More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3000 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3000  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 308 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0437614  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1368  methionyl-tRNA formyltransferase  76.14 
 
 		 309 aa  457  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0580352 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1075  methionyl-tRNA formyltransferase  75.91 
 
 		 310 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0107606  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2825  methionyl-tRNA formyltransferase  72.73 
 
 		 309 aa  442  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0854  methionyl-tRNA formyltransferase  71.52 
 
 		 311 aa  434  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0108509  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3099  methionyl-tRNA formyltransferase  66.03 
 
 		 315 aa  412  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2442  methionyl-tRNA formyltransferase  67.99 
 
 		 316 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0870633  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1869  methionyl-tRNA formyltransferase  64.82 
 
 		 308 aa  402  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.573172 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1862  methionyl-tRNA formyltransferase  65.8 
 
 		 308 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1719  methionyl-tRNA formyltransferase  71.52 
 
 		 311 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.296625  hitchhiker  0.00236307 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15680  methionyl-tRNA formyltransferase  67 
 
 		 307 aa  392  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.153254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1278  methionyl-tRNA formyltransferase  64.98 
 
 		 324 aa  392  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0156282  normal  0.148843 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5224  methionyl-tRNA formyltransferase  67.66 
 
 		 310 aa  388  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373009  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2575  methionyl-tRNA formyltransferase  61.89 
 
 		 308 aa  381  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0532653 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3190  methionyl-tRNA formyltransferase  62.35 
 
 		 337 aa  374  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000305844  normal  0.338989 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3119  methionyl-tRNA formyltransferase  63.39 
 
 		 309 aa  373  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2984  methionyl-tRNA formyltransferase  62.75 
 
 		 306 aa  366  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1855  methionyl-tRNA formyltransferase  62.88 
 
 		 319 aa  355  6.999999999999999e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1017  normal  0.411821 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1722  methionyl-tRNA formyltransferase  62.82 
 
 		 318 aa  354  8.999999999999999e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.000240612  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18090  methionyl-tRNA formyltransferase  63.07 
 
 		 315 aa  352  4e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.783991  normal  0.456867 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2687  methionyl-tRNA formyltransferase  61.89 
 
 		 310 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4156  methionyl-tRNA formyltransferase  60.4 
 
 		 307 aa  332  5e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.413206  hitchhiker  0.00887894 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2567  methionyl-tRNA formyltransferase  60.74 
 
 		 311 aa  332  5e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296174  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3730  methionyl-tRNA formyltransferase  61.31 
 
 		 310 aa  328  9e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.132882  normal  0.0191381 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12770  methionyl-tRNA formyltransferase  55.29 
 
 		 336 aa  325  8.000000000000001e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.348945  normal  0.0208178 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2350  methionyl-tRNA formyltransferase  56.41 
 
 		 313 aa  324  1e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167189  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2424  methionyl-tRNA formyltransferase  61.06 
 
 		 308 aa  317  1e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0902213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2383  methionyl-tRNA formyltransferase  61.06 
 
 		 308 aa  317  1e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0196795  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2430  methionyl-tRNA formyltransferase  61.06 
 
 		 308 aa  317  1e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119113  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1665  methionyl-tRNA formyltransferase  54.52 
 
 		 306 aa  317  2e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000612853 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1671  methionyl-tRNA formyltransferase  57.05 
 
 		 306 aa  313  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.563662  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11435  methionyl-tRNA formyltransferase  57.7 
 
 		 312 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.682601  normal  0.406209 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1313  methionyl-tRNA formyltransferase  56.41 
 
 		 311 aa  309  4e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.141722 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2048  methionyl-tRNA formyltransferase  54.9 
 
 		 311 aa  308  8e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0469723 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16130  methionyl-tRNA formyltransferase  52.3 
 
 		 317 aa  302  5.000000000000001e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.452628  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1966  methionyl-tRNA formyltransferase  46.01 
 
 		 328 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.417449  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0899  methionyl-tRNA formyltransferase  46.69 
 
 		 327 aa  240  2.9999999999999997e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  40.66 
 
 		 312 aa  236  3e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4814  methionyl-tRNA formyltransferase  43.1 
 
 		 297 aa  236  4e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  42.67 
 
 		 301 aa  233  4.0000000000000004e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  42.12 
 
 		 311 aa  232  6e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  43.28 
 
 		 307 aa  231  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  38.41 
 
 		 310 aa  231  1e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  41.95 
 
 		 312 aa  231  1e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1490  methionyl-tRNA formyltransferase  41.21 
 
 		 316 aa  230  2e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  45.03 
 
 		 318 aa  230  3e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10800  methionyl-tRNA formyltransferase  46.43 
 
 		 366 aa  230  3e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0126989  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  40.2 
 
 		 314 aa  227  2e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  39.86 
 
 		 314 aa  226  3e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  43.19 
 
 		 302 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  40.73 
 
 		 317 aa  223  4e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  40.4 
 
 		 318 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  44.55 
 
 		 297 aa  222  4.9999999999999996e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2535  methionyl-tRNA formyltransferase  42.57 
 
 		 302 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.614949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  38.96 
 
 		 313 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  40.73 
 
 		 318 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1221  methionyl-tRNA formyltransferase  41.31 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.820089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0181  methionyl-tRNA formyltransferase  43.52 
 
 		 299 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.142178  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  43.19 
 
 		 308 aa  219  3e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  44.07 
 
 		 319 aa  220  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0875  methionyl-tRNA formyltransferase  42.24 
 
 		 302 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  44.7 
 
 		 310 aa  219  3.9999999999999997e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  43.52 
 
 		 359 aa  218  7e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  40.07 
 
 		 311 aa  218  7e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  41.8 
 
 		 320 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  45.2 
 
 		 314 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0021  methionyl-tRNA formyltransferase  45.64 
 
 		 313 aa  216  4e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.223082 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0020  methionyl-tRNA formyltransferase  45.64 
 
 		 313 aa  216  4e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1231  methionyl-tRNA formyltransferase  38.56 
 
 		 314 aa  216  4e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000178496  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2577  methionyl-tRNA formyltransferase  42.86 
 
 		 308 aa  216  5e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  hitchhiker  0.000000800769 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1928  methionyl-tRNA formyltransferase  44.3 
 
 		 307 aa  215  8e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3920  methionyl-tRNA formyltransferase  42.76 
 
 		 325 aa  215  9e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  45.9 
 
 		 310 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0074  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 321 aa  214  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  40.34 
 
 		 312 aa  214  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 315 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 315 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  40.58 
 
 		 311 aa  213  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  40 
 
 		 315 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 315 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  45.48 
 
 		 307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 315 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  38.21 
 
 		 312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  41.14 
 
 		 311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  42.71 
 
 		 310 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  39.66 
 
 		 315 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 315 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  39.27 
 
 		 315 aa  212  5.999999999999999e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  42.71 
 
 		 310 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1053  methionyl-tRNA formyltransferase  41.83 
 
 		 312 aa  211  9e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3225  methionyl-tRNA formyltransferase  42.11 
 
 		 313 aa  211  9e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0188786 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 313 aa  211  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  35.86 
 
 		 311 aa  211  1e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4042  methionyl-tRNA formyltransferase  43.05 
 
 		 308 aa  211  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  42.37 
 
 		 310 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1864  methionyl-tRNA formyltransferase  43.29 
 
 		 307 aa  211  1e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  39.8 
 
 		 311 aa  211  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  39.19 
 
 		 314 aa  210  2e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2232  methionyl-tRNA formyltransferase  39.8 
 
 		 313 aa  210  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>