  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  39.41 
 
 		 315 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  39.81 
 
 		 314 aa  214  1.9999999999999998e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3147  methionyl-tRNA formyltransferase  45.51 
 
 		 313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  0.377579 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  39.81 
 
 		 314 aa  214  1.9999999999999998e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  41.58 
 
 		 310 aa  213  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  39.09 
 
 		 315 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0875  methionyl-tRNA formyltransferase  42.71 
 
 		 302 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2535  methionyl-tRNA formyltransferase  42.71 
 
 		 302 aa  212  7e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.614949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0446  methionyl-tRNA formyltransferase  41.88 
 
 		 311 aa  211  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  43.39 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  38.82 
 
 		 311 aa  210  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  39.09 
 
 		 315 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  43.75 
 
 		 314 aa  210  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  40.85 
 
 		 308 aa  209  3e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823971 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2577  methionyl-tRNA formyltransferase  42.53 
 
 		 308 aa  210  3e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  hitchhiker  0.000000800769 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  39.09 
 
 		 315 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  39.09 
 
 		 315 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  39.09 
 
 		 315 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  39.81 
 
 		 320 aa  209  4e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  39.09 
 
 		 315 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0351  methionyl-tRNA formyltransferase  44.16 
 
 		 322 aa  208  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.227981 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  44.44 
 
 		 310 aa  206  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1320  methionyl-tRNA formyltransferase  38.74 
 
 		 309 aa  206  3e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  38.11 
 
 		 314 aa  206  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  38.26 
 
 		 315 aa  206  4e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0181  methionyl-tRNA formyltransferase  43.05 
 
 		 299 aa  206  6e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.142178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4228  methionyl-tRNA formyltransferase  39.54 
 
 		 312 aa  206  6e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  36.24 
 
 		 314 aa  205  8e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4042  methionyl-tRNA formyltransferase  42.18 
 
 		 308 aa  205  8e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3304  methionyl-tRNA formyltransferase  44.16 
 
 		 307 aa  205  8e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0607232  normal  0.664052 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  34.42 
 
 		 311 aa  205  8e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  38.59 
 
 		 313 aa  204  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4053  methionyl-tRNA formyltransferase  41.25 
 
 		 323 aa  204  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0393  methionyl-tRNA formyltransferase  40.78 
 
 		 311 aa  204  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  37.66 
 
 		 315 aa  203  3e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4690  methionyl-tRNA formyltransferase  42.11 
 
 		 329 aa  203  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09900  methionyl-tRNA formyltransferase  37.5 
 
 		 316 aa  203  4e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  43.33 
 
 		 307 aa  203  4e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3398  methionyl-tRNA formyltransferase  40.94 
 
 		 323 aa  202  4e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.726388  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1599  methionyl-tRNA formyltransferase  41.56 
 
 		 309 aa  203  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0493449 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  36.72 
 
 		 310 aa  202  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  36.64 
 
 		 312 aa  202  6e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>