More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1966 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1966  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 328 aa  659    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.417449  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0899  methionyl-tRNA formyltransferase  57.93 
 
 		 327 aa  343  2e-93  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18090  methionyl-tRNA formyltransferase  49.54 
 
 		 315 aa  291  1e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.783991  normal  0.456867 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2442  methionyl-tRNA formyltransferase  48.14 
 
 		 316 aa  278  9e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0870633  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1368  methionyl-tRNA formyltransferase  46.32 
 
 		 309 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0580352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1869  methionyl-tRNA formyltransferase  48.14 
 
 		 308 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.573172 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1862  methionyl-tRNA formyltransferase  46.32 
 
 		 308 aa  265  8e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1313  methionyl-tRNA formyltransferase  47.98 
 
 		 311 aa  264  1e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.141722 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3190  methionyl-tRNA formyltransferase  46.04 
 
 		 337 aa  265  1e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000305844  normal  0.338989 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1722  methionyl-tRNA formyltransferase  48.29 
 
 		 318 aa  263  2e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.000240612  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2825  methionyl-tRNA formyltransferase  45.94 
 
 		 309 aa  263  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5224  methionyl-tRNA formyltransferase  44.95 
 
 		 310 aa  259  4e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373009  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3000  methionyl-tRNA formyltransferase  46.01 
 
 		 308 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0437614  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2048  methionyl-tRNA formyltransferase  46.89 
 
 		 311 aa  256  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0469723 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12770  methionyl-tRNA formyltransferase  45.76 
 
 		 336 aa  257  2e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.348945  normal  0.0208178 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15680  methionyl-tRNA formyltransferase  45.37 
 
 		 307 aa  255  6e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.153254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4156  methionyl-tRNA formyltransferase  45.35 
 
 		 307 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.413206  hitchhiker  0.00887894 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2575  methionyl-tRNA formyltransferase  46.58 
 
 		 308 aa  253  4.0000000000000004e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0532653 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0854  methionyl-tRNA formyltransferase  45.37 
 
 		 311 aa  250  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0108509  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1278  methionyl-tRNA formyltransferase  45.62 
 
 		 324 aa  250  2e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0156282  normal  0.148843 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16130  methionyl-tRNA formyltransferase  44.48 
 
 		 317 aa  249  3e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.452628  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2984  methionyl-tRNA formyltransferase  46.13 
 
 		 306 aa  249  6e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1855  methionyl-tRNA formyltransferase  45.29 
 
 		 319 aa  248  8e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1017  normal  0.411821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3099  methionyl-tRNA formyltransferase  45.85 
 
 		 315 aa  247  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2350  methionyl-tRNA formyltransferase  46.11 
 
 		 313 aa  246  3e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167189  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1671  methionyl-tRNA formyltransferase  46.37 
 
 		 306 aa  241  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.563662  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1719  methionyl-tRNA formyltransferase  43.3 
 
 		 311 aa  239  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.296625  hitchhiker  0.00236307 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2424  methionyl-tRNA formyltransferase  44.92 
 
 		 308 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0902213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2383  methionyl-tRNA formyltransferase  44.92 
 
 		 308 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0196795  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1665  methionyl-tRNA formyltransferase  44.79 
 
 		 306 aa  238  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000612853 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2430  methionyl-tRNA formyltransferase  44.92 
 
 		 308 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119113  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1075  methionyl-tRNA formyltransferase  44.04 
 
 		 310 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0107606  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3730  methionyl-tRNA formyltransferase  44.69 
 
 		 310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.132882  normal  0.0191381 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3119  methionyl-tRNA formyltransferase  43.44 
 
 		 309 aa  233  3e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11435  methionyl-tRNA formyltransferase  44.38 
 
 		 312 aa  231  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.682601  normal  0.406209 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2687  methionyl-tRNA formyltransferase  43.3 
 
 		 310 aa  228  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  44.58 
 
 		 310 aa  223  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4748  methionyl-tRNA formyltransferase  43.08 
 
 		 310 aa  215  9e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130868  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2567  methionyl-tRNA formyltransferase  42.68 
 
 		 311 aa  213  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296174  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10800  methionyl-tRNA formyltransferase  41.14 
 
 		 366 aa  212  5.999999999999999e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0126989  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  40.37 
 
 		 315 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  40.37 
 
 		 315 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  40.37 
 
 		 315 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  40.37 
 
 		 315 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  39.44 
 
 		 315 aa  206  4e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  40.06 
 
 		 315 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1928  methionyl-tRNA formyltransferase  41.93 
 
 		 307 aa  206  4e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  39.44 
 
 		 315 aa  206  5e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  38.82 
 
 		 315 aa  206  6e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  39.13 
 
 		 315 aa  205  7e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  39.44 
 
 		 315 aa  205  8e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  39.44 
 
 		 315 aa  205  8e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  39.44 
 
 		 315 aa  205  8e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  39.44 
 
 		 315 aa  205  8e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  39.44 
 
 		 315 aa  205  8e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04056  methionyl-tRNA formyltransferase  40.99 
 
 		 307 aa  204  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1599  methionyl-tRNA formyltransferase  40.67 
 
 		 309 aa  205  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0493449 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  39.51 
 
 		 310 aa  204  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1864  methionyl-tRNA formyltransferase  41.3 
 
 		 307 aa  203  3e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3147  methionyl-tRNA formyltransferase  39.88 
 
 		 313 aa  202  5e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  0.377579 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0806  methionyl-tRNA formyltransferase  41.16 
 
 		 310 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.283838 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  39.14 
 
 		 301 aa  201  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  38.51 
 
 		 311 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  39.88 
 
 		 310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0446  methionyl-tRNA formyltransferase  39.45 
 
 		 311 aa  199  5e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1320  methionyl-tRNA formyltransferase  38.08 
 
 		 309 aa  199  5e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7336  methionyl-tRNA formyltransferase  38.58 
 
 		 311 aa  199  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.685492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2474  methionyl-tRNA formyltransferase  37.27 
 
 		 315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  38.48 
 
 		 314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  38.48 
 
 		 314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4568  methionyl-tRNA formyltransferase  45.15 
 
 		 312 aa  196  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  39.63 
 
 		 314 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1321  methionyl-tRNA formyltransferase  40.94 
 
 		 314 aa  196  7e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  37.9 
 
 		 315 aa  195  9e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  38.85 
 
 		 321 aa  195  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00392  methionyl-tRNA formyltransferase  38.54 
 
 		 315 aa  195  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  38.2 
 
 		 312 aa  194  2e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  40.25 
 
 		 318 aa  193  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0393  methionyl-tRNA formyltransferase  38.51 
 
 		 311 aa  193  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0626  methionyl-tRNA formyltransferase  39.69 
 
 		 310 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274146  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  39.01 
 
 		 320 aa  193  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  38.34 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  38.99 
 
 		 302 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0074  methionyl-tRNA formyltransferase  36.62 
 
 		 321 aa  191  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  35.91 
 
 		 315 aa  191  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4042  methionyl-tRNA formyltransferase  38.99 
 
 		 308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  37.27 
 
 		 324 aa  189  5e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  36.88 
 
 		 314 aa  189  5.999999999999999e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  38.01 
 
 		 314 aa  189  7e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1635  methionyl-tRNA formyltransferase  40.06 
 
 		 309 aa  189  7e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.138536  normal  0.117912 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0018  methionyl-tRNA formyltransferase  39.32 
 
 		 314 aa  189  8e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  39.01 
 
 		 319 aa  189  8e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  39.37 
 
 		 308 aa  188  9e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  36.34 
 
 		 312 aa  187  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0020  methionyl-tRNA formyltransferase  38.75 
 
 		 322 aa  187  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0674  methionyl-tRNA formyltransferase  38.36 
 
 		 312 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  37.5 
 
 		 315 aa  186  4e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  36.73 
 
 		 315 aa  186  4e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  37.5 
 
 		 315 aa  186  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  37.5 
 
 		 315 aa  186  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>