More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2687 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2687  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 
310 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225803  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3730  methionyl-tRNA formyltransferase  87.74 
 
 
310 aa  513  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.132882  normal  0.0191381 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2424  methionyl-tRNA formyltransferase  75.82 
 
 
308 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0902213  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2383  methionyl-tRNA formyltransferase  75.82 
 
 
308 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0196795  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2430  methionyl-tRNA formyltransferase  75.82 
 
 
308 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119113  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11435  methionyl-tRNA formyltransferase  72.88 
 
 
312 aa  421  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.682601  normal  0.406209 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2350  methionyl-tRNA formyltransferase  65.26 
 
 
313 aa  369  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167189  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15680  methionyl-tRNA formyltransferase  62.25 
 
 
307 aa  365  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.153254  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2442  methionyl-tRNA formyltransferase  63.61 
 
 
316 aa  358  5e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0870633  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2825  methionyl-tRNA formyltransferase  61.26 
 
 
309 aa  356  2.9999999999999997e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1368  methionyl-tRNA formyltransferase  61.11 
 
 
309 aa  355  3.9999999999999996e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0580352 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3000  methionyl-tRNA formyltransferase  61.89 
 
 
308 aa  349  3e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0437614  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5224  methionyl-tRNA formyltransferase  59.87 
 
 
310 aa  348  9e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373009  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1855  methionyl-tRNA formyltransferase  61.72 
 
 
319 aa  341  9e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1017  normal  0.411821 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3190  methionyl-tRNA formyltransferase  58.26 
 
 
337 aa  341  1e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000305844  normal  0.338989 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1719  methionyl-tRNA formyltransferase  59.74 
 
 
311 aa  339  2.9999999999999998e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.296625  hitchhiker  0.00236307 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1862  methionyl-tRNA formyltransferase  58.75 
 
 
308 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1869  methionyl-tRNA formyltransferase  58.42 
 
 
308 aa  336  2.9999999999999997e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.573172 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2575  methionyl-tRNA formyltransferase  59.67 
 
 
308 aa  336  2.9999999999999997e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0532653 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2567  methionyl-tRNA formyltransferase  60.13 
 
 
311 aa  336  3.9999999999999995e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296174  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3099  methionyl-tRNA formyltransferase  59.35 
 
 
315 aa  335  3.9999999999999995e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18090  methionyl-tRNA formyltransferase  61.36 
 
 
315 aa  332  4e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.783991  normal  0.456867 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1278  methionyl-tRNA formyltransferase  57.55 
 
 
324 aa  328  8e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0156282  normal  0.148843 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0854  methionyl-tRNA formyltransferase  56.09 
 
 
311 aa  325  4.0000000000000003e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0108509  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3119  methionyl-tRNA formyltransferase  59.87 
 
 
309 aa  324  1e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1075  methionyl-tRNA formyltransferase  60.4 
 
 
310 aa  322  4e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0107606  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4156  methionyl-tRNA formyltransferase  56.62 
 
 
307 aa  317  2e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.413206  hitchhiker  0.00887894 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2984  methionyl-tRNA formyltransferase  57.62 
 
 
306 aa  315  7e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1722  methionyl-tRNA formyltransferase  56.59 
 
 
318 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.000240612  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12770  methionyl-tRNA formyltransferase  52.13 
 
 
336 aa  303  3.0000000000000004e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.348945  normal  0.0208178 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2048  methionyl-tRNA formyltransferase  55.12 
 
 
311 aa  303  3.0000000000000004e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0469723 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1665  methionyl-tRNA formyltransferase  52 
 
 
306 aa  286  4e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000612853 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16130  methionyl-tRNA formyltransferase  49.35 
 
 
317 aa  285  5e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.452628  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1671  methionyl-tRNA formyltransferase  54.67 
 
 
306 aa  283  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.563662  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1313  methionyl-tRNA formyltransferase  54.69 
 
 
311 aa  279  5e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.141722 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1966  methionyl-tRNA formyltransferase  43.3 
 
 
328 aa  241  1e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.417449  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0899  methionyl-tRNA formyltransferase  45.89 
 
 
327 aa  238  1e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  39.8 
 
 
312 aa  208  7e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  40.86 
 
 
312 aa  206  4e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10800  methionyl-tRNA formyltransferase  44.16 
 
 
366 aa  202  7e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0126989  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  42.42 
 
 
308 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4748  methionyl-tRNA formyltransferase  42.53 
 
 
310 aa  199  5e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130868  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  38.69 
 
 
311 aa  198  9e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  39.19 
 
 
319 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  39.37 
 
 
318 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  40.59 
 
 
301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  40.79 
 
 
297 aa  197  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  40.54 
 
 
324 aa  195  7e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  42.39 
 
 
310 aa  195  9e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3304  methionyl-tRNA formyltransferase  44.08 
 
 
307 aa  194  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0607232  normal  0.664052 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0074  methionyl-tRNA formyltransferase  38.67 
 
 
321 aa  194  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  41.58 
 
 
314 aa  193  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  38.49 
 
 
315 aa  193  3e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  37.29 
 
 
314 aa  192  5e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  39.02 
 
 
317 aa  192  6e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  38.36 
 
 
313 aa  192  7e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4814  methionyl-tRNA formyltransferase  38.46 
 
 
297 aa  192  7e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223084  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  39.54 
 
 
310 aa  191  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  39.8 
 
 
314 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  39.14 
 
 
302 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  38.38 
 
 
312 aa  190  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1053  methionyl-tRNA formyltransferase  38.06 
 
 
312 aa  191  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0943  methionyl-tRNA formyltransferase  37.29 
 
 
326 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  40.13 
 
 
315 aa  189  7e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  36.27 
 
 
312 aa  188  8e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  37.62 
 
 
315 aa  189  8e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  38.85 
 
 
318 aa  188  9e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0875  methionyl-tRNA formyltransferase  37.94 
 
 
302 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  40.4 
 
 
310 aa  188  1e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2535  methionyl-tRNA formyltransferase  38.26 
 
 
302 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.614949  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  40.26 
 
 
319 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  38.89 
 
 
315 aa  187  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  40.85 
 
 
315 aa  187  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  38.89 
 
 
315 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  38.85 
 
 
318 aa  187  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  38.89 
 
 
315 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2474  methionyl-tRNA formyltransferase  37.83 
 
 
315 aa  187  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  36.3 
 
 
314 aa  186  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  38.89 
 
 
314 aa  187  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  36.27 
 
 
311 aa  186  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  39.47 
 
 
310 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  36.51 
 
 
311 aa  186  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0817  methionyl-tRNA formyltransferase  36.39 
 
 
316 aa  186  5e-46  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  38.51 
 
 
318 aa  186  5e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  37.84 
 
 
318 aa  186  5e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3147  methionyl-tRNA formyltransferase  42.07 
 
 
313 aa  186  6e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  0.377579 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0975  methionyl-tRNA formyltransferase  40.32 
 
 
306 aa  185  7e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.569216  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  35.39 
 
 
310 aa  185  8e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  33.99 
 
 
311 aa  185  9e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  39.47 
 
 
310 aa  185  9e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0497  methionyl-tRNA formyltransferase  41.78 
 
 
317 aa  185  9e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.12463  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  38.18 
 
 
318 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  39.8 
 
 
310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  37.26 
 
 
320 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1034  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 
306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.79271  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  39.14 
 
 
310 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3920  methionyl-tRNA formyltransferase  38.94 
 
 
325 aa  183  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2582  methionyl-tRNA formyltransferase  38.54 
 
 
328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0097642  normal  0.0138205 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04056  methionyl-tRNA formyltransferase  40.46 
 
 
307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1928  methionyl-tRNA formyltransferase  40.33 
 
 
307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>