More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2424 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2383  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 308 aa  600  1e-170  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0196795  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2424  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 308 aa  600  1e-170  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0902213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2430  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 308 aa  600  1e-170  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119113  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3730  methionyl-tRNA formyltransferase  77.81 
 
 		 310 aa  442  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.132882  normal  0.0191381 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2687  methionyl-tRNA formyltransferase  75.82 
 
 		 310 aa  443  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11435  methionyl-tRNA formyltransferase  75.24 
 
 		 312 aa  432  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.682601  normal  0.406209 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15680  methionyl-tRNA formyltransferase  65.78 
 
 		 307 aa  361  8e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.153254  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1368  methionyl-tRNA formyltransferase  64.69 
 
 		 309 aa  361  9e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0580352 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2825  methionyl-tRNA formyltransferase  64.12 
 
 		 309 aa  360  1e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5224  methionyl-tRNA formyltransferase  62.83 
 
 		 310 aa  350  1e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373009  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2567  methionyl-tRNA formyltransferase  62.75 
 
 		 311 aa  343  2e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296174  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2575  methionyl-tRNA formyltransferase  60.54 
 
 		 308 aa  342  2.9999999999999997e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0532653 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2350  methionyl-tRNA formyltransferase  63.07 
 
 		 313 aa  342  5.999999999999999e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167189  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2442  methionyl-tRNA formyltransferase  60.06 
 
 		 316 aa  335  5e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0870633  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1719  methionyl-tRNA formyltransferase  60.73 
 
 		 311 aa  332  4e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.296625  hitchhiker  0.00236307 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3000  methionyl-tRNA formyltransferase  61.06 
 
 		 308 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0437614  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18090  methionyl-tRNA formyltransferase  60.91 
 
 		 315 aa  329  4e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.783991  normal  0.456867 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1855  methionyl-tRNA formyltransferase  60.93 
 
 		 319 aa  329  5.0000000000000004e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1017  normal  0.411821 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1075  methionyl-tRNA formyltransferase  62.58 
 
 		 310 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0107606  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3190  methionyl-tRNA formyltransferase  57.55 
 
 		 337 aa  326  3e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000305844  normal  0.338989 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1278  methionyl-tRNA formyltransferase  58.49 
 
 		 324 aa  322  5e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0156282  normal  0.148843 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3099  methionyl-tRNA formyltransferase  57.74 
 
 		 315 aa  319  3e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1869  methionyl-tRNA formyltransferase  56.91 
 
 		 308 aa  315  7e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.573172 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2048  methionyl-tRNA formyltransferase  56.77 
 
 		 311 aa  314  9.999999999999999e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0469723 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1862  methionyl-tRNA formyltransferase  56.62 
 
 		 308 aa  314  9.999999999999999e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3119  methionyl-tRNA formyltransferase  59.4 
 
 		 309 aa  309  4e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4156  methionyl-tRNA formyltransferase  57 
 
 		 307 aa  308  6.999999999999999e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.413206  hitchhiker  0.00887894 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0854  methionyl-tRNA formyltransferase  56.44 
 
 		 311 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0108509  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2984  methionyl-tRNA formyltransferase  59.33 
 
 		 306 aa  307  1.0000000000000001e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12770  methionyl-tRNA formyltransferase  52.91 
 
 		 336 aa  304  2.0000000000000002e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.348945  normal  0.0208178 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1722  methionyl-tRNA formyltransferase  57.88 
 
 		 318 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.000240612  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1313  methionyl-tRNA formyltransferase  55.34 
 
 		 311 aa  288  6e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.141722 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1671  methionyl-tRNA formyltransferase  54.52 
 
 		 306 aa  273  3e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.563662  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1665  methionyl-tRNA formyltransferase  50.84 
 
 		 306 aa  267  1e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000612853 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16130  methionyl-tRNA formyltransferase  50.32 
 
 		 317 aa  267  2e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.452628  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1966  methionyl-tRNA formyltransferase  44.92 
 
 		 328 aa  251  7e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.417449  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0899  methionyl-tRNA formyltransferase  44.83 
 
 		 327 aa  230  2e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10800  methionyl-tRNA formyltransferase  45.78 
 
 		 366 aa  208  9e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0126989  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  43.23 
 
 		 318 aa  206  4e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  42.72 
 
 		 314 aa  203  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  41.08 
 
 		 312 aa  202  4e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  44.85 
 
 		 297 aa  202  7e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  43.58 
 
 		 308 aa  199  5e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  42.52 
 
 		 310 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_002620  TC0817  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04056  methionyl-tRNA formyltransferase  43.56 
 
 		 307 aa  195  7e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  42.52 
 
 		 310 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  38.74 
 
 		 314 aa  194  1e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  41.51 
 
 		 319 aa  195  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  39.8 
 
 		 312 aa  194  1e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  41.2 
 
 		 301 aa  194  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1928  methionyl-tRNA formyltransferase  43.09 
 
 		 307 aa  194  2e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  43.32 
 
 		 310 aa  193  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  42.9 
 
 		 314 aa  194  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0074  methionyl-tRNA formyltransferase  38.51 
 
 		 321 aa  194  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  42.52 
 
 		 310 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  38.41 
 
 		 311 aa  194  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  42.52 
 
 		 310 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0018  methionyl-tRNA formyltransferase  42.38 
 
 		 314 aa  192  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  39.38 
 
 		 320 aa  192  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  42.9 
 
 		 307 aa  192  5e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3177  methionyl-tRNA formyltransferase  33.12 
 
 		 315 aa  191  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000345004  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  37.17 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  41.39 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  38.85 
 
 		 315 aa  190  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  40.07 
 
 		 315 aa  190  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  36.81 
 
 		 312 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0943  methionyl-tRNA formyltransferase  42.56 
 
 		 326 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1864  methionyl-tRNA formyltransferase  42.12 
 
 		 307 aa  189  4e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  37.5 
 
 		 315 aa  189  5e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  38.74 
 
 		 314 aa  189  5e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  40.98 
 
 		 311 aa  188  8e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4748  methionyl-tRNA formyltransferase  42.53 
 
 		 310 aa  188  8e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130868  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  37.42 
 
 		 314 aa  188  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0497  methionyl-tRNA formyltransferase  43.28 
 
 		 317 aa  188  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.12463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00392  methionyl-tRNA formyltransferase  38.85 
 
 		 315 aa  187  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  40.19 
 
 		 318 aa  187  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  38.51 
 
 		 319 aa  187  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0393  methionyl-tRNA formyltransferase  42.16 
 
 		 311 aa  187  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2474  methionyl-tRNA formyltransferase  39.14 
 
 		 315 aa  187  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  41.08 
 
 		 324 aa  187  3e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  40.54 
 
 		 315 aa  186  4e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  40.54 
 
 		 315 aa  186  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2040  methionyl-tRNA formyltransferase  39.81 
 
 		 369 aa  186  4e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  40.54 
 
 		 315 aa  186  4e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  40.54 
 
 		 315 aa  186  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  40.54 
 
 		 315 aa  186  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  39.4 
 
 		 315 aa  186  5e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  37.95 
 
 		 317 aa  186  6e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  40.2 
 
 		 310 aa  185  7e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  40.2 
 
 		 315 aa  185  8e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  40.2 
 
 		 315 aa  185  8e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1439  methionyl-tRNA formyltransferase  36.04 
 
 		 314 aa  185  8e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  39.86 
 
 		 315 aa  185  9e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  39.86 
 
 		 315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1275  methionyl-tRNA formyltransferase  36.75 
 
 		 311 aa  184  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  41.39 
 
 		 310 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1300  methionyl-tRNA formyltransferase  36.75 
 
 		 311 aa  184  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247026  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  38.85 
 
 		 315 aa  185  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  38.03 
 
 		 309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0547193  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>