More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0858 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 311 aa  620  1e-177  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  57.93 
 
 		 359 aa  350  1e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  54.66 
 
 		 317 aa  335  7.999999999999999e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  55.45 
 
 		 311 aa  319  5e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  51.94 
 
 		 318 aa  318  6e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0513  methionyl-tRNA formyltransferase  54.55 
 
 		 319 aa  318  9e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  51.94 
 
 		 318 aa  316  3e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  53.05 
 
 		 315 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2313  methionyl-tRNA formyltransferase  51.99 
 
 		 312 aa  309  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490925  hitchhiker  0.0006759 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  51.61 
 
 		 317 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  50.97 
 
 		 311 aa  306  3e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  50.32 
 
 		 316 aa  305  7e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  47.59 
 
 		 311 aa  301  7.000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  49.03 
 
 		 313 aa  300  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  48.55 
 
 		 310 aa  296  2e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1231  methionyl-tRNA formyltransferase  48.08 
 
 		 314 aa  296  4e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000178496  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  44.59 
 
 		 312 aa  292  6e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2549  methionyl-tRNA formyltransferase  51.77 
 
 		 320 aa  289  4e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31631  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  47.44 
 
 		 308 aa  281  1e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823971 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0148  methionyl-tRNA formyltransferase  50.33 
 
 		 305 aa  276  4e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.576123 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  44.23 
 
 		 314 aa  274  1.0000000000000001e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  44.23 
 
 		 314 aa  274  1.0000000000000001e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09900  methionyl-tRNA formyltransferase  46.37 
 
 		 316 aa  273  3e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1714  methionyl-tRNA formyltransferase  46.13 
 
 		 309 aa  270  2e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  46.3 
 
 		 320 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  46.49 
 
 		 312 aa  269  5.9999999999999995e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1996  methionyl-tRNA formyltransferase  45.81 
 
 		 309 aa  267  1e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1176  methionyl-tRNA formyltransferase  41.67 
 
 		 309 aa  267  1e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0139658  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  45.67 
 
 		 318 aa  267  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  47.16 
 
 		 318 aa  267  2e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2491  methionyl-tRNA formyltransferase  43.35 
 
 		 319 aa  265  5e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1221  methionyl-tRNA formyltransferase  46.03 
 
 		 304 aa  265  8.999999999999999e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.820089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2582  methionyl-tRNA formyltransferase  46.95 
 
 		 328 aa  264  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0097642  normal  0.0138205 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0393  methionyl-tRNA formyltransferase  46.23 
 
 		 312 aa  262  4e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.894516  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3177  methionyl-tRNA formyltransferase  42.86 
 
 		 315 aa  263  4e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000345004  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1953  methionyl-tRNA formyltransferase  47.49 
 
 		 319 aa  261  8e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  45.57 
 
 		 307 aa  261  1e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4228  methionyl-tRNA formyltransferase  50.49 
 
 		 312 aa  261  1e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  46 
 
 		 308 aa  260  2e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0094  methionyl-tRNA formyltransferase  47.51 
 
 		 320 aa  260  2e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.922112  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2232  methionyl-tRNA formyltransferase  45.33 
 
 		 313 aa  260  2e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  43.05 
 
 		 311 aa  260  3e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0943  methionyl-tRNA formyltransferase  44.55 
 
 		 326 aa  259  4e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3398  methionyl-tRNA formyltransferase  46.89 
 
 		 323 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.726388  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4053  methionyl-tRNA formyltransferase  46.89 
 
 		 323 aa  258  6e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3689  methionyl-tRNA formyltransferase  43.27 
 
 		 314 aa  256  3e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1439  methionyl-tRNA formyltransferase  45.39 
 
 		 314 aa  256  3e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6485  methionyl-tRNA formyltransferase  44.22 
 
 		 315 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.53373  normal  0.520037 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  42.31 
 
 		 314 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  42.05 
 
 		 309 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0547193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0015  methionyl-tRNA formyltransferase  48.72 
 
 		 309 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.229268 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1040  methionyl-tRNA formyltransferase  45.51 
 
 		 309 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3859  methionyl-tRNA formyltransferase  45.45 
 
 		 323 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0782  methionyl-tRNA formyltransferase  44.66 
 
 		 310 aa  252  5.000000000000001e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.606283  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  42.81 
 
 		 312 aa  252  6e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  47.87 
 
 		 310 aa  251  9.000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  43.48 
 
 		 311 aa  251  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3914  methionyl-tRNA formyltransferase  42.63 
 
 		 314 aa  250  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00718662  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1334  methionyl-tRNA formyltransferase  41.45 
 
 		 313 aa  249  3e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0783821  normal  0.599523 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3717  methionyl-tRNA formyltransferase  42.31 
 
 		 314 aa  249  4e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00223065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3625  methionyl-tRNA formyltransferase  42.31 
 
 		 314 aa  249  4e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000492096  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4004  methionyl-tRNA formyltransferase  42.31 
 
 		 314 aa  249  4e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3880  methionyl-tRNA formyltransferase  42.31 
 
 		 314 aa  249  4e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43125e-17 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1275  methionyl-tRNA formyltransferase  42.72 
 
 		 311 aa  248  6e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1300  methionyl-tRNA formyltransferase  42.72 
 
 		 311 aa  248  6e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247026  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2084  methionyl-tRNA formyltransferase  46.18 
 
 		 311 aa  247  1e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198796  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  45.02 
 
 		 314 aa  247  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3607  methionyl-tRNA formyltransferase  41.85 
 
 		 314 aa  247  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  50.52 
 
 		 312 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.159164  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1278  methionyl-tRNA formyltransferase  41.85 
 
 		 314 aa  246  3e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.289128 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4113  methionyl-tRNA formyltransferase  50 
 
 		 312 aa  246  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195925  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3965  methionyl-tRNA formyltransferase  41.85 
 
 		 314 aa  246  4e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  44.05 
 
 		 314 aa  246  4e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  43.67 
 
 		 315 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  43.67 
 
 		 315 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  43.67 
 
 		 315 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  43.67 
 
 		 315 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  43.67 
 
 		 315 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3948  methionyl-tRNA formyltransferase  45.37 
 
 		 334 aa  245  6e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0597  methionyl-tRNA formyltransferase  45.33 
 
 		 309 aa  245  6.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.411489  normal  0.365023 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  43.33 
 
 		 315 aa  245  6.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3354  methionyl-tRNA formyltransferase  43.48 
 
 		 327 aa  245  8e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3015  methionyl-tRNA formyltransferase  44.98 
 
 		 323 aa  245  9e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1928  methionyl-tRNA formyltransferase  46.56 
 
 		 307 aa  244  9.999999999999999e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4638  methionyl-tRNA formyltransferase  44.06 
 
 		 357 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.857325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  43 
 
 		 315 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1864  methionyl-tRNA formyltransferase  46.23 
 
 		 307 aa  243  3e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0972  methionyl-tRNA formyltransferase  44.01 
 
 		 314 aa  243  3.9999999999999997e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.319816  normal  0.276171 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  43.41 
 
 		 310 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  43.33 
 
 		 315 aa  242  6e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  43.41 
 
 		 310 aa  242  7e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0036  methionyl-tRNA formyltransferase  43.51 
 
 		 327 aa  242  7e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  43.09 
 
 		 310 aa  242  7e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  43 
 
 		 315 aa  241  1e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3677  methionyl-tRNA formyltransferase  42.86 
 
 		 327 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04056  methionyl-tRNA formyltransferase  45.9 
 
 		 307 aa  241  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4080  methionyl-tRNA formyltransferase  49.66 
 
 		 312 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.67477  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0018  methionyl-tRNA formyltransferase  43.73 
 
 		 314 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0020  methionyl-tRNA formyltransferase  42.86 
 
 		 322 aa  240  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  43.09 
 
 		 310 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>