More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3730 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3730  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 310 aa  607  1e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.132882  normal  0.0191381 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2687  methionyl-tRNA formyltransferase  87.74 
 
 		 310 aa  513  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2424  methionyl-tRNA formyltransferase  77.81 
 
 		 308 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0902213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2383  methionyl-tRNA formyltransferase  77.81 
 
 		 308 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0196795  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2430  methionyl-tRNA formyltransferase  77.81 
 
 		 308 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119113  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11435  methionyl-tRNA formyltransferase  71.06 
 
 		 312 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.682601  normal  0.406209 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15680  methionyl-tRNA formyltransferase  63.61 
 
 		 307 aa  363  2e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.153254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2825  methionyl-tRNA formyltransferase  62.66 
 
 		 309 aa  362  3e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2442  methionyl-tRNA formyltransferase  62.95 
 
 		 316 aa  352  5.9999999999999994e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0870633  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1368  methionyl-tRNA formyltransferase  61.72 
 
 		 309 aa  344  8.999999999999999e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0580352 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1855  methionyl-tRNA formyltransferase  63.49 
 
 		 319 aa  343  2e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1017  normal  0.411821 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5224  methionyl-tRNA formyltransferase  61.51 
 
 		 310 aa  342  4e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373009  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3000  methionyl-tRNA formyltransferase  61.31 
 
 		 308 aa  341  9e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0437614  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2350  methionyl-tRNA formyltransferase  62.34 
 
 		 313 aa  340  1e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167189  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2575  methionyl-tRNA formyltransferase  59.34 
 
 		 308 aa  338  5.9999999999999996e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0532653 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2567  methionyl-tRNA formyltransferase  61.84 
 
 		 311 aa  338  7e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296174  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3190  methionyl-tRNA formyltransferase  58.99 
 
 		 337 aa  333  2e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000305844  normal  0.338989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3099  methionyl-tRNA formyltransferase  59.35 
 
 		 315 aa  330  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18090  methionyl-tRNA formyltransferase  61.69 
 
 		 315 aa  328  7e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.783991  normal  0.456867 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1719  methionyl-tRNA formyltransferase  59.08 
 
 		 311 aa  327  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.296625  hitchhiker  0.00236307 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1862  methionyl-tRNA formyltransferase  58.28 
 
 		 308 aa  325  8.000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1075  methionyl-tRNA formyltransferase  61.04 
 
 		 310 aa  324  1e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0107606  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1278  methionyl-tRNA formyltransferase  58.68 
 
 		 324 aa  324  1e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0156282  normal  0.148843 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3119  methionyl-tRNA formyltransferase  60.87 
 
 		 309 aa  323  2e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1869  methionyl-tRNA formyltransferase  57.95 
 
 		 308 aa  323  2e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.573172 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4156  methionyl-tRNA formyltransferase  57.57 
 
 		 307 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.413206  hitchhiker  0.00887894 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0854  methionyl-tRNA formyltransferase  56.63 
 
 		 311 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0108509  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2984  methionyl-tRNA formyltransferase  58.28 
 
 		 306 aa  313  2.9999999999999996e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1722  methionyl-tRNA formyltransferase  59.35 
 
 		 318 aa  311  1e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.000240612  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2048  methionyl-tRNA formyltransferase  55.96 
 
 		 311 aa  300  1e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0469723 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12770  methionyl-tRNA formyltransferase  52.6 
 
 		 336 aa  295  5e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.348945  normal  0.0208178 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1313  methionyl-tRNA formyltransferase  54.75 
 
 		 311 aa  277  1e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.141722 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1665  methionyl-tRNA formyltransferase  50.67 
 
 		 306 aa  272  6e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000612853 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1671  methionyl-tRNA formyltransferase  53.67 
 
 		 306 aa  268  8.999999999999999e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.563662  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16130  methionyl-tRNA formyltransferase  49.17 
 
 		 317 aa  263  2e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.452628  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1966  methionyl-tRNA formyltransferase  44.69 
 
 		 328 aa  248  1e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.417449  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0899  methionyl-tRNA formyltransferase  46.98 
 
 		 327 aa  245  8e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10800  methionyl-tRNA formyltransferase  46.1 
 
 		 366 aa  209  6e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0126989  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  37.5 
 
 		 314 aa  204  1e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  36.51 
 
 		 314 aa  199  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  42.09 
 
 		 308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0074  methionyl-tRNA formyltransferase  38.38 
 
 		 321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  40.54 
 
 		 324 aa  197  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  39.93 
 
 		 315 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  39.93 
 
 		 315 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  39.93 
 
 		 315 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  42 
 
 		 297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  38.87 
 
 		 312 aa  195  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  41.2 
 
 		 310 aa  193  3e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4748  methionyl-tRNA formyltransferase  41.56 
 
 		 310 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130868  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  39.54 
 
 		 313 aa  192  7e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  39.14 
 
 		 315 aa  192  7e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  36.79 
 
 		 312 aa  191  1e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  39.53 
 
 		 318 aa  191  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  38.61 
 
 		 315 aa  191  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  39.74 
 
 		 310 aa  190  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  40.73 
 
 		 301 aa  191  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2474  methionyl-tRNA formyltransferase  38.82 
 
 		 315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4228  methionyl-tRNA formyltransferase  40.46 
 
 		 312 aa  190  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  40.57 
 
 		 310 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  39.53 
 
 		 318 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  39.53 
 
 		 318 aa  189  8e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  39.93 
 
 		 314 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  39.19 
 
 		 318 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  35.62 
 
 		 312 aa  187  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  38.85 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  39.33 
 
 		 311 aa  187  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  39.19 
 
 		 319 aa  187  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  41.75 
 
 		 318 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  39.19 
 
 		 318 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188499 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  39.27 
 
 		 315 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  39.27 
 
 		 315 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  39.27 
 
 		 315 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  39.27 
 
 		 315 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  37.95 
 
 		 311 aa  186  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0943  methionyl-tRNA formyltransferase  37.5 
 
 		 326 aa  186  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  37.05 
 
 		 311 aa  186  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  36.63 
 
 		 311 aa  186  6e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  39.39 
 
 		 318 aa  186  6e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1053  methionyl-tRNA formyltransferase  38.69 
 
 		 312 aa  185  8e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  40.66 
 
 		 314 aa  185  9e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  39.73 
 
 		 318 aa  185  9e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  38.94 
 
 		 315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1928  methionyl-tRNA formyltransferase  40.32 
 
 		 307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  39.14 
 
 		 310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  39.39 
 
 		 315 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  37.95 
 
 		 314 aa  184  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  39.41 
 
 		 315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  39.41 
 
 		 315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  39.41 
 
 		 315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  38.85 
 
 		 318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  39.41 
 
 		 315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  38.61 
 
 		 315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  38.82 
 
 		 313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  40.07 
 
 		 321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  39.41 
 
 		 315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  39.73 
 
 		 318 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  34.98 
 
 		 317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  39.6 
 
 		 319 aa  183  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  39.93 
 
 		 310 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>